內源性反轉錄病毒
內源性反轉錄病毒（Endogenous retrovirus，簡稱ERV）是脊椎動物基因組中的一類具有長末端重複序列（LTR）的基因元件，與LTR反轉錄轉座子非常相似，但除了gag與pol兩基因外還多了編碼包膜蛋白的env基因，可能源於千萬年前感染細胞的反轉錄病毒，這些反轉錄病毒整合進宿主細胞基因組中，大部分已累積許多突變而不再能組裝成完整病毒顆粒，僅能透過細胞複製垂直傳播而不能在細胞間水平傳播，許多甚至已丟失了開放閱讀框，只剩兩側的L…
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假基因
，隨後一個基因發生突變，成爲假基因。一個新的學說認爲，假基因是基因轉錄的RNA逆轉錄並整合到DNA上形成的]] 假基因（Pseudogenes，Pseudo-意爲「假」）是一類染色體上的基因片段。假基因的序列通常與對應的基因相似，但至少是喪失了一部分功能，如基因不能表達或編碼的蛋白質沒有功能。 一般認爲，假基因最初是功能對生物生存並非必要的基因。隨着突變的積累，出現編碼區提前出現終止密碼子、等情況，逐漸變爲無功能的假基因。另外，拷貝數變…
非編碼DNA
非編碼DNA（non-coding DNA，ncDNA）谑称“垃圾DNA”，是指不包含製造蛋白質的指令，或是只能製造出無轉譯能力RNA的DNA序列。此類DNA在真核生物的基因組中佔有大多數。有很长的一段时间科学家认为非编码DNA没有作用，因此这些重复的DNA片段曾被冠以「垃圾DNA」的称号。随着时间的推移，科学家对垃圾DNA的认识逐渐深入，慢慢地发现很多垃圾DNA有其独特的作用，它们在基因剪切等方面起重要的作用。 近年的證據顯示，非編碼…
转座子
转座因子（，亦称为转座元件，跳跃子, 跳躍基因）是一类DNA序列， 转座因子的这种行为，与假基因（Pseudogene）的出现颇有相似甚至相同之处。有些科学家将后者视为“基因化石”，是物种进化的痕迹之一。 芭芭拉·麦克林托克的發現 芭芭拉·麥克林托克 (Barbara McClintock) 在紐約冷泉港實驗室發現了玉米 (Zea mays) 中的第一個转座子。 麥克林托克正在試驗染色體斷裂的玉米植株。 在1944-1945年的冬天，麥…
短散在核元件
短散在核元件（Short interspersed nuclear elements，簡稱SINE）是真核生物基因組中長100至700bp的轉位子序列，屬於反轉錄轉座子，哺乳類基因組約有13%為SINE。SINE與LINE等轉位子皆是「寄生」於生物基因組中的DNA元件，某些情況下可能對生物體有害，但有時細胞也將其用來調控自己的基因表現。 SINE一般不具有长末端重复序列（LTR），其序列從5端至3端可大致分為頭端、中端與尾端三部分，其中…
端粒
[[File:Parallel_telomere_quadruple.png|thumb|right|250px|人類端粒DNA的四連體結構。圖片來源：[https://web.archive.org/web/20130607063640/http://ndbserver.rutgers.edu/atlas/xray/structures/U/ud0017/ud0017.html NDB UD0017]。]] 端粒（）是真核生物染色體末…
内含子
内含子（）是一个基因中非编码DNA片段，它分开相邻的外显子。更精确的定义是：内含子是阻断基因线性表达的序列。DNA上的内含子会被转录到前mRNA中，但RNA上的内含子会在RNA离开细胞核进行转译前被剪除。在成熟mRNA被保留下来的基因部分被称为外显子。真核生物的基因含有外显子和内含子，是前者区别原核生物的特征之一。但是注意，这并不代表原核生物的基因没有内含子，如细菌核糖核苷酸还原酶基因中罕见的有内含子。 内含子可能含有“旧码”，就是在演…
反转录转座子
反转录转座子（Retrotransposon），又譯逆轉錄轉位子，是由RNA介导转座的转座子的元件，在结构和复制上与反转录病毒（retrovirus）类似，只是没有病毒感染必需的env基因。它通过转录合成mRNA，再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座，每转座1次拷贝数就会增加1份，可以增強自己的基因組。因此，它是許多真核生物中数量最大的一类可活动遗传成分。在植物中特别丰富，它们是核DNA的一个主要组成部分。在玉米的基因组49-78…
顺式作用元件
顺式作用元件（cis-regulatory element，CRE），是与结构基因串联的一段非编码DNA序列，一般位于转录点上游，作用是调节邻近基因的转录。CREs是遗传调控网络的重要组成部分，进而控制形态发生、解剖学的发展以及胚胎发育的其他方面。（顺式作用元件是DNA序列，而反式作用因子是调控蛋白） CREs存在于它们调节的基因附近。CRE通常通过与转录因子结合来调节基因转录。单个转录因子可以与许多CRE结合，因此控制许多基因的表达（…