強化子RNA
強化子RNA（Enhancer RNA，簡稱eRNA）是真核生物基因組中強化子序列轉錄產生的非編碼RNA，長50nt至4000nt之間，此類RNA於2010年由RNA測序與ChIP-seq等大規模測序技術測得。強化子為基因組中與RNA聚合酶Ⅱ、中介體和轉錄因子結合以啟動基因轉錄的重要序列，其轉錄生成的強化子RNA大多留在細胞核中，此類RNA大多不穩定，易被細胞核中的外切體降解，但可能可調控其他基因的轉錄。並非所有強化子皆可轉錄，有研究顯…
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小卡哈爾體RNA
小卡哈爾體RNA（Small Cajal body-specific RNA，簡稱scaRNA）是動物細胞核卡哈爾體中的一類H/ACA匣（H/ACA box）snoRNA，卡哈爾體為細胞組裝核小核糖核蛋白（snRNP）的位置。ScaRNA可在卡哈爾體中參與、、、和等剪接體RNA的甲基化（2'-O-甲基化）與假尿苷化修飾，另外果蠅的scaRNA還參與28S rRNA的修飾。最早被發現的小卡哈爾體為U85 RNA，於2011年在人類細胞中發…
斯皮格尔曼怪
斯皮格尔曼怪是一种仅由218个核苷酸组成的RNA链，可被RNA依赖的RNA聚合酶（也称为Qβ复制酶）复制。它以其创造者索尔·斯皮格尔曼命名，于1965年被首次提出。 发现过程 斯皮格尔曼将一种简单的RNA病毒——Qβ噬菌体的RNA引入含有Qβ复制酶、游离核苷酸和盐类的溶液中。在这种环境下，RNA开始复制。 随后，斯皮格尔曼取出部分复制产物，转移到另一个新鲜试管中，重复这一过程。 由于较短的RNA链能够更快复制，选择压力使RNA链不断缩短…
短髮夾狀RNA
短髮夾狀RNA（，缩写為）是一種如髮夾彎外觀結構的RNA序列，可以經由RNA干擾（RNAi）使基因表現沉默化。shRNA可利用載體導入細胞當中，並藉由U6啟動子來確保shRNA的表現。另外，shRNA可經由切割轉變成為小干擾RNA（siRNA）。 應用上，有效的shRNA很可能成為一種強效性藥物，能針對HBsAg誘發之人類B型肝炎病毒進行治療。shRNA能同時抑制多種基因或對同一基因的不同位點進行抑制，亦可用於克服病毒基因突變所造成的治…
核酸序列
核酸序列（）是指核酸結構中的含氮鹼基，共有四種，分別為A（腺嘌呤）、T（胸腺嘧啶）、C（胞嘧啶）、G（鸟嘌呤），並且有無窮盡的線性排列組合來表達基因，而各個基因都具有獨特的鹼基序列。两个碱基形成一个碱基对，碱基对的配对规律是固定的，即A配對T，C配對G。三个相邻的碱基对形成一个密码子。一种密码子对应一种氨基酸，不同的氨基酸合成不同的蛋白质。在DNA的复制及蛋白质的合成过程中，碱基配对规律是十分关键的。 DNA的字母排列有A、C、G、T，…
假結結構
的一部分。序列來自：]] 假結結構（pseudoknot）是一类RNA三级结构。假结结构包含至少两个茎环结构。其中，一个茎环结构的茎的一半插入了另一个茎环结构的茎结构中。假结结构最初于1982年在中发现。假结结构折叠成类似于绳结的三维结构，但却并不是真正的。 预测与识别 假结结构很难被计算生物学的检测手段查出，因为其对所在环境相当敏感，且具有「重叠的」本质。假结结构的碱基对的嵌入较差，即碱基对与其他的碱基对有一定重叠。这使得通过标准的動…
RNA激活
RNA激活（RNA activation, RNAa) 是一种由小分子RNA介导的特异性基因表达上调机制，是李龙承等于2006年首先在人细胞中发现并命名的。随后，其他研究小组也报道了相似的现象，证明了RNA激活是从人及大小鼠等哺乳类动物到植物及线虫中的保守现象。RNA激活是由靶向基因启动子区域的双链小RNA（dsRNA）分子介导并需要Argonaute（AGO）蛋白的参与。这类能够诱导RNA激活现象（即激活基因表达）的dsRNA被称为小…
义 (分子生物学)
“义”（）在分子生物学中指一段核酸分子（如DNA与RNA）及其互补序列，在指定合成RNA序列（转录）或指定合成氨基酸序列（转译）中的作用性质。 例如，若RNA含有一个可被翻译为多肽的编码区，则该段RNA称为：正义链（股）、有义链（股），或简称：正链、正股、正义、有义；反之，若RNA需要先形成mRNA，再合成蛋白质，则其为：负义链（股）、反义链（股），或简称：负链、负股、负义、反义。 參考
核糖核酸病毒
核糖核酸病毒（），又稱RNA病毒，其遺傳物質為RNA，這些核糖核酸通常是單鏈RNA（ssRNA），但是也可能是雙鏈RNA（dsRNA）。 由RNA病毒感染造成的著名人類疾病包括愛滋病（AIDS）、埃博拉出血熱、嚴重急性呼吸道症候群（SARS）、2019冠状病毒病（COVID-19）、流行性感冒、丙型肝炎、西尼羅河熱、脊髓灰質炎、麻疹。相較於DNA病毒，RNA病毒具有較高的變異性，因為它們缺乏修正錯誤的DNA聚合酶機能。 国际病毒分类委员…
核酶
核酶（），亦稱核糖核酸酵素、RNA酵素，是具有催化特定生物化学反应的功能的RNA分子，类似于蛋白质中的酶。 機制 大多数核酶通过催化转磷酸酯和磷酸二酯键水解反应参与RNA自身剪切、加工过程。在核酶的发现之前，“酶”定义为催化作用的蛋白质，是唯一已知的生物催化剂。 和酶（蛋白质催化剂）相比，细胞内的RNA催化剂是极少的。现在已知的几十种天然RNA催化剂的绝大部分参与RNA的加工和成熟。按它们的作用方式可分为剪切型（把RNA前体的多余部分切…
核糖开关
核酸开关的三维结构]] 核糖開關 （）是位于信使RNA(mRNA)上可结合小分子配基的操控元件。一般情况下，与配基结合的核糖開關通過改變二級结構或高級结構而改變其与下游信使RNA的相互作用狀態，從而達到调控信使RNA所编碼基因的功能。 多数核糖開關僅見於真细菌類生物體中，但也有少數在植物或真菌中被發現。 参考资料
前信使核糖核酸
前信使RNA（，又称前mRNA、mRNA前體）是未成熟的单链信使核糖核酸（mRNA），属于一种“初级转录物”（primary transcript）。前mRNA是从细胞核中的DNA模板通过转录而合成的。前mRNA构成了不均一核RNA（或称核内异质RNA、核内不均一RNA，缩写hnRNA）数量上的主体。 hnRNA（heterogeneous nuclear RNA）这一术语通常被用作为前mRNA的同义词，尽管，在严格的意义上说，hnRN…
核酸結構
核酸結構（）是指如DNA与RNA的核酸。从化学角度上讲，DNA与RNA是非常相似的。DNA与RNA的结构常分为四个不同水平：一级、二级、三级及四级。 能夠直接計算出DNA機械性質的實驗技術相對較新，且要在溶液中進行高解析度觀察也較困難，不過科學家仍然解出了許多關於DNA機械性質的數據。關於DNA機械性質的研究，包括不同型態的DNA雙螺旋、DNA超螺旋、非螺旋型態、鹼基配對鍵結、熔點等。 一级结构 一级结构是由通过磷酸二酯键连接在一起的核…
方向性 (分子生物学)
原子的呋喃糖分子。]] 方向性（）亦称定向性、指向性、指向，在分子生物學与生物化学中，是指单链核酸的端到端化学方位取向。 在单链 DNA 或 RNA 中，按照核苷酸中戊糖环（pentose-sugar-ring）碳原子位次编号化学命名惯例，指定 5′端（five-prime end）代表「上游」和 3′端（three-prime end）代表「下游」{{NoteTag|1=注意：此处使用符号为 prime【′】角分符号，而非 apost…
小核核糖核酸
小核RNA（，常見縮寫為snRNA，也見譯為核内小RNA），是含有100到300碱基的RNA。 它參與真核生物细胞核中RNA的加工。snRNA和許多蛋白質結合在一起成为小胞核核糖核蛋白（snRNPs即small nuclear ribonucleoproteins），參與信使RNA前體（pre-mRNA）的剪接，使後者成為成熟mRNA。 参考文献 外部連結
外切體複合物
。]] 外切体复合物（，或，上下文意思清楚时，可以直接称為），简称外切酶体、外切体，是一种蛋白质复合物，能够降解各种不同的核糖核酸（RNA）。由于复合物表现为核糖核酸外切酶活性，所以被命名为外切体。外切体复合物只存在于真核细胞和古菌中；而细菌中则对应有组成和结构更为简单的“降解体”复合物来发挥类似的功能。 外切体的核心是一个由六个亚基组成的环状结构，外围的亚基都结合在这一环状结构上。在真核细胞中，这一核心存在于细胞质和细胞核（特别是核仁…
RNA誘導沉默複合體
RNA诱导沉默复合物（，縮寫：RISC），是在RNA干扰技术中起作用的重要物质。一定数量的外源性双链RNA（dsRNA）进入细胞后，被类似于核糖核酸酶Ⅲ的Dicer酶切割成短的21~23bp的双链小干扰RNA（siRNA），siRNA与解旋酶和其它因子结合，形成RNA诱导沉默复合物（RISC）。激活RISC需要一个依赖ATP的将小分子RNA解双链的过程。激活的RISC通过碱基配对定位到同源mRNA转录本上，并在距离siRNA 3'端12…
多腺苷酸化
多腺苷酸化（）是指多聚腺苷酸與信使RNA（mRNA）分子的共價鏈結。在蛋白質生物合成的過程中，這是產生準備作轉譯的成熟mRNA的方式的一部份。在真核生物中，多聚腺苷酸化是一種機制，令mRNA分子於它們的3'端中斷。多聚腺苷酸尾（Poly-A Tail）保護mRNA，免受核酸外切酶攻擊，並且對轉錄終結、將mRNA從細胞核輸出及進行翻譯都十分重要。一些原核生物的mRNA都會被多聚腺苷酸化，但多聚腺苷酸尾的功能則與真核生物有所不同。 當DNA…
D臂
]] D臂（）是转运RNA（tRNA）的一个三级结构，包括有两个D茎和一个D环，得名于D环上所含有的特殊碱基二氢尿嘧啶（Dihydrouracil）。 D环的主要功能是用于识别，现在普遍认为D环是氨酰tRNA合成酶（一个将tRNA使之携带氨基酸的酶）的识别位点。D茎也可能有识别作用，但这还有待证明。 这是一个高度可变的区域，它不寻常的鳥苷残基过密结构很值得注意，它似乎对tRNA的三级结构的稳定起到重要作用。 参考文献
3'非轉譯區
、5′非轉譯區、編碼區、3'非轉譯區與多聚腺苷酸尾等序列]] 3'非轉譯區（）簡稱3'-UTR，是信使核糖核酸（mRNA）中，緊接在編碼區之後的序列。mRNA上除了可以轉譯成蛋白質的序列外，還有一些不被轉譯的序列，如5端（5'）的5′端帽與5′非轉譯區（5'-UTR），以及3端（3'）的3′非轉譯區（3'-UTR）與多聚腺苷酸尾。3'-UTR上含有AAUAAA的序列，可被特定蛋白識別，以啟動多腺苷酸化，即切割mRNA，並於切割位點的3端…