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DNA结合位点

DNA结合位点()是存在于DNA上的与其它分子相绑定的各类结合位点。 DNA结合位点与其它结合位点的区别在于: 它们是DNA序列(如一个基因组)中的一部分; 它们被DNA结合蛋白所绑定。 DNA结合位点常常与一类被称为转录因子的特殊蛋白相联系起来,并因此联系到转录调控。针对特定的一个转录因子的DNA结合位点总和常被命名为该转录因子的顺反组。DNA结合位点也包括了其它蛋白的靶点,如限制性核酸内切酶、位点特异性重组酶(见位点专一重组)及甲基…

DAPI

DAPI即4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole),是一種能夠與DNA強力結合的螢光染料,常用於螢光顯微鏡觀測。因為DAPI可以透過完整的細胞膜,它可以用于活細胞和固定細胞的染色。 历史 1971年DAPI在一项关于制抗的药物的研究中由Otto Dann的实验室首次合成,虽然它不是一种成功的药物,但更深入的研究表明它在与DNA强力结合时发出更强的荧光,因此在1975年它被用在超速离心分…

锌指

和反式的β折疊所組成。鋅離子(綠色)是由兩個組氨酸殘基和兩個半胱氨酸殘基所調]] 锌指(),又稱鋅手指,是一种小的蛋白质结构模体,其特征在于配合一个或多个锌离子(Zn2+)以稳定折叠。最初用来描述非洲爪蟾卵母细胞转录因子IIIA假说结构的手指状外观,锌指名称现在已经包含了各种不同的蛋白质结构。在1983年,非洲爪蟾TFIIIA最初被证明含有锌,并且需要这种金属才能运行,这是被报道的第一个基因调节蛋白中具有锌的要求。 这些具有锌指结构的蛋…

新霉素

]] 新霉素(neomycin)是一种氨基糖苷类抗生素,1949年微生物学家赛尔曼·瓦克斯曼和他的学生休伯特·萊徹瓦利耶(Hubert Lechevalier)在弗氏链霉菌(Streptomyces fradiae)中分离获得。 应用 新霉素大多用于局部给药,如乳膏、搽剂、眼药水等。偶尔也口服,但一般常与其他抗生素联用,但新霉素在胃肠道内不被吸收。因为有较强的肾脏毒性和耳毒性,新霉素不注射给药。新霉素也用于细胞培养。 藥用商標 炎妥淨軟…

菲啶

菲啶()是一种含氮杂环化合物,化学式C13H9N。菲啶是嵌入DNA并与之结合的荧光染料的骨架,使得核酸电泳后的胶片可以辨识核酸的相对位置,例如核酸染料溴化乙锭和碘化丙锭。吖啶是菲啶的同分异构体。 发现与合成 菲啶于1891年由和H. J. 安克斯密特发现于苯甲醛与苯胺缩合产物的热解。皮克特-休伯特反应(1899年)从N-酰基-2-对联苯基苯胺在加热与氯化锌催化下生成菲啶。 : 1931年,Morgan与Walls改进此方法,以硝基苯为溶…

赫斯特染色

細胞,中間與右邊的細胞正經歷分裂間期,可見整個細胞核都呈藍色。而左方的細胞正在進行有絲分裂,其細胞核正在崩解,準備接下來要進行的分裂]] 赫斯特染色()是荧光染色中的一種類型,由赫斯特公司开发,專門用來在荧光顯微觀察下標示DNA。由於可將DNA標示,此種染色方式也可以用來辨識內含DNA的細胞核及粒線體的位置。 常用的兩種染劑為Hoechst 33258與Hoechst 33342 ,這兩種染劑可在波長350 nm的紫外光下激化。不過赫斯…

螺旋-轉角-螺旋

的λ抑制子(λ repressor)利用螺旋-轉角-螺旋(綠)結構與DNA(紅與藍)結合。]] 螺旋-轉角-螺旋(,简称为HTH)是一種蛋白質的結構基序(structural motif),可與DNA進行結合。此結構是由一條氨基酸短鏈將兩個α螺旋連結在一起,可見於許多專門調節基因表現的蛋白質。與DNA的結合,是經由蛋白質與鹼基之間的氫鍵及范德华力來進行,結合位置是DNA的大凹槽(參見DNA條目,例外:TATA联结蛋白的该结构结合位置为小…

碱性螺旋-环-螺旋

鹼性螺旋-環-螺旋(,简称为bHLH)是表征一种转录因子家族的蛋白質结构模体。 擁有此蛋白質結構域的蛋白質成為一個蛋白質家族,這些蛋白質大多可以調控轉錄作用。bHLH蛋白質常形成雙體(dimer)而後辨識DNA,並調控基因的轉錄。 它們參與許多重要的發育與生理功能,包含肌肉的發育、神經系統的分化、氣管生成、低氧感應、芳香感應、生物時鐘等。 参考文献 外部链接 [http://prosite.expasy.org/PDOC00038 PD…

单链DNA结合蛋白

单链DNA结合蛋白(Single-stranded DNA-binding protein,缩写SSB或SSBP)又称单链结合蛋白,是专门负责与DNA单链区域结合的一种蛋白质,为DNA复制、重组和修复所必需的成分。 功能 防止两条互补单链再次结合为双螺旋,维持单链状态。 防止单链区域形成链内二级结构。 保护单链区域,防止被核酸酶水解。 刺激某些酶的活性。 其他功能。 外部链接 *