微衛星
微衛星(),亦称为简单重复序列(,SSR(s))或短串联重复序列(,STR(s)),是多型性的一種類型。指兩個或多個核苷酸重複排列,且不同的重複序列相鄰的形式,長度約2到10個鹼基對,常見於非編碼的內含子中。 由于重复单位及重复次数不同,使其在不同种族,不同人群之间的分布具有很大差异性,构成了STR遗传多态性。不同个体之间在一个同源STR位点的重复次数不同。通过识别基因组在特定位点的特定序列重复,可能创建一个个人基因档案。目前已经有超过…
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微衛星(),亦称为简单重复序列(,SSR(s))或短串联重复序列(,STR(s)),是多型性的一種類型。指兩個或多個核苷酸重複排列,且不同的重複序列相鄰的形式,長度約2到10個鹼基對,常見於非編碼的內含子中。 由于重复单位及重复次数不同,使其在不同种族,不同人群之间的分布具有很大差异性,构成了STR遗传多态性。不同个体之间在一个同源STR位点的重复次数不同。通过识别基因组在特定位点的特定序列重复,可能创建一个个人基因档案。目前已经有超过…
CRISPR(IPA:/ˈkrɪspər/;DJ:/ˈkrispə/;KK:/ˈkrɪspɚ/)是由日本科學家於1987年在大腸桿菌的基因組中發現到特別規律的DNA序列。即某一小段DNA會一直重複,重複片段之間又有相等長的間隔,此序列就是「Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats,簡稱: CRISPR」亦可稱「CRISPR-associated proteins,…
衛星DNA由串联排列、不断重复的非編碼DNA组成,它是着絲粒的主要组成部分,也是異染色質的主要结构部分。 类型 衛星DNA与小卫星和微卫星DNA一起被称为串联重复。 一些人体内的衛星DNA类型包括: 长度 重复的脱氧核糖核酸核鹼基模式的长度可以从1对核鹼基到数千对核鹼基不等,整个卫星DNA的长度可以达不中断的数百万核鹼基。大多数卫星DNA位于染色体的端粒或着丝粒部位,不同种之间重复的核苷酸系列模式被保持完好,但是在长的系列里也常有变换。…
短散在核元件(Short interspersed nuclear elements,簡稱SINE)是真核生物基因組中長100至700bp的轉位子序列,屬於反轉錄轉座子,哺乳類基因組約有13%為SINE。SINE與LINE等轉位子皆是「寄生」於生物基因組中的DNA元件,某些情況下可能對生物體有害,但有時細胞也將其用來調控自己的基因表現。 SINE一般不具有长末端重复序列(LTR),其序列從5端至3端可大致分為頭端、中端與尾端三部分,其中…
长散在核元件(,或,缩写LINEs)是一类不包含长末端重复序列的反转录转座子,遍布于许多真核生物的基因组中。LINE占了人类基因组的20%。 起源 一般認為其起源來自II型內含子及其所攜帶的反轉錄酶,某些模型顯示,在真核生物演化早期,細菌的II型內含子隨著內共生入侵了真核生物的細胞核,其中RNA核酶結構退化並保留在基因中,逐漸演化成現代基因的內含子與剪接體,而負責編碼反轉錄酶(IEP)的基因則成為LINEs的祖先,並且使LINEs具有跳…
[[File:Parallel_telomere_quadruple.png|thumb|right|250px|人類端粒DNA的四連體結構。圖片來源:[https://web.archive.org/web/20130607063640/http://ndbserver.rutgers.edu/atlas/xray/structures/U/ud0017/ud0017.html NDB UD0017]。]] 端粒()是真核生物染色體末…
小衛星(英語:Minisatellite)或小衛星序列是一段含有約10到60個鹼基對的DNA片段,在人類基因組中約出現在1000個以上的位置。某些小衛星序列含有一個核心序列“GGGCAGGAXG”(X表示任何字母),其他大多則是一股皆嘌呤,另一股皆嘧啶。在人體內,約90%的小衛星序列出現在靠近端粒的位置,端粒本身則主要是串聯重複(tandem repeat)。 参考文献 參見 微衛星 重複序列 *端粒
Y-STR是指Y染色体上的短串联重复序列(STR)位點。 Y-STR通常可以用於法医學、亲子鉴定和。 Y染色体仅在雄性中发现,且仅通過父亲遺傳,因此任何父系成員中的Y染色体实际上都幾乎相同。这导致父系成員Y-STR样本之间的区别很少。 如果两个人有4个Y-STR完全匹配,他们拥有共同父系祖先的概率近95%,若有5到9个Y-STR完全匹配,概率则将近100%。 命名法 Y-STR由 (HGNC)命名。 另見 串联重复 参考文献 外部链接 …
串联重复()是指DNA中的一个或多个核苷酸前后相连接的重复。 一个例子: : ATTCGATTCGATTCG 其中的ATTCG在这里重复了三次。 几种蛋白质结构域也是由串联重复的氨基酸序列产生,如。但很少有串联重复出现在体内的蛋白质中,多数为人工设计的蛋白。 术语 当重复核苷酸数在10到60之间时,被称为小衛星,低于10则被称为短串联重复或微衛星。 當重复核苷酸只有两个的時候,称为“双核苷酸重复”(如:ACACACAC…)。的常为这种类…
可变数目串联重复序列(,缩写:VNTR)或称可变数目串联重复、变数串联重复,是基因组中的位置,其中短核苷酸序列被组织为串联重复。这些可以在许多染色体上找到,并且经常显示个体之间的长度变化(重复的数量)。 每个变体充当遗传等位基因,允许它们用于个人或父母身份识别。 他们的分析在遗传学和生物学研究,法医学和DNA指纹分析中很有用。 参考文献 外部链接 *
生物細胞中的DNA序列裡面包含許多重複序列(repeated sequence),主要可分為兩大類,分別是串联重复序列(也叫串接重复序列,Tandem repeat)與散置重复序列(Interspersed repeat)。 串联重复和散置重复的区别在于重复的部分是否相邻分布,相邻就是串联重复,不相邻就是散置重复。如:ATGATGATGATG可以看作是关于ATG的串接重复;ATGXATGXXATG可以看作关于ATG的散置重复。两个主要類…
反向重複序列(英文:Inverted repeat)是單鏈的核苷酸序列,其上游與下游的核苷酸是反向互補的序列。起始序列和反向互補序列之間的核苷酸插入序列可以是任何長度,包括零。例如, 是反向重複序列。而當插入序列長度為零時,該複合序列為回文序列。 反向重複和定向重複序列均構成重複出現的核苷酸序列的類型。 參考資料 外部連結 *
LINE1(也称作L1或LINE-1)是DNA转座子长散在核元件(Long interspersed nuclear elements,LINEs)的一种,L1约占人類基因組的17%。 在人类基因组中,大部分的L1都是失活的,但仍保持着反转录转座的能力。 参考文献