蛋白质超家族
蛋白质超家族()是对可以找到共同祖先的最大一组蛋白质的合称。一般而言,共同祖先是基于和物理性质得出的,即使不高,也可能会具有共同祖先。蛋白质超家族中往往还会有内部联系相对更近的蛋白质家族。 识别 蛋白质超家族可以用多种方法进行鉴定。 序列相似性 之前,不同蛋白质序列之间的相似性曾被作为推断同源性最常用的指标。序列相似性被认为是相关性的一个指示物,因为相似的序列很有可能来自于基因重复和趋异进化,而不太可能来自于趋同进化。由于密码子简并的缘…
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蛋白质超家族()是对可以找到共同祖先的最大一组蛋白质的合称。一般而言,共同祖先是基于和物理性质得出的,即使不高,也可能会具有共同祖先。蛋白质超家族中往往还会有内部联系相对更近的蛋白质家族。 识别 蛋白质超家族可以用多种方法进行鉴定。 序列相似性 之前,不同蛋白质序列之间的相似性曾被作为推断同源性最常用的指标。序列相似性被认为是相关性的一个指示物,因为相似的序列很有可能来自于基因重复和趋异进化,而不太可能来自于趋同进化。由于密码子简并的缘…
结构域的结构表示。]] 蛋白质家族()是一组与演化相关的蛋白质。在许多情况下,蛋白质家族具有相应的基因家族,其中每个基因编码具有1:1关系的相应蛋白质。蛋白质家族的成员从同一祖先演化而来(见同源),具有相似的氨基酸序列、三维结构及生物学功能。 蛋白质家族的相似性中,最重要的是序列相似性(通常是氨基酸序列),因为它是同源的最严格指标,因此是共同祖先的最清晰的指标。使用序列比对方法评估一组序列之间的相似性的重要性存在相当完善的框架。不共享共…
本条目是关于蛋白质(包括蛋白质复合物)的列表;此表旨在编理蛋白质界的相关信息。 除了标示有*“”*的蛋白质,其余的蛋白质均存在于人类蛋白质组中。 若某一蛋白质拥有EC编号,那么该蛋白质已列入酶列表中,所以本页不再收入(不论该蛋白质是否属于以下某个分类)。 纤维蛋白 细胞骨架·细胞骨架蛋白 肌动蛋白 Arp2/3复合体 冠蛋白 肌萎缩蛋白(或称作“肌营养不良蛋白”) FtsZ 角蛋白 肌球蛋白 血影蛋白 微管相关蛋白 微管蛋白 细胞外基质…
MEROPS是一个关于蛋白酶(或称为肽酶)及其抑制剂的在线网络数据库。它对蛋白酶的由Rawlings & Barrett在1993年提出,对蛋白抑制剂的由Rawlings et al.在2004年提出。最新版本MEROPS 12.0于2017年9月发布。 总览 分类基于三级的和一级的结构层面的相似性。比较仅限于直接参与反应的那部分序列,其在肽酶的情况下必须包含活性位点,并且对于蛋白质抑制剂而言为反应位点。分类是分层次的:序列被编组成家族…
真菌免疫調節蛋白質 (英語:fungal immunomodulatory protein, FIP),也被稱為真菌免疫調節蛋白。它是在真菌中發現的一種具有免疫調節活性的蛋白質,因而得名。真菌免疫調節蛋白質屬於免疫球蛋白 (immunoglobulin, Ig) 家族,其特點是結構與人的抗體類似,可以與人類的外周血单个核细胞 (peripheral blood mononuclear cell, PBMC) 作用,使這些細胞分泌各種細胞…