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共 51 篇文章

PDZ结构域

*'()是一个长约80-90个氨基酸残基的蛋白质结构域,广泛存在于细菌、真菌、植物、病毒、以及动物的信号转导相关蛋白中。 参考文献 外部链接 [http://scivee.tv/node/3692 The PDZ Domain as a Complex Adaptive System] A concise technical summary and a statement of principal findings and ramifi…

同源框

同源(异形)框(),或稱「同源匣」是某些影響動物、真菌及植物發育的基因所擁有的一段DNA序列,擁有同源框的基因稱作同源异形基因,統稱同源异形基因家族。 這段序列之長度約180個核苷酸,能轉錄出一段蛋白質结构域,稱為同源框结构域(Homeodomain)。 概述 同源框長約180個碱基对,編碼可與DNA結合的蛋白質位點(同源域)。同源框基因編碼的轉錄因子通常會開啟一系列其他基因,例如形成腿所需的所有基因。同源框结构域特異性結合DNA。然而…

二氢叶酸还原酶

二氢叶酸还原酶(,简称为DHFR)是一种将二氢叶酸还原为四氢叶酸的酶,并以NADPH作为电子供体,后者可被转换为多种四氢叶酸辅酶被用于化学上的一碳单位转移。在人体中,二氢叶酸还原酶是由DHFR基因编码的。它位于5号染色体的q11→q22区域。 参考文献

SH2结构域

SH2结构域(,*Src同源2结构域*)是癌蛋白Src以及许多其它细胞内信号转导蛋白上的一个保守的结构域。那些含SH2结构域的蛋白质可以对接到其它蛋白中的磷酸化酪氨酸残基上。SH2结构域往往存在于帮助受体酪氨酸激酶通路信号转导的衔接蛋白中。 介绍 蛋白质-蛋白质互作在细胞生长与发育过程中起到重要的作用。作为蛋白质亚单位的模块化的结构域通过识别短肽序列的方式调控这些蛋白质互作。SH2结构域就是比较著名的结构域之一。SH2结构域在细胞通讯之…

SH3结构域

SH3结构域(,全称Src同源3结构域,)是最早在病毒接头蛋白v-Crk及酪氨酸激酶Src、Abl中发现的长约60个氨基酸残基的保守结构域,在磷酸肌醇3-激酶、Ras超家族G蛋白、cdc25中也存在 参考文献 外部链接 [http://nashlab.bsd.uchicago.edu/index.php?option=com_content&task=view&id=28&Itemid=29 Nash Lab Protein Inter…

PH结构域

PH结构域(,全称普列克底物蛋白同源结构域,)是一类蛋白质结构域,长约120个氨基酸,存在于涉及细胞内信号传导或作为细胞骨架成分的多种蛋白质中。 参考文献 外部链接 [http://nashlab.bsd.uchicago.edu/index.php?option=com_content&task=view&id=82&Itemid=29 Nash Lab Protein Interaction Domains - PH domain …

ENTH结构域

ENTH结构域(,全称内吞适配蛋白N末端同源结构域,)是一种涉及內吞作用和细胞骨架机制的蛋白质结构域。ENTH结构域长约150个氨基酸,在各物种中高度保守,最初发现于的N-末端,因而得名。 参考文献 外部链接 * [https://web.archive.org/web/20120204201050/http://www.endocytosis.org/epsin/epsin.htm Endocytosis.org entry on e…

EF手

EF手()是一种在钙结合蛋白中发现的螺旋-环-螺旋结构域或结构基序。 EF手包括一个螺旋-环-螺旋拓扑结构,就像人类的手上拇指和食指,而Ca2+离子与其配体就位于环内。这一结构最早在中发现,小清蛋白含有三个EF手结构,与钙离子结合而造成的肌肉放松有关。 EF手包含两个α螺旋,由一个短的(通常包括12个氨基酸)环状区域连接,常用于结合钙离子。EF手也出现在钙调蛋白的所有结构域和肌肉蛋白质肌钙蛋白C中。 钙离子结合位点 分类 自从EF手结构…

DEAD box

DEAD box為一蛋白質家族的通稱,在原核生物與真核生物細胞中皆有,因其中一個結構域有一天門冬胺酸-麩胺酸-丙胺酸-天門冬胺酸(DEAD)的氨基酸序列而得名。此家族的蛋白多參與RNA相關反應,有許多蛋白為RNA解旋酶,可以消耗ATP的機制將雙股RNA解開。 DEAH家族與SKI2家族的蛋白序列也與DEAD box家族的蛋白相似,三者合稱DExD/H家族蛋白。 結構 1980年代晚期有學者發現許多蛋白的序列和eIF4ARNA解旋酶的相似…

BCR基因

BCR基因(),或称断裂点簇集区(),是bcr-abl融合基因的组成部分之一,其与费城染色体的形成机制有关。 病理学 一个22号染色体与9号染色体的相互易位作用而产生的费城染色体,它通常在慢性粒细胞性白血病患者体内发现。22号染色体的断裂点就在BCR基因中。这个易位作用产生了一种基于BCR基因和ABL基因进行编码而成的融合蛋白,其基因就位于9号染色体的断裂点上。尽管bcr-abl融合基因已经被广泛研究,但普通的BCR基因机制仍然不明。其…

B3结构域

B3 DNA结合结构域()是一些转录因子中的高度保守的DNA结合结构域(DNA-binding domain,DBD)在超过40个物种()中发现,与其它结构域一起()执行转录因子的功能。B3结构域的一级结构为100-120个氨基酸残基,二级结构为七个β折叠和两个α螺旋,三级结构为假棒状(pseudobarrel,),从DNA结构的大沟处结合DNA分子: ARF(Auxin Response Factors) ABI3(ABscisic …

蛋白质结构域

蛋白质结构域()是蛋白质多肽链中具有特异结构和独立功能的区域,能自稳定,独立于其他区域折叠,其构成蛋白质三级结构的基本单元。 每个结构域形成一个紧凑的折叠三维结构。许多蛋白质由几个结构域组成,而一个结构域可能出现在各种不同的蛋白质中。有些球形蛋白的一条肽链,或以共价键相连的两条或多条肽链在空间结构上可以区分为若干个球状的子结构,其中的每一个球状子结构就被称为一个结构域。 同一个蛋白的各个结构域之间是以肽链相互链接的,而链接两个蛋白质结构…

锌指

和反式的β折疊所組成。鋅離子(綠色)是由兩個組氨酸殘基和兩個半胱氨酸殘基所調]] 锌指(),又稱鋅手指,是一种小的蛋白质结构模体,其特征在于配合一个或多个锌离子(Zn2+)以稳定折叠。最初用来描述非洲爪蟾卵母细胞转录因子IIIA假说结构的手指状外观,锌指名称现在已经包含了各种不同的蛋白质结构。在1983年,非洲爪蟾TFIIIA最初被证明含有锌,并且需要这种金属才能运行,这是被报道的第一个基因调节蛋白中具有锌的要求。 这些具有锌指结构的蛋…

輔脂酶

輔脂酶(Colipase) 是一种蛋白质輔酶,可提升的酵素活性。本蛋白的前體前輔脂酶(procolipase)由胰腺所分泌,此時並沒有酵素活性。前輔脂酶進入腸道後,會被胰蛋白酶分解為輔脂酶,此時方有功能。輔脂酶的功能是为了防止胆盐在十二指肠内抑制脂肪酶水解三酸甘油酯。 在人类中,輔脂酶由 CLPS 基因轉譯而得。 蛋白质結構域 輔脂酶是胰脂酶可有效提升胰脂酶的功能,影響人體吸收三酸甘油脂的能力。輔脂酶會與胰脂酶的無酵素活性的C端結合,稳…

谷氧还蛋白

谷氧还蛋白(,简称为GRX)是一类小型的氧化还原酶,为大约只有一百个氨基酸残基的单链蛋白质,并以谷胱甘肽作为辅因子。谷氧还蛋白被底物氧化,而非酶促地被谷胱甘肽还原。与可被硫氧还蛋白还原酶还原的硫氧还蛋白相反,并不存在特异性还原谷氧还蛋白的氧化还原酶。取而代之的是,谷氧还蛋白通过去氧化谷胱甘肽来被还原。被氧化的谷胱甘肽接下来被谷胱甘肽还原酶重生出来。NADPH、谷胱甘肽、谷胱甘肽还原酶和谷氧还蛋白这些组件组合在一起的氧化还原网络构成了谷胱…

血小板衍生生長因子

血小板衍生生長因子(Platelet-derived growth factor,PDGF)為一種生長因子,可以調控細胞的生長和分化,且在血管新生上扮演重要角色。未控制的血管新生常常導致癌症。在化學上PDGF為醣蛋白二聚體,且有A和B兩種不同形式,可組合為AA、AB和BB等結構。 PDGF是一種有效的间充质細胞丝裂原,包含纖維母細胞、平滑肌、神經膠細胞。在小鼠和人类中,PDGF信号网络都包括四種配体:PDGFA 到 PDGFAD,与两个…

线粒体载体

线粒体载体是存在于线粒体膜中用于将各类化学物质转运进出线粒体的溶质载体家族蛋白质,不同线粒体载体负责转运的物质一般是不同的。这些定位在线粒体内膜中的载体蛋白,除了能转运各种分子还可以参与能量的传递。线粒体载体包括ATP/ADP转位酶(ATP/ADP Translocase)、磷酸载体蛋白(phosphate carrier protein,PHC)、α-酮戊二酸/苹果酸载体蛋白(2-oxoglutarate malate carrier…

突觸小泡蛋白

突觸小泡蛋白(英語:synaptobrevins,synaptobrevin isotypes 1-2)是分泌囊泡的小膜嵌入蛋白,分子量為18千道爾頓(kDa),是囊泡相關膜蛋白(VAMP) 家族的一部分。 Synaptobrevin是參與SNARE複合體形成的SNARE蛋白之一。 結構 在核心SNARE複合體的四個α螺旋當中: 一個由synaptobrevin貢獻 一個由syntaxin貢獻 兩個由SNAP-25(在神經元中)貢獻。 …