RNA剪接
RNA剪接（，又稱拼接），是一种基因調控(gene regulation)，在分子生物學中，主要是指細胞核內基因資訊在轉錄過程中或是在轉錄過後的一种修飾，即將內含子移除及合併外顯子——內含子與外顯子的名稱是通用於編碼基因的DNA及其轉錄後的RNA——是真核生物的前mRNA變成mRNA的過程之一。剪接過程是剪接體內核糖核酸（RNA）核苷酸之間的一連串生化反應，並由剪接體內小核核糖蛋白（snRNP）中的snRNA負責催化並作用。此外，也有一…
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转录组
转录组（transcriptome）又称转录物组，广义上，指在相同环境（或生理条件）下的一套基因组（一个细胞、一群细胞、组织或生物体中）所能转录出的所有RNA的总和，包括信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）、转运RNA（tRNA）及非编码RNA。 转录组，狭义上，则特指细胞所能转录出的所有信使RNA（mRNA）。 范围 這個術語可用於記錄總集在給定的有機體，或對特定子集的成績單呈現在特定的細胞類型。與基因組不同的是：不考虑突…
RNA測序
短读测序法，对双链cDNA进行测序。 In silico：最后，将这些序列与参考基因组序列进行比对，从而重建并确定哪些基因组区域发生了转录。此类数据可用于注释表达基因的位置、其相对表达水平以及各种可变剪接变体。]] RNA测序（RNA sequencing，RNA-seq）或核糖核酸测序，是指分析特定RNA片段的碱基序列，也就是腺嘌呤（A）、尿嘧啶（U）、胞嘧啶（C）、鸟嘌呤（G）的排列方式。 全转录物组测序（whole transcr…
RNA催化
RNA催化指的是某些RNA分子具有催化特定生化反应的能力。这类具有酶功能的RNA分子被称为核酶（ribozymes）。这一发现颠覆了早期认为只有蛋白质才能作为生物催化剂的传统观念，揭示了RNA在生命活动中除了訊息傳遞之外的重要功能。 发现历史 西德尼·奥尔特曼在研究核糖核酸酶P（RNase P）时发现，该酶的RNA亚基在特定条件下具有催化活性，能够剪切tRNA前体的5'端引导序列。这项工作首次证明了RNA分子可以拥有酶的功能。 托马斯·…
RNA世界學說
。]] RNA世界假說（英語：RNA world hypothesis）理論認為，地球上早期的生命分子以RNA先出現，之後才有蛋白质和DNA；這些早期的RNA分子同時擁有类似现在DNA具有的遺傳訊息儲存功能，以及类似现在蛋白質具有的催化能力支持早期細胞或前細胞生命的運作。 1960年代，多位科学家提出过RNA是原始分子的思想。「RNA世界」一詞則是由諾貝爾獎得主沃特·吉爾伯特於1986年提出，是依據現今RNA具有各種不同型態的催化性質所…
基因表达调控
基因表达调控（，亦称基因调控）是细胞一系列可以增加或减少特定基因产物（蛋白质或RNA）生成的机制。基因表达的任何步骤都可以进行调节。细胞可以视情况通过基因调控表达蛋白质，从而增加生物体适应环境的能力。在多细胞生物中，基因调控驱动胚胎的细胞分化和形态发生，使同一基因组产生具有不同表达谱的细胞类型，这也是演化发育生物学的核心议题。 1951年，芭芭拉·麦克林托克在玉米种皮颜色形成中发现激活子（Ac）和解离子（Ds）两个遗传位点之间的相互作用…
反義RNA
反義RNA（Antisense RNA, 常縮寫爲asRNA），是一種與轉錄產物mRNA（信使RNA）互補的單鏈RNA。部分學者亦將這類RNA稱爲「micRNA」（mRNA干擾互補RNA，），但此名稱並未得到廣泛使用。 反義RNA可通過與mRNA結合來抑制轉譯的進行。可通過化學計量來測定反義RNA的抑制效果。大腸桿菌的R1质粒上的就是反義RNA抑制轉譯的一個實例。反義RNA有很大的作治療疾病的藥物的潛力，惟目前此類藥物只有福米韋生進入市…
內環結構
（髮卡結構），自上往下第二個結構是對稱內環結構，第三、第四、第五個結構是不對稱內環結構]] 內環結構（Internal loop）是一種RNA的高級結構，是RNA雙鏈中兩條鏈上對位的核苷酸殘基的鹼基無法配對產生的膨起環。內環分爲對稱和不對稱兩種。其中，對稱的內環是兩條鏈上對位的核苷酸殘基同時膨起產生的，而不對稱的內環結構中，只有一條鏈上有幾個核苷酸殘基膨起。對稱內環結構不是很穩定，一般只出現在RNA分子的移動過程中。而不對稱內環相對穩定…
T7 RNA聚合酶
T7 RNA聚合酶（英語：T7 RNA Polymerase）是一種RNA聚合酶，分子量約99kDa。專門催化5'→3'方向的RNA形成過程。T7RNA聚合酶具有高度啟動子專一性，且只會轉錄T7噬菌體中位於T7啟動子下游的的DNA或DNA複製品。 此酵素在合成RNA的過程中，需要DNA模板與鎂離子（Mg2+）作為輔因子。牛血清白蛋白（bovine serum albumin，BSA）及精胺（spermidine）對此酵素具促進效果。與細…
RNA聚合酶
RNA聚合酶（RNA polymerase，RNAP，RNApol）又称RNA多聚酶、核糖核酸聚合酶，是以一条DNA链或RNA链为模板，三磷酸核糖核苷为底物，催化合成RNA的酶。 RNA聚合酶分为：DNA指导的／依赖性RNA聚合酶（DNA-directed/dependent RNA polymerase，DdRp）、RNA指导的／依赖性RNA聚合酶（RNA-directed/dependent RNA polymerase，RdRp）…
RNA干扰
递送设计的shRNA和在哺乳动物细胞中的RNA干扰的机制。]] RNA干擾（RNA interference，缩写为RNAi）是指一种分子生物学上由双链RNA诱发的基因沉默现象，其机制是通过阻碍特定基因的转录或翻译来抑制基因表达。当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNA时，该mRNA发生降解而导致基因表达沉默。与其它基因沉默现象不同的是，在植物和線蟲中，RNAi具有传递性，可在细胞之间传播，此現象被稱作全身性RNA干擾（sys…
MRNA去帽
mRNA去帽（mRNA decapping）又稱mRNA脫帽，是細胞中將mRNA的5′端帽水解還原成5′磷酸基的反應。真核生物細胞中正活躍轉譯的mRNA會與多核糖體結合，5′端帽會與eIF4E、eIF4G等起始因子結合而難與去帽酶接觸，在養分缺乏或受病毒感染等逆境中mRNA的轉譯可能被抑制，使5′端帽裸露，等去帽酶可將其5′端帽移除，之後mRNA的5′磷酸基會被RNA外切酶等識別，使mRNA被快速降解 。去帽與mRNA降解可能皆是在處理…
2'-O-甲基鸟苷
*2'-O-甲基鸟苷（2'-O-Methylguanosine，簡稱2′-O-MG或Gm，分子式）是鸟嘌呤与2-O*-甲基-β-D-核糖形成的糖苷，是2'-O-甲基化转录后修饰产物之一，存在于tRNA、rRNA、mRNA和snRNA中。 TRNAiMet s-cerevisiae.svg|釀酒酵母甲硫氨酸的tRNA，Gm位于9号位 TRNA-Phe yeast blanco.svg|釀酒酵母苯丙氨酸的tRNA，Gm位于反密码子（34号位…
2'-O-甲基腺苷
*2'-O-甲基腺苷（2'-O-Methyladenosine，簡稱2′-O-MA或Am）是腺嘌呤与2-O*-甲基-β-D-核糖形成的糖苷，是2'-O-甲基化转录后修饰产物之一，常見于tRNA和rRNA的修飾。 參考文獻
2'-O-甲基胞苷
*2'-O-甲基胞苷（2'-O-Methylcytidine，簡稱2′-O-MC或Cm，分子式）是胞嘧啶与2-O*-甲基-β-D-核糖形成的糖苷，是2'-O-甲基化转录后修饰产物之一，存在于tRNA、rRNA、mRNA和snRNA中。 TRNA-Phe yeast blanco.svg|釀酒酵母苯丙氨酸的tRNA，Cm位于反密码子臂的32号位上 參考文獻
2'-O-甲基肌苷
*2'-O-甲基肌苷（2'-O-Methylinosine，簡稱2′-O-MI或Im，分子式）是次黄嘌呤与2-O*-甲基-β-D-核糖形成的糖苷，是2'-O-甲基化转录后修饰产物之一，存在于rRNA中。 參考文獻
2'-O-甲基尿苷
*2'-O-甲基尿苷（2'-O-Methyluridine，簡稱2′-O-MU或Um，分子式）是尿嘧啶与2-O*-甲基-β-D-核糖形成的糖苷，是2'-O-甲基化转录后修饰产物之一，存在于tRNA、rRNA、mRNA和snRNA中。 參考文獻
小RNA
結合以達成RNA干擾]] 小RNA（，簡稱sRNA）泛指长度小于200个核苷酸（nt）的RNA分子，多為非编码RNA（ncRNA）。真核生物中此類RNA經常可與Ago等蛋白結合以進行RNA干擾，抑制其他基因mRNA的表現。小RNA的種類包括微小RNA（miRNA）、小干扰RNA（siRNA，包含tasiRNA）、piwi作用RNA（piRNA，包含rasiRNA）、小核RNA（snRNA）、小核仁RNA（snoRNA）、小卡哈氏體RNA…
2'-O-甲基化
（2′-O-MA，Am）]] *2'-O-甲基化（2′-O-methylation，2′-O-M）是RNA一種常見的核苷修飾，為核苷中核糖2號位的氫氧基被甲基化而形成甲氧基，此修飾常見於rRNA與snRNA中與轉譯和RNA剪切功能相關的位點，且在mRNA、tRNA、snoRNA與siRNA中也有，三域生物與病毒RNA的A、U、C、G四種鹼基中皆有此修飾，即存在Am、Um、Cm、Gm。目前哺乳類與酵母菌已有超過1200個2'-O-甲基化位…
长链非编码核糖核酸
长链非编码核糖核酸（，简称为lncRNA）指的是长于200核苷酸的不编码蛋白质的转录物（Perkel 2013）。该有些武断的界定将长链非编码核糖核酸与较小的调控核糖核酸区分开来，后者如微核糖核酸（miRNAs）、小干扰核糖核酸（siRNAs）、Piwi互作核糖核酸类（piRNAs）、小核仁核糖核酸（snoRNAs）及其它短核糖核酸（Ma 2013）。 长链非编码核糖核酸的丰度 近年研究显示人类基因组中的转录只有五分之一与蛋白编码基因有…