Kaede
Kaede，一种，起源于自然状态的石珊瑚目的蜿蜒曲紋珊瑚（Trachyphyllia geoffroyi）。Kaede 在日语中意为枫叶。当被紫外光辐照（350-400nm）时，kaede会有从绿色荧光到红色荧光的不可逆光转换。它是116 kDa 的人四聚物蛋白质。据推断作为其主要结构的四聚物结构仅28 kDa。这种四聚体化可能导致kaede结合到其他蛋白质时形成聚合物的可能性较低。 发现 kaede的光转换荧光特性于偶然得知，首先由A…
标签：#蛋白质方法
共 19 篇文章
X射线晶体学
X射線晶體學（）是一門利用X射線來研究晶體中原子排列的學科。更準確地說，利用電子對X射線的繞射作用，X射線晶體學可以獲得晶體中電子密度的分佈情況，再從中分析獲得关于原子位置和化学键的資訊，即晶體結構。 由于包括盐类、金属、矿物、半导体, 冰，催化剂，吸附剂在内的许多物质都可以形成晶体，X射线晶体学已经是许多学科的基本技术。这项技术最初主要被用于测量原子大小、化学键的类型和键长，以及其他的许多物质，尤其是矿物和合金。後來，X射线晶体学也揭…
蛋白质结构预测
蛋白质结构预测（）是指从蛋白质的氨基酸序列中预测蛋白质的三维结构。也就是说，从蛋白質一級結構预测它的折叠和二级、三级、四级结构。结构预测与蛋白质设计的反问题有着根本的不同。蛋白质结构预测是生物信息学与理论化学所追求的最重要目标之一；它在医学上（例如，在药物设计）和在生物技术上（例如，新的酶的设计）都是非常重要的。每隔两年，当前蛋白质结构预测技术的性能在蛋白质结构预测技术的关键测试（CASP）实验中被评测。蛋白质结构预测的网络服务器连续的…
考马斯亮蓝
考马斯亮蓝（Coomassie Brilliant Blue）是两种三苯甲烷衍生物染料（G-250和R-250）的统称，起初开发用于纺织行业，但现在通常用于分析生物化学中的蛋白质染色。考马斯亮蓝G-250比考马斯亮蓝R-250多两个甲基。其名“考马斯”是帝国化学工业下的一个注册商标。 起名和發現 考马斯这个名字最初在19世纪末被一家设在英国布莱克利（Blackley）的染料公司（Levinstein Ltd.）作为贸易名使用，用来售卖一…
電移位切試驗
電移位切試驗（英语：Electrophoretic mobility shift assay）是一種分子生物學試驗，用来檢測蛋白質有没有和核酸發生親和作用。試驗將没有放入核酸的蛋白質和放入核酸的蛋白質作比較，經過凝膠電泳，體積比較大的分子會移動得比較近，而體積比較小的分子會移動得比較遠。通過觀察分子在凝膠中移動形成的條紋，可以知道蛋白質有没有和核酸發生親和作用。
免疫染色
（）免疫染色切片显微图]] 免疫染色（immunostaining）是使用抗体来检测样品中特定蛋白质的染色学问与方法，其涵盖了广泛用于组织学、细胞生物学和分子生物学的技术。 免疫染色学的范围包括了免疫组织化学染色学。
染色质免疫沉淀-测序
染色质免疫沉淀-测序（，简称为ChIP-seq）被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀（ChIP）与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前，ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。 ChIP-seq的应用 ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA…
水母素
水母素（，又譯埃奎明，分子量：相對分子約35000）是一種生物发光蛋白质，屬荧光素酶，具蛋白質一般特性，双缩脲和茚三酮反應均呈陽性，遇硫酸铵時沉澱。高溫時荧光迅速消失。pH低於4時即使在0℃也不穩定，但在10mmolEDTA中相對穩定。溶液在紫外線照射下無螢光，但在加入Ca2+後即顯明亮藍色螢光。水母素EDTA溶液在波长280nm处有吸收峰。等电点pH3.5以下（因水母素吸附於紙上，故用紙電泳很難測準）。在溶液中存在钙离子的情況下，水母…
免疫組織化學
免疫组织化学（immunohistochemistry，IHC）简称 免疫组化，是在组织水平下，进行的免疫细胞化学研究。 免疫組織化學染色（immunohistochemical staining）属一种免疫染色（immunostaining），是在抗體上結合螢光或可呈色的化學物質，利用此经修饰后的抗体与生物组织中的抗原具特异性结合的免疫學原理，选择性地识别组织切片或涂片细胞中的抗原，檢測細胞或組織中是否有“目標抗原”的存在；此方式不只…
西方墨點法
蛋白.]] 西方墨點法（）或稱「蛋白質轉漬法」、「免疫墨點法」（）或「西式吸印雜交」，是在分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法，也是HIV檢測的方法之一。 利用特定抗體能夠專一結合其抗原蛋白質的原理來對樣品進行着色，通过分析着色的位置和着色深度获得特定蛋白质在所分析的细胞或组织中的表达情况的信息，來分析檢測特定蛋白質的生物學檢測技術。 发明者一般认为是美国斯坦福大学的乔治·斯塔克（George Stark）。在尼尔·伯奈…
蛋白质方法
蛋白质方法（）指那些用于研究蛋白质的技术。 其中有研究蛋白质的遗传学方法、检测蛋白质的方法、分离与纯化蛋白质的方法以及其他表征蛋白质结构与功能的方法，其中常常需要首先将蛋白质纯化。 遗传学方法 概念翻译 许多蛋白质永远无法直接被测序，但是它们的氨基酸序列可以通过对已知mRNA序列进行“概念翻译”的手段获知。见：“遗传密码”。 位点专一诱变 检测蛋白质 显微术，蛋白质免疫染色 蛋白质免疫沉淀 免疫扩散 免疫电泳 免疫凝集 免疫印迹 BCA…
蛋白質電泳
分离的蛋白质, 考马斯亮蓝染色法]] 蛋白质电泳（）是根据蛋白质带电量或分子量的大小把不同的蛋白质分开，起到分离纯化的效果。根据带电量分离的叫“等电点电泳”（二維電泳），根据分子量分的是用“十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳”。后者的运用较广泛，与转膜技术，抗原抗体反应，和成像技术合起来就是分子生物学实验室常用的“蛋白质印迹法”（western blotting）。
甲基化DNA免疫沉淀
甲基化DNA免疫沉淀（，简称为MeDIP或mDIP）在分子生物学中是一种大规模（全染色体或全基因组）纯化技术，被用于富集甲基化的DNA序列。该技术包括了通过抗5-甲基胞嘧啶（5mC）的抗体分离出甲基化的DNA片段。该技术由迈克尔·韦伯及其同事所阐述并为切实可行的甲基组水平鉴定工作铺平了道路，这是因为经纯化的甲基化DNA片段可输入到各种高通量DNA检测方法之中，这些方法包括高分辨率DNA微阵列（MeDIP-芯片）或下一代测序（MeDIP-…
染色质免疫沉淀
染色质免疫沉淀（，简称为ChIP）被用来研究细胞内DNA与蛋白质相互作用，具体来说就是确定特定蛋白（如转录因子）是否结合特定基因组区域（如启动子或其它DNA结合位点）——可能定义顺反组。ChIP还被用来确定基因组上与组蛋白修饰相关的特定位点（即组蛋白修饰酶类的标靶）。 此方法的简要过程是：细胞裂解液里的蛋白和相关染色质暂时结合；染色质(DNA)-蛋白复合物被剪切，与所研究蛋白相关的DNA片断被选择性免疫沉淀；相关DNA片断被纯化，顺序被…
电色谱
电色谱是分析化学、生物化学和分子生物学中的一种化学分离技术，用于分离大部分大型生物分子，例如蛋白质 。它是尺寸排除色谱法 （凝胶过滤色谱）和凝胶电泳的组合。这些分离机制基本上是沿着添加了轴向电场梯度的凝胶过滤柱的长度方向进行叠加的。 由于凝胶过滤机理，分子按大小分开，由于凝胶电泳机理，分子按电泳迁移率分开。 此外，还有二级色谱溶质保留机制。 毛细管电色谱 毛细管电色谱（CEC）是一种电色谱技术，其中液相流动相通过电渗作用通过包含色谱固定…
免疫沉澱
免疫沉澱（Immunoprecipitation, IP）是水溶性抗原遇到特異性抗體，結合而形成抗原-抗體複合物在水溶液中沉澱的現象；其可作為一種研究蛋白質間交互作用的生物技術，這種技術是利用抗體與蛋白質的可溶性抗原，進行特異性結合且產生可見的沉澱，來檢測並定量特定的抗原。 利用免疫沉澱，可將含有上千種不同蛋白質的樣品中，分離和濃縮出特定蛋白質。進行免疫沉澱分析法時，抗體常需固定在一個固相基質上。 類型 单个蛋白质免疫沉淀（IP） 使用…
蛋白质测序
蛋白质测序是指通过实验方法对蛋白质的氨基酸序列以及其高级结构进行测定。虽然根据中心法则蛋白质的序列可以通过核酸序列进行推定，但对蛋白质进行测序可以对转录后修饰（PTM）进行更好的追踪。一般来说，如果是对较常见物种的蛋白质进行测序，只要确定出蛋白质的部分序列，就能通过与蛋白质序列数据库进行比对，就能倒推出相关序列来自哪一种蛋白。 最早的蛋白测序法是由弗雷德里克·桑格（Frederic Sanger）发明的。他于1953年对牛胰岛素进行了测…
布拉德福蛋白質定量法
布拉德福蛋白質定量法（Bradford protein assay），亦稱作“考馬斯亮藍法”、“考馬斯藍染色法”（coomassie blue staining），為一種利用光譜學技術分析溶液中蛋白質濃度的技術。本定量法會受待測胺基酸序列影響，此方法為醫生所開發。 原理 。]] 布拉德福蛋白質定量法為一種利用比色法測定蛋白質濃度的化驗法。考馬斯亮藍G-250在酸性環境下，會從紅色型態轉為藍色型態，並與蛋白質緊密結合。在形成這個複合物的過…
蛋白质纯化
蛋白质纯化是指将一种或几种蛋白质从复杂的混合物（通常是细胞、组织或整个器官）中分离的一系列过程。对于表征蛋白质功能、结构和相互作用来说，蛋白质纯化是十分重要的一步。蛋白质纯化过程能够分离混合物的蛋白质和非蛋白质部分，最后将所需蛋白质与所有其他蛋白质分离。将一种蛋白质与其他蛋白质分离通常是蛋白质纯化中最费力的方面。分离步骤通常利用蛋白质大小，物理化学性质，结合亲和力和生物活性的差异。纯化结果可称为蛋白质分离物。 目的 蛋白质纯化可以用于蛋…