Folding@home
Folding@home（簡稱FAH或F@h）是一个研究蛋白质折叠、误折、聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算工程。由斯坦福大学化學系的潘德实验室（Pande Lab）主持，於2000年10月1日正式啟動。這包括蛋白質折疊的過程和蛋白質的運動，並且依賴於在志願者的個人計算機上運行的模擬。Folding@home 目前位於宾夕法尼亚大学，由維杰·潘德(Vijay Pande)的前學生Greg Bowman領導。 Folding@home現…
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共 11 篇文章
AlphaFold
AlphaFold（中譯名：阿爾法折疊）是Alphabet旗下Google子公司DeepMind所開發的人工智慧軟體，運用深度学习技術進行蛋白质结构预测（即從胺基酸序列推算蛋白質的三維結構）。 AlphaFold已發展出三個主要版本。AlphaFold 1於2018年12月在第13屆蛋白質結構預測關鍵評估（CASP）競賽中排名總體第一。2020年的AlphaFold 2在CASP14競賽中達到與X光晶體學等實驗方法相當的準確度，被譽為在…
蛋白质超家族
蛋白质超家族（）是对可以找到共同祖先的最大一组蛋白质的合称。一般而言，共同祖先是基于和物理性质得出的，即使不高，也可能会具有共同祖先。蛋白质超家族中往往还会有内部联系相对更近的蛋白质家族。 识别 蛋白质超家族可以用多种方法进行鉴定。 序列相似性 之前，不同蛋白质序列之间的相似性曾被作为推断同源性最常用的指标。序列相似性被认为是相关性的一个指示物，因为相似的序列很有可能来自于基因重复和趋异进化，而不太可能来自于趋同进化。由于密码子简并的缘…
蛋白质构象病
染色的阿尔茨海默病患者大脑皮质切片的显微照相，该蛋白片段在老年斑和脑淀粉样血管病中积聚。10倍显微镜物镜。]] 在医学上，蛋白质构象病（）是指某些蛋白质的结构变得异常，从而破坏身体细胞、组织和器官的功能的疾病。 通常这些蛋白质无法折叠成它们本来的正常结构；当处于这种错误折叠的状态时，它们在某种程度上可能变得有毒（毒性作用增强）或失去它们正常的功能。 蛋白质构象病（又称蛋白质错误折叠病）包括如克雅二氏病和其他朊毒体疾病、阿尔茨海默病、帕金…
锌指
和反式的β折疊所組成。鋅離子（綠色）是由兩個組氨酸殘基和兩個半胱氨酸殘基所調]] 锌指（），又稱鋅手指，是一种小的蛋白质结构模体，其特征在于配合一个或多个锌离子（Zn2+）以稳定折叠。最初用来描述非洲爪蟾卵母细胞转录因子IIIA假说结构的手指状外观，锌指名称现在已经包含了各种不同的蛋白质结构。在1983年，非洲爪蟾TFIIIA最初被证明含有锌，并且需要这种金属才能运行，这是被报道的第一个基因调节蛋白中具有锌的要求。 这些具有锌指结构的蛋…
蛋白质折叠
蛋白质折叠（）是蛋白质获得其功能性结构和构象的物理过程。通过这一物理过程，蛋白质从无规则卷曲折叠成特定的功能性三维结构。在从mRNA序列翻译成线性的氨基酸链时，蛋白质都是以去折叠多肽或无规则卷曲的形式存在。 蛋白質的基本單位為胺基酸，而蛋白質的一級結構指的就是其胺基酸序列。蛋白質會由所含胺基酸残基的親水性、疏水性、帶正電、帶負電等特性通过残基间的相互作用而摺疊成一立體的三级結構。 根据克里斯琴·B·安芬森（1972年的諾貝爾化學獎得主）…
淀粉样变性
澱粉-{}-樣變性（amyloidosis）又稱類-{}-澱粉變性、類澱粉沉著症等，是類澱粉蛋白與黏多糖的复合物沈積在組織引起的疾病。類澱粉沉積症的病徵視乎澱粉樣蛋白沉積的所在地而有所不同，有腹瀉、體重減輕、容易疲倦、舌頭腫脹、出血、麻木、姿位性低血壓、腿部腫脹或脾臟腫大；類澱粉沉積症可分為局部性及全身性。 若患者出現蛋白尿與器官腫大或，則有可能是罹患類澱粉沉積症 原發型皮膚型澱粉樣變性 (Primary cutaneous amylo…
罗斯曼折叠
(PDB ID 1G5Q)与辅因子黄素单核苷酸结合]] 罗斯曼折叠（）是一种蛋白质结构基序，常见于核苷酸结合蛋白质，特别是辅因子NAD结合蛋白。该结构由两个重复的部分组成，每个部分包括6个平行的β折叠与两对α螺旋形成β-α-β-α-β的拓扑结构。因為每一個罗斯曼折叠可以和一個核苷酸结合，像NAD等二核苷酸的結合域包括二個成對的罗斯曼折叠，分別和辅因子的一個核苷酸部份結合。單一的罗斯曼折叠可以和單核苷酸結合，例如輔因子FMN。 该结构以迈…
DNA夾
蛋白質的三聚體。]] DNA夾（）又称滑钳（sliding clamp）、滑动钳、滑动压板、滑行夹，是一種蛋白質的三級結構，為DNA複製過程中的持续合成能力-啟動因子（processivity-promoting factor），是DNA聚合酶III全酶的必要組成，可避免DNA聚合酶與DNA模板分離，並提升DNA合成速率。 外部連結 [https://web.archive.org/web/20110516101151/http://s…
珠蛋白
珠蛋白（）属球状蛋白质的一员，为含有血红素（heme）的球状蛋白超家族，涉及结合和/或运输氧气。珠蛋白都包含“珠蛋白折叠”（globin fold），此折叠为一串8个α螺旋的链段。 珠蛋白有两个重要的成员：肌红蛋白和血红蛋白，这两种蛋白质都藉由血红素辅基可逆地与氧结合，且此两者广泛分布于许多生物体内。 成员 肌红蛋白 血红蛋白 神经珠蛋白 细胞珠蛋白 参考资料
Β桶状结构
β桶状结构（英语：Beta barrel）是蛋白质的一种三级构造。它由多条β折叠带通过反平行重叠成桶状，两段则由肽链残基间的氢键结束。常见采取这种构造的蛋白有孔蛋白、跨膜蛋白以及其他需要与非极性分子打交道的蛋白。 在β桶中，β折叠带往往同时带有亲水与疏水性残基。根据外部环境与管道需要，再将内外分别整理成亲水或疏水的管道面。 参考文献 外部链接 [http://www.cryst.bbk.ac.uk/PPS95/course/8_fold…