DEAD box

DEAD box為一蛋白質家族的通稱,在原核生物與真核生物細胞中皆有,因其中一個結構域有一天門冬胺酸-麩胺酸-丙胺酸-天門冬胺酸(DEAD)的氨基酸序列而得名。此家族的蛋白多參與RNA相關反應,有許多蛋白為RNA解旋酶,可以消耗ATP的機制將雙股RNA解開。

DEAH家族與SKI2家族的蛋白序列也與DEAD box家族的蛋白相似,三者合稱DExD/H家族蛋白。

結構
1980年代晚期有學者發現許多蛋白的序列和eIF4ARNA解旋酶的相似,後續研究發現這些蛋白均有9個保守的結構域,由N端至C端分別為Q結構域、結構域I、結構域Ia、結構域Ib、結構域II、結構域III、結構域IV、結構域V與結構域VI,其中結構域II又名,包含天門冬胺酸-麩胺酸-丙胺酸-天門冬胺酸(DEAD)的氨基酸序列。

功能
DEAD box家族的蛋白多為RNA解旋酶,參與轉錄、RNA剪接、、RNA轉運、轉譯與RNA降解等細胞中的多種RNA相關反應。

釀酒酵母mRNA剪接的過程有Sub2、Prp28與Prp5等3種DEAD box蛋白參與;Prp28可能可識別內含子的5′端切割位點,但此蛋白無解旋酶活性。另外Prp2、Prp16、Prp22、Prp43與Brr213等多種DEAH家族蛋白也參與mRNA剪切。

轉譯起始因子eIF4A為一DEAD box蛋白,在轉譯起始時可解開mRNA5′ UTR的二級結構,以利核糖體小次單元掃描mRNA以尋找起始密碼子。另一DEAD box Ded1也參與轉譯起始過程,但具體機制仍不明;還有一與Ded1相似的DEAD box蛋白Vasa可與eIF2互動。

參考文獻

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