基因预测
基因預測（）或称基因发现（），是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和调控因子。基因识别是基因组研究的基础。 在早期，基因识别的主要手段是基于活的细胞或生物的实验。通过对若干种不同基因的同源重组的速率的统计分析，我们能够获知它们在染色体上的顺序。若进行大量类似的分析，我们可以确定各个基因的大致位置…
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Folding@home
Folding@home（簡稱FAH或F@h）是一个研究蛋白质折叠、误折、聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算工程。由斯坦福大学化學系的潘德实验室（Pande Lab）主持，於2000年10月1日正式啟動。這包括蛋白質折疊的過程和蛋白質的運動，並且依賴於在志願者的個人計算機上運行的模擬。Folding@home 目前位於宾夕法尼亚大学，由維杰·潘德(Vijay Pande)的前學生Greg Bowman領導。 Folding@home現…
生物信息学
X染色體圖譜]] 生物信息學（）利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据，其研究工具是计算机，研究方法包括对生物学数据的搜索（收集和筛选）、处理（编辑、整理、管理和显示）及利用（计算、模拟）。目前主要的研究方向有：序列比对、序列組裝、基因识别、基因重组、蛋白质结构预测、基因表达、蛋白质反应的预测，以及建立进化模型。 生物学技术往往生成大量的嘈杂数据。与数据挖掘类似…
阿利效应
阿利效应（）是生物学中的一个现象，它反映了在一个种群或物种中，种群规模或密度与平均个体適應度（通常按照每个个体的平均增长率计算）之间存在相关性。 历史和背景 虽然当时尚未命名“阿利效应”，但在20世纪30年代，沃德·克莱德·阿利就已将其概念阐述。通过实验研究，阿利证明：鱼缸中金鱼个体更多时，金鱼存活率更高。因此他得出结论：聚集可以提高个体的生存率，而且这种合作可能在社会结构的整体演化中是至关重要的。“阿利定律”（）一词是在1950年代提…
數理生物學
數理生物學（），又稱數學生物學（）或生物数学（）是一个跨学科的领域，其主要的目标是利用数学的技巧和工具为自然界，特别是生物学中的过程建模并进行分析。生物数学在生物学的理论和实践中都有广泛的应用。 重要性 很久以前，数学即被应用于生物学的研究中。然而直到最近，这一领域才引起人们足够的重视，其原因包括： 由于基因学的发展，生物学家采集到的大量数据必须通过解析方法加以处理。 数学理论，特别是混沌理论的发展，使人们对复杂性系统的认识更加深刻，从…
生长和形态
《*'》（）是苏格兰數理生物學家达西·汤普森的著作，主题为生物數學，1917年出版的第一版长达793页，1942年出版的第二版更增到1116页。 参考文献 外部链接 [https://web.archive.org/web/20041027081318/http://www-gap.dcs.st-and.ac.uk/~history/Mathematicians/Thompson_D%27Arcy.html D'Arcy Wentwor…
浮游生物悖論
屬於浮游生物，似乎无视了竞争排除原则。]] 在水生生物学中，浮游生物悖论（）描述的是有限的资源卻意外地支持了大量浮游生物物种的情况，這显然挑戰了竞争排除原则，即两个物种竞争相同的资源时，有一个會佔劣勢而灭绝。 生态悖论 浮游生物悖论源于观察到的浮游生物多样性与竞争排除原则（也称为高斯定律）之间的矛盾，後者認為，当两个物种竞争相同的资源时，最终只有一个物种能夠存續，而另一個会灭绝。这样的两个物种之间是不可能共存的，因为占主导地位的物种将不…
維托·沃爾泰拉
維多·沃爾泰拉（，）是一位義大利數學家、物理學家，以其對數理生物學和積分方程的貢獻而聞名，是泛函分析的創始人之一。 著作 [http://historical.library.cornell.edu/cgi-bin/cul.math/docviewer?did=00750002&view=50&frames=0&seq=7 Leçons sur les fonctions de lignes] (Gauthier-Villars, 19…
約瑟夫·亨利·伍傑
約瑟夫·亨利·伍傑（，）英國的理論生物學家與生物學哲學家。他嘗試使生物科學更具嚴格性與經驗性的企圖深刻地影響了二十世紀的生物學哲學。 著名科學哲學家卡爾·波普爾認為「伍傑......對英美科學哲學的進展的影響與促進遠非他人所可比擬。」("Woodger… influenced and stimulated the evolution of the philosophy of science in Britain and in the U…
尼尔·弗格森 (流行病学家)
尼尔·莫里斯·弗格森（，）是英國流行病學家。他是一位數學生物學教授，專門研究於人類和動物中傳播的流行病學。他是倫敦帝國學院下屬的阿卜杜勒·拉蒂夫·賈米爾疾病與緊急情況分析學院（Abdul Latif Jameel Institute for Disease and Emergency Analytics，J-IDEA）的主任、公共衛生學院傳染病流行病學系主任以及醫學系學術發展副院長。弗格森使用數學模型提供了幾種疾病暴發的數據，包括英國2…
理论生态学
理论生态学是利用数学模型和计算模拟等工具研究生态系统的学科。试图揭示自然背后的可能机制。 代表人物 高斯(John M. Gaus)、戴爾(Robert A. Dahl)、雷格斯(Fred W. Riggs)。 內容 生態理論是由環境系統理論演化而來。認為組織是個隨環境和時代變遷而不斷調整其內部構造和工作方式的有機體。第二次世界大戰結束之後，西方民主國家的行政制度、官僚制度、行政方法和技術大量被開發中國家使用，例如:菲律賓效仿美國、越南…
空间演化博弈
空间演化博弈是一种基于细胞自动机的生物数学博弈模型。这一模型通过利用按照博弈规则进行演化的细胞自动机，来获知个体的背叛怎样在未来影响群体的合作-背叛状况。该模型可用于研究细菌、社会等系统模型。 基本模型 空间演化博弈的基本模型由马丁·A·诺瓦克和发表于1992年10月29日的《自然》期刊上，题为「Evolution games and spatial chaos」。。 参考文献