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5′端帽

5′端帽(,5′ cap)是在真核细胞和病毒信使核糖核酸(mRNA)的5′端经修饰後形成封闭的帽状结构(端帽),为双核苷酸端点。 5′加帽的過程對建立成熟的mRNA作轉譯非常重要。加帽確保了mRNA在蛋白質生物合成中進行轉譯的穩定性,並在細胞核中是高度調控的過程。 結構 5′端帽是在mRNA分子的5′端,並且包含一個以不正常5′至5′三磷酸鹽鏈結著mRNA的鳥苷。 更多的修飾包括鳥苷的甲基化、及其他mRNA的5′端內頭兩個核酸糖的2′羥…

PiRNA

piRNA全名Piwi-interacting RNA,是一類小型非編碼RNA分子,長度大約是29到30個核苷酸。在许多动物(包括无脊椎动物)的生殖腺中都有被发现,並且可以和PIWI蛋白結合形成piRNA複合物(piRNA complexes,piRCs)。與(RNA silencing)作用有關。 相關文獻 *

顺式作用元件

顺式作用元件(cis-regulatory element,CRE),是与结构基因串联的一段非编码DNA序列,一般位于转录点上游,作用是调节邻近基因的转录。CREs是遗传调控网络的重要组成部分,进而控制形态发生、解剖学的发展以及胚胎发育的其他方面。(顺式作用元件是DNA序列,而反式作用因子是调控蛋白) CREs存在于它们调节的基因附近。CRE通常通过与转录因子结合来调节基因转录。单个转录因子可以与许多CRE结合,因此控制许多基因的表达(…

转录后修饰

转录后修饰(RNA修飾,或稱修飾RNA)是真核细胞中,将初级转录RNA转化为成熟RNA的加工过程。一个很好的例子就是前mRNA转化为成熟的mRNA,其中包括剪接,并发生在蛋白质生物合成之前。这一加工过程对于真核生物基因组的正确翻译至关重要,这是因为真核生物的初级转录RNA中包含既包括用于编码蛋白质的外显子又包含非编码的內含子。 mRNA加工 mRNA前体分子需要通过三个修饰加工才能转化为成熟的mRNA。这三个修饰包括5'端加帽、3'端多…

5′非翻译区

5′非翻译区(5′ UTR)是指成熟mRNA位于编码区(CDS)上游、5′端帽下游不被翻译为蛋白质的区域。 5′非翻译区从转录起始位点开始,在起始密码子的前一个核苷酸处结束,可以包含通过调控元件控制基因表达的元件。在原核生物中,5′非翻译区通常含有核糖体结合位点(RBS),即夏因-达尔加诺序列(AGGAGGU)。 真核生物5′非翻译区的中位数长度一般约为150核苷酸(nt),但有些可长达数千碱基。有些病毒和细胞的基因有着非常长和结构性的…

核仁小核糖核酸

小核仁RNA(Small nucleolar RNAs;snoRNAs)是一類小型RNA分子,可引導核糖體RNA(rRNA)或其他RNA的化學修飾(如甲基化)作用。根據MeSH的分類,此分子屬於小核RNA(snRNA)的一種。可分為C/D box與H/ACA box兩種。 外部連結 [http://www.sanger.ac.uk/Rfam Rfam database of RNA families] [https://web.arch…

LncRNAdb

{{infobox biodatabase |title = lncRNAdb |logo = |description = 长链非编码RNA类 |scope = |organism = |center = 昆士兰大学,布里斯班,澳大利亚 |laboratory = |author = Paulo P Amaral |pmid = Amaral & al. (2011年)。此数据库主要关注那些在试验上已经表征其生物学功能的那些RNA。此…

T臂

]] T臂是tRNA分子上的一个特殊区域,在蛋白质生物合成或翻译过程中充当核糖体的特殊识别位点以形成tRNA-核糖体复合物。 T臂有两个组成部分:T茎和T环。存在两个T茎,每个茎有五个碱基对。T茎1为49-53,T茎2为61-65。由于存在胸苷、假尿嘧啶核苷和胞苷残基,T环通常也称为 TΨC 臂。具有缺乏T环的tRNA的生物体表现出比具有天然tRNA的生物体低得多的氨酰化和EF-Tu结合水平。 参阅 转运核糖核酸 D臂

細胞外RNA

細胞外RNA(Extracellular RNA,簡稱exRNA)又稱胞外RNA,泛指位於細胞外的RNA,包括環境中的RNA,以及多細胞生物組織間或體液(消化液、毒液、血液、尿液、精液、尿液等)中的RNA,已知原核生物與真核生物皆可釋放RNA到細胞外。胞外RNA的具體功能仍不清楚,但可能與個體或細胞間的訊息傳遞有關。 細胞外RNA通常位於外排體等中,或是與蛋白質結合,以避免被核糖核酸酶降解。mRNA、tRNA、miRNA、siRNA與l…

非翻译区

非翻译区(UTR,untranslated region)在分子遗传学中,是指任意一个位于mRNA链编码序列两端的片段。如果其位于5′端,则称为5′非翻译区(或“前导序列”), 反之若位于3′端,则称为3′非翻译区(或“尾随序列”)。 参见 5′非翻译区 3′非翻译区 参考资料 [https://web.archive.org/web/20080923202457/http://www.ba.itb.cnr.it/UTR/ UTReso…

非編碼核糖核酸

非編碼核糖核酸(non-coding RNA,ncRNA)是指各種不轉譯成蛋白質的RNA分子。過去也稱此類RNA為小核糖核酸(sRNA)。不過有些ncRNA分子其實相當大。其他較少使用的同義詞還有非信使核糖核酸(nmRNA)、小非信使核糖核酸(snmRNA)或功能性核糖核酸(fRNA)等。 DNA序列中專門轉錄成非編碼RNA的部分稱為RNA基因或是非編碼RNA基因。非編碼RNA基因用來生產tRNA(轉移RNA)與rRNA(核糖體RNA)…

生物分子复合体

生物分子复合体 ,也称为大分子复合体或生物大分子复合体,是指任何一种由多于一种蛋白质、RNA、DNA、 脂质或碳水化合物分子组成的生物复合物。 这些生物分子之间的相互作用是非共价的。 例如: 蛋白质复合物,其中一些是多酶复合物:蛋白酶体、DNA聚合酶III全酶、RNA聚合酶II全酶、对称病毒衣壳、伴侣蛋白复合物GroEL-GroES、光系统 I、ATP合成酶、 铁蛋白 。 RNA-蛋白质复合物:核糖体、剪接体、穹窿体、SnRNP。细胞核…

引导核糖核酸

嚮導RNA(guide RNA,gRNA),也稱為单链嚮導RNA(single guide RNA,sgRNA)。是作用於動質體(kinetoplastid)體內一種稱為RNA編輯(RNA editing)的後轉錄修飾過程中。也是一種小型非編碼RNA。可與pre-mRNA配對,並在其中插入一些尿嘧啶(U),產生具有作用的mRNA。 參考文獻 *

莖環

莖環(英語:Stem-loop,或譯主幹-迴圈)指一種分子內鹼基配對方式,與因此形成的結構,可發生於單股DNA,但在RNA分子中較為常見。當形成的迴圈較小時,也稱為髮夾(hairpin)或髮夾環。 此種結構會在某些條件下產生,通常是因為同一分子內的兩個區域的核苷酸排列具有迴文現象,這會使兩段序列因為鹼基的配對而形成一個狀似棒棒糖的雙螺旋結構,使RNA產生核酸二级结构。 圖解 一個如此的迴文序列: ---CCTGCXXXXXXXGCAGG…