BAR结构域
BAR结构域()在分子生物学中是在细胞中参与膜动力学的许多蛋白质中出现的高度保守的蛋白质二聚化结构域。BAR结构域是香蕉形的,并且通过其凹面与膜结合。它能够通过优先结合弯曲的膜来感测膜弯曲。BAR结构域的命名是以它们被所发现的三种蛋白命名:Bin,Amphiphysin和Rvs。 参见 参考文献 外部链接 [https://web.archive.org/web/20130727122243/http://www.endocytosis…
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BAR结构域()在分子生物学中是在细胞中参与膜动力学的许多蛋白质中出现的高度保守的蛋白质二聚化结构域。BAR结构域是香蕉形的,并且通过其凹面与膜结合。它能够通过优先结合弯曲的膜来感测膜弯曲。BAR结构域的命名是以它们被所发现的三种蛋白命名:Bin,Amphiphysin和Rvs。 参见 参考文献 外部链接 [https://web.archive.org/web/20130727122243/http://www.endocytosis…
的λ抑制子(λ repressor)利用螺旋-轉角-螺旋(綠)結構與DNA(紅與藍)結合。]] 螺旋-轉角-螺旋(,简称为HTH)是一種蛋白質的結構基序(structural motif),可與DNA進行結合。此結構是由一條氨基酸短鏈將兩個α螺旋連結在一起,可見於許多專門調節基因表現的蛋白質。與DNA的結合,是經由蛋白質與鹼基之間的氫鍵及范德华力來進行,結合位置是DNA的大凹槽(參見DNA條目,例外:TATA联结蛋白的该结构结合位置为小…
萤光素酶()是自然界中能够产生生物发光的酶的统称,其中最有代表性的是(Photinus pyralis)的萤火虫体内的萤光素酶。在相应化学反应中,萤光的产生是来自于萤光素的氧化,有些情况下反应体系中也包括三磷酸腺苷(ATP)。没有萤光素酶的情况下,萤光素与氧气反应的速率非常慢,而钙离子的存在常常可以进一步加速反应(与肌肉收缩的情况相似)。萤光生成反应通常分为以下两步: 萤光素 + 三磷酸腺苷(ATP) → 萤光素腺苷酸(lucifery…
鹼性螺旋-環-螺旋(,简称为bHLH)是表征一种转录因子家族的蛋白質结构模体。 擁有此蛋白質結構域的蛋白質成為一個蛋白質家族,這些蛋白質大多可以調控轉錄作用。bHLH蛋白質常形成雙體(dimer)而後辨識DNA,並調控基因的轉錄。 它們參與許多重要的發育與生理功能,包含肌肉的發育、神經系統的分化、氣管生成、低氧感應、芳香感應、生物時鐘等。 参考文献 外部链接 [http://prosite.expasy.org/PDOC00038 PD…
索马甜(thaumatin)是一种低热量甜味剂和调味剂。这种蛋白质主要用于调味,而非单一地增甜。 索马甜最初作为蛋白质的混合物,从西非的katemfe果实(Thaumatococcus daniellii Bennett)中分离出来。索马甜科中增甜剂的一些蛋白质比食糖大约甜2000倍。尽管它很甜,其甜味和食糖完全不同,其甜味作用地非常缓慢。甜味可持续很长时间,留下光果甘草似的余味。索马甜极易溶于水,对热稳定,在酸性条件下稳定。 分子资讯…
天冬氨酸蛋白酶 (英语:Aspartic protease)是一种催化类型的蛋白酶,它使用一个或多个天冬氨酸残基结合的活化水分子来催化其肽底物。通常,它们在活性位点具有两个高度保守的天冬氨酸,在酸性pH条件下具有最佳活性。几乎所有已知的天冬氨酰蛋白酶都被胃酶抑素抑制。 天冬氨酸内肽酶EC 3.4.23已经表征了脊椎动物、真菌和逆转录酶病毒的起源。 真核天冬氨酸蛋白酶包括胃蛋白酶、组织蛋白酶和肾素。它们具有由祖先复制而产生的两域结构。逆转…
二氢乳清酸脱氢酶(DHODH)是由人类16号染色体上的DHODH基因编码的酶。由该基因编码的酶在嘧啶的从头合成(de novo synthesis)中催化第四步酶促步骤,即泛醌介导的二氢乳清酸氧化为乳清酸。该蛋白是位于线粒体内膜(IMM)外表面的线粒体蛋白。这种酶的抑制剂用于治疗自體免疫性疾病,如类风湿性关节炎。 结构 不同类型DHODH在辅因子含量,寡聚状态,亚细胞定位和膜结合方面具有不同性质。这些DHODH突变体根据总体序列比对分为…
C-型凝集素(C-type Lectins)是一类可以和糖类结合的蛋白质。它们区别于其他类型的凝集素是在于它们含有大约120个氨基酸序列的钙依赖型的糖类识别区域(carbohydrate recognition domain,CRD). 參照 参考文献
逆转录病毒天冬氨酰蛋白酶(英语:Retroviral aspartyl protease或retropepsins)是来自逆转录病毒、反转录转座子和杆状DNA病毒(植物双链DNA病毒)的单域天冬氨酸蛋白酶。这些蛋白酶通常是较大的DNA聚合酶或群特异性抗原的一部分。逆转录病毒蛋白酶与双结构域真核天冬氨酸蛋白酶的单个结构域同源,例如胃蛋白酶、组织蛋白酶和肾素(;MEROPS A1)。胃蛋白酶是MEROPS A2,AA家族的成员。(所有已知的…
β桶状结构(英语:Beta barrel)是蛋白质的一种三级构造。它由多条β折叠带通过反平行重叠成桶状,两段则由肽链残基间的氢键结束。常见采取这种构造的蛋白有孔蛋白、跨膜蛋白以及其他需要与非极性分子打交道的蛋白。 在β桶中,β折叠带往往同时带有亲水与疏水性残基。根据外部环境与管道需要,再将内外分别整理成亲水或疏水的管道面。 参考文献 外部链接 [http://www.cryst.bbk.ac.uk/PPS95/course/8_fold…
WRKY结构域是一类转录因子,存在于WRKY转录因子家族中。几乎所有植物基因组中都有带WRKY结构域的蛋白,同时WRKY基因也被发现存在于双滴虫、多细胞变形虫及其他变形虫门和一些真菌基因组中。不过WRKY基因似乎不存在于一些其他的非植物物种。在过去的20年间,WRKY转录因子一直是植物学领域的重点研究对象。WRKY的DNA识别结构域能够识别W-box顺式作用元件(T)TGAC(C/T),以及W-box序列的一些变体。 结构 WRKY转录…