染色质
染色质（）旧称核染質（karyotin），是真核生物细胞分裂间期细胞核内由DNA、蛋白质（主要是组蛋白，次要为非组蛋白，非组蛋白又主要是与DNA、RNA合成有关的酶，以及少量RNA，所共同组成的线性大分子复合物，也是遗传物质的主要载体。其名源于在光学显微镜下极易被碱性染料着色的特性。 在间期细胞核中，染色质表现为去凝聚的、分散的染色质纤维（chromatin fiber，又称染色质丝）；这些细丝状纤维在核基质中交织成网状结构。染色质与染…
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基因重組
遺傳學中，基因重組（）亦稱遗传重組，是指DNA片段斷裂並且轉移位置的过程，会导致基因间或基因内新的连锁关系形成。对于真核生物，减数分裂過程中的基因重組能夠形成一套新的遺傳信息，並從親本遺傳給子代。多数基因重组是自然发生的，可以分为两种类型：(1)染色体间重组，通过位点在不同染色体上的等位基因的自由组合发生（减数分裂I中同源染色體的非姐妹染色单体上的基因自由组合）；(2)染色体内重组，通过交换发生。 在真核生物减数分裂过程中，遗传重组时同…
保守序列
的序列比对。 这些序列是蛋白质中氨基酸120-180残基。灰色高亮的残基在所有序列中高度保守。在蛋白质序列下方标注为 保守序列 ()，保守突变(:)，半保守突变 (.)，或者非保守突变( )。]] 保守序列（）在生物学中是指在核酸序列（如RNA及DNA序列）、蛋白质序列、蛋白质结构或多聚糖序列内相似或相同的序列，这种情况可以发生在各物种间（种间同源序列）或由相同生物产生的不同分子（种内同源序列）间。对于物种间保守的情况，这意味着尽管物种…
减数分裂
減數分裂（）是有性生殖生物在生殖細胞成熟過程中發生的特殊分裂方式，這種分裂使染色體數目減半，产生單倍體細胞，每條染色體源自於其親代細胞。 减数分裂是一种特殊的有丝分裂。這個過程會發生在所有有性生殖單細胞或多細胞真核生物體內，包括動物、植物以及真菌。减数分裂中精卵原细胞中的染色体先复制一次，细胞在分裂过程中连续分裂两次，最终产生四个细胞，每个染色体只有一倍遗传物质。此外，在分裂之前，来自每条染色体的父本和母本拷贝的遗传物质会交叉，在每条染…
全基因組定序
全基因組定序（whole genome sequencing，WGS）或基因组测序（genome sequencing），是利用高通量测序技术，检测并获得细胞或组织中全部基因组（常为染色体中DNA）序列的方法，亦即將一個生物的基因組完整（或接近完整）定序的流程。全基因組定序用于研究未知基因组的序列、不同个体基因组的差异等。 自1990年代起，陸續有生物的基因組被完整定序，最早被定序完成的生物為流感嗜血桿菌（1995年），1996年首次有…
偽體染色體區
的方式標記出偽體染色體區（即綠色部分），左邊為X染色體，右上為Y染色體]] 偽體染色體區（），又稱-{zh-cn:伪体染色体区;zh-tw:擬常染色體區}-，是在高等動物性染色體（即X染色體和Y染色體）上的一段同源序列，分為PAR1和PAR2兩部分，偽體染色體區上已發現至少29個基因。 偽體染色體區是X染色體和Y染色體間唯一可發生互換的位置，這也是它的名稱由來，由於會發生互換的是體染色體，X染色體和Y染色體一般是沒有互換的現象，只有在偽…
位點特異性重組
重組酶催化位點特異性重組的機制，上方為傳統觀點，下方為較新研究的觀點]] 重組酶催化位點特異性重組的機制，四股DNA均被切割]] 位點特異性重組（Site-specific recombination）是生物基因重組的一種機制，即兩段具有一定同源序列的DNA發生重組，此過程中兩段DNA序列會發先發生聯會，位點特異性（SSR）會與DNA結合，切割兩段DNA後促進酯交換反應，使一段DNA與另一段DNA連接-而形成霍利迪交叉，再進行第二次切割…
中心法則
分子生物學的中心法则（，又譯分子生物學的中心教条），首先由佛朗西斯·克里克於1958年提出，並於1970年在《自然》上的一篇文章中重申： 中心法则經常為人誤解，尤其與遺傳信息“由DNA到RNA到蛋白質”的標準流程相混淆。有些與標準流程不同的信息流被誤以為是中心法则的例外，其實朊毒体是中心法则現時已知的唯一例外。 遺傳信息的標準流程大致可以这样描述：「DNA製造RNA，RNA製造蛋白質，蛋白質反過來協助前兩項流程，並協助DNA自我複製」，…
RNA干扰
递送设计的shRNA和在哺乳动物细胞中的RNA干扰的机制。]] RNA干擾（RNA interference，缩写为RNAi）是指一种分子生物学上由双链RNA诱发的基因沉默现象，其机制是通过阻碍特定基因的转录或翻译来抑制基因表达。当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNA时，该mRNA发生降解而导致基因表达沉默。与其它基因沉默现象不同的是，在植物和線蟲中，RNAi具有传递性，可在细胞之间传播，此現象被稱作全身性RNA干擾（sys…
DNA结合位点
DNA结合位点（）是存在于DNA上的与其它分子相绑定的各类结合位点。 DNA结合位点与其它结合位点的区别在于： 它们是DNA序列（如一个基因组）中的一部分； 它们被DNA结合蛋白所绑定。 DNA结合位点常常与一类被称为转录因子的特殊蛋白相联系起来，并因此联系到转录调控。针对特定的一个转录因子的DNA结合位点总和常被命名为该转录因子的顺反组。DNA结合位点也包括了其它蛋白的靶点，如限制性核酸内切酶、位点特异性重组酶（见位点专一重组）及甲基…
DNA条形码
DNA条形码（）是一种利用基因组内的DNA片段来鉴定生物物种的技术。动物物种的鉴定采用线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因(cytochrome c oxidase I, COI)作为通用DNA条形码序列；生命条形码联盟(CBOL)植物工作组推荐叶绿体基因组的rbcL和matK片段作为植物鉴定的DNA条形码；生命条形码联盟真菌工作组推荐核糖体DNA内转录间隔区基因(nuclear ribosomal internal transcribed…
Cre-Lox重组
Cre-Lox重组是一种用于在细胞DNA的特定位点上进行删除、插入、转座和倒位操作的位点特异性重组酶技术，其特点在于可以让DNA修改对指定的特定细胞群进行，或是使修改过程由特定的外部刺激所触发。此技术对真核和原核细胞都适用。特别地，对研究由各种复杂细胞和神经通路复合而形成认知行为的大脑的神经生物学家而言，这种技术已被证明是相当实用的。 这个重组体系由单个酶组成，即可以让一对被称为Lox序列的短目标序列进行重组的Cre重组酶，除此之外不需…
CRISPR
CRISPR（IPA：/ˈkrɪspər/；DJ：/ˈkrispə/；KK：/ˈkrɪspɚ/）是由日本科學家於1987年在大腸桿菌的基因組中發現到特別規律的DNA序列。即某一小段DNA會一直重複，重複片段之間又有相等長的間隔，此序列就是「Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats，簡稱： CRISPR」亦可稱「CRISPR-associated proteins，…
顺反组
顺反组（）指的是“全基因组尺度下反式作用因子的顺式作用靶点的集合，也可以说是在体情况下转录因子结合位点或组蛋白修饰在全基因组上的位置”。“顺反组”这一术语是cistron（顺反子）和genome（基因组）的混成詞，最初由达纳-法伯癌症研究所和哈佛医学院的研究者命名。 染色质免疫沉淀等技术结合微阵列分析“ChIP-on-chip”或大规模并行DNA测序“ChIP-Seq”极大地方便了对转录因子及其它染色质相关蛋白的顺反组的定义。 参考文献…
重疊基因
基因組中具有重疊基因]] 重疊基因（Overlapping genes），亦作「多重編碼」（dual coding），是指兩個或兩個以上的基因共享一段DNA序列的現象。重疊基因的存在使得一段核苷酸序列可以編碼一種以上的表達產物。重疊基因使一段DNA序列翻譯出的mRNA能被不同的讀框閱讀，或者使一個基因的反義鏈的某一部分能成爲另一個基因的正義鏈的一部分。科學家已在細菌，病毒，甚至真核細胞/真核生物中發現了重疊基因的存在研究表明，在細菌中，…
遗传密码
序列編碼所對應的氨基酸。]] 分子上一系列的密碼子（codons），每個密碼子由3個含氮鹼基，對應單個氨基酸。核苷酸使用縮寫字母A、U、G和C。信使RNA採用U（尿嘧啶）代替DNA採用T（胸腺嘧啶）。此信使RNA分子將責成一個核糖體根據這個密碼合成的蛋白質。]] 遺傳密碼（Genetic code）又稱遺傳編碼，是遺傳-{信息}-的傳遞規則，將DNA或mRNA序列以三個核苷酸為一組的“（codon）”轉譯為蛋白質的氨基酸序列，以用於蛋白…
生物朋克
生物朋克（英文：Biopunk，Biotechnology和Punk的结合词），在主题和风格上受到赛博朋克的影响，但側重於生物技術而不是信息技術，與合成生物學有關。是科幻小说的分支之一，以生物技術或基因工程為主題，通常有社会秩序受破坏的情节。 代表作品 小說 科學怪人 莫洛博士島 发条女孩 血音乐 電影 再造戰士;}- 變種異煞;}- 毀滅戰士 極地戰嚎;}- D-9異形禁區;}- 人工進化;}- 超体;}- 緝魂 維斯珀 電視劇 末世…
引物延伸
测序的示意图]] **'（）是一种分子生物学方法，由康奈尔大学教授吴瑞在1971年发明，是后续聚合酶链式反应（PCR）、桑格测序及（SBS）等技术的基础。指在引物（人工合成的一小段寡核苷酸，长20-50nt，通常带有放射性标记）与模板DNA或RNA的特定位置互补结合后，通过聚合酶不断在引物的3′端加上碱基直至原模板链的5′端的技术。 参考文献
電移位切試驗
電移位切試驗（英语：Electrophoretic mobility shift assay）是一種分子生物學試驗，用来檢測蛋白質有没有和核酸發生親和作用。試驗將没有放入核酸的蛋白質和放入核酸的蛋白質作比較，經過凝膠電泳，體積比較大的分子會移動得比較近，而體積比較小的分子會移動得比較遠。通過觀察分子在凝膠中移動形成的條紋，可以知道蛋白質有没有和核酸發生親和作用。
DNA密码子表
碱基，称为核苷酸的三联密码子。]] 传统上，遗传密码以RNA密码子表的形式表示；这是因为在细胞核糖体制造蛋白质时，指导合成蛋白质的是信使RNA。信使RNA的序列则由基因组DNA确定。随着计算生物学和基因组学的兴起，现今可在DNA水平上发现大多数基因，因此DNA密码子表变得愈加有用。下表中的DNA密码子存在于有义DNA链上，并以5'端→3'端的方向排列。 参见 RNA密码子表 RNA DNA 参考文献 外部链接 [https://web.…