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“全物种活树”项目

“全物种活树”项目(,或译“全物种生命树枝”项目)是、数据库项目和LPSN等多个学术团体/机构之间的合作,旨在组建一个包含所有有效发表的细菌和古菌物种的16S rRNA序列数据库。 在某个阶段,还收集了23S序列, 但后来停止了。 目前,对齐的数据集中已包含超过10,950个物种,并且随着新物种的发现或数据库中未收录物种的测序,还会添加更多物种。后者最初占物种总数的7%。 类似(以及最近)的项目包括细菌和古菌基因组百科全书(,),该项目…

釀酒酵母

釀酒酵母(学名:'),又稱麵包酵母或者啤酒酵母、出芽酵母、芽殖酵母。釀酒酵母是與人類關係最廣泛的一種酵母,不僅因爲傳統上它用於製作麵包和饅頭等食品及釀酒,在現代分子和細胞生物學中用作真核模式生物,其作用相當於原核的模式生物大腸桿菌。釀酒酵母是發酵中最常用的生物種類。釀酒酵母的細胞爲球形或者卵形,直徑5–10 μm。其繁殖的方法爲出芽生殖。 許多在人類生物學中重要的蛋白質被發現是首先通過在酵母中研究它們的同源蛋白質;這些蛋白質包括細胞週期…

发酵

发酵()或发酵作用,食品界也作醱酵,是一種「以有機物作為電子供體和的分解代謝」。在食品工業中,發酵可更广泛地指利用微生物或是酶的催化,使食品風味或口感在反應中有所改變的過程。 发酵是人类较早接触的一种生物化学反应,如今在農業、食品工业、化学工业、生質能源中均有广泛应用。 各学界产界定义 最初发酵是用来描述酵母菌作用于果汁或麦芽汁产生气泡的现象,或者是指酒的生产过程,是为原始的发酵。 在生化和生理学中,发酵指微生物在有氧或无氧条件下,分解…

固氮作用

固氮作用簡稱固氮(),是指将空氣中游離態且较为惰性的单质氮(氮气 )轉化為可以被生物新陈代谢所利用的氮化合物(如硝酸盐、氨、二氧化氮)的化學過程。固氮可分为自然固氮以及人工固氮两种,前者还可进一步细分为天然闪电、火山喷发或宇宙辐射等自然现象引发的高能固氮和通过生物酶催化的生物固氮;后者则是通过化学工程进行氮化合物的工业化生产,其中以哈伯法最为常见。 固氮對於地球上的生命至關重要,因為单质氮气的三键共价双原子分子的分子结构十分稳定,导致其…

变形体

、放射太阳虫、棘阿米巴属、泡轮虫属、鳞壳虫属、中性粒细胞吞噬细菌]] 变形体(amoeba),是一种通过伸长或收回伪足来改变自身形状的细胞或生物。变形体并不属于某个单一的生物分类,相反地,在许多真核生物中都能找到它们的存在。变形体细胞不仅存在于原生动物中,也广泛存在于各种真菌、藻类以及动物中。 微生物学家经常会使用术语变形体来称呼那些能施展变形运动的生物。 在旧的分类系统中,大多数的变形体都被分在了肉足纲或肉足亚门(一类通过产生伪足而缓…

分型

分型(英语:Strain)也称株或应变,是生物学分类使用的概念。分型是生物物种内的遗传变体、亚型或培养物。分型通常被视为固有的人工概念,其特点是具有遗传隔离的特定意图。这一点在微生物学中最容易观察到,菌株是从单细胞菌落衍生出来的,通常通过培养皿的物理限制进行隔离。分型在病毒学、植物学和实验研究中使用的啮齿动物中也常被提及。 微生物学 毒株,大流行病研究的优先目标。]] 分型在病毒学里称为毒株,而在细菌学和真菌学里称为菌株。 分型是微生物…

冷休克

冷休克反应是生物突然遇冷的生理反应,特别是冷水。 人类的冷休克反应可能发生于浸入非常冷的水中时 }} 参考来源 [http://wildernessmedicinenewsletter.wordpress.com/2006/10/26/introduction-to-frozen-mythbusters/ Introduction to Frozen Mythbusters and Myth #1]. Wilderness Medici…

GFAJ-1

GFAJ-1是一种杆状盐单胞菌科()嗜极细菌。该细菌能在缺乏磷元素的环境中吸收通常被认为有剧毒的砷元素进入细胞内,并利该元素合成类似ATP、磷脂等有机化合物或对蛋白质进行翻译后修饰。这种细菌甚至能用砷元素合成DNA与RNA等重要的生物高分子。 长期以来,大部分假说都认为外星生命或与地球生命有着截然不同的化学组成。如这项发现被确认,其将在很大程度上拓宽科学界以往对构成生命的基本元素的认知,还可能为科学家探索外星生命提供新参考依据。 发现历…

拟核

中的拟核]] 拟核(英语:nucleoid,意为“类似细胞核”),又称类核或核区,是细菌和古菌细胞内主要容纳并组织染色体DNA、但不由核膜包围的区域。拟核不是细胞核,也不是一种独立的膜性细胞器。 多数细菌通常具有一条环状双链DNA染色体,但也有具有线性染色体、多条染色体或多拷贝基因组的物种。一个细胞内的染色体拷贝数还会随物种、生长条件和细胞周期而变化。 拟核主要由染色体DNA及与之结合的RNA和蛋白质构成。细菌拟核的空间组织涉及DNA超…

疾病细菌说

的细菌:霍乱弧菌,扫描电子显微镜图像]] 疾病细菌说、细菌致病理论或病原体致病说(),是目前公认与许多疾病有关的科学理论。该理论认为,被称为病原体(如细菌、原生生物、真菌、病毒、朊毒體、类病毒)或微生物可以致病。这些微小的生物体非常小,不使用科学工具(如:利用显微镜放大)就无法看见,它们会侵入人类或其它动物、植物甚至细菌体内。它们在宿主体内生长繁殖可导致疾病。英语中“germ”不仅指细菌,还指任何类型的微生物,例如原生生物或真菌,或其他…

细菌

“候选属级 艾吉里细菌属”"Ca. Aegiribacteria" “好氧球菌属” "Aerosphaera" "Anhaltia" “古颤藻菌属” Archaeoscillatoriopsis “蓝藻菌类属” Cyanotheca “细丝藻属” "Eoleptonema" “铁链菌属” "Ferrimonilis" “候选属级 铁层菌” "Ca. Ferristratum" "Hafniella" "Hygrocrocis" "Kou…

共生體學說

共生体學說(),又稱內共生學說(),是關於真核生物細胞中的一些自主胞器ㄧ粒線體和葉綠體起源的學説。根據這個學説,它們起源於共生於真核生物細胞中(之内)的原核生物。這種理論認爲粒線體起源於好氧細菌(很可能是接近於立克次體的變形菌門細菌,特別是()),而葉綠體源於内共生的光合自營原核生物的藍細菌。這個理論的證據非常完整,目前已經被廣泛接受。 歷史 1905年,最先提出葉綠體是由原先的内共生體形成的這一想法,隨後1920年代伊凡·沃林提出了對…

混合營養生物

混合營養生物(),是指在從完全自養的到完全異養的連續體上,混合使用不同的能量和碳源的生物,而非具有單一的營養模式。據估計,混合營養生物佔所有微小浮游生物的一半以上。真核生物混合營養生物有兩種類型。有些擁有自己的葉綠體 - 包括內共生體提供的葉綠體。有些則是透過盜食質體(kleptoplasty)或與獵物的共生關係,或透過 「奴役 」獵物的細胞器而獲得它們。 可能的組合有光养與化能、(Lithotroph)與(Organotroph)(滲…

醫事檢驗師

醫事檢驗師(// ,舊稱為 ,又稱臨床醫學檢驗技術師、医学实验室科学家,簡稱醫檢師;港澳地區稱為医务化验师),是指專門負責檢驗醫學的專業醫事人員。 60%~70%的醫療重要決策來取決於檢驗醫學的結果,檢驗醫學在現代醫學的地位可見一斑。 醫檢師工作範圍十分廣泛,檢驗包含血液、尿液、精液、羊水、糞便、傷口膿液、痰液、腦脊髓液、胸水、腹水等各種體液或分泌物,以進行臨床生化學、臨床血液學、、臨床血清免疫學、臨床病毒學、臨床鏡檢學、臨床微生物學、…

血清型

血清型(serotype,serovar)是指利用血清学方法,在细菌或病毒的一个物种内或在不同个体的免疫细胞间区分出的类型。血清分型(serotyping)可将同种或同亚种的机体或细胞按不同的表面抗原在流行病学上或免疫学上进一步鉴别分型。 例如肠道沙门氏菌(Salmonella enterica)此菌种有6个亚种,再进一步细分为超过2,600个血清型,其中一血清型写法为:Salmonella enterica subsp. enteri…

皮肤菌群

和占主导地位的细菌]] 皮肤菌群(英语:Skin flora)也称为皮肤微生物群(英语:Skin microbiota),通常是指存在于人类皮肤上的微生物群落。 其中占大多数的是细菌,人体皮肤上约有1000种细菌,分别来自19个门。大多数存在于表皮的表层和毛囊的上部。 皮肤菌群通常是非致病性的,并且是偏利共生(对宿主无害)或互惠共生的(双方获益)。细菌可以提供的好处包括通过竞争营养、分泌化学物质或刺激皮肤的免疫系统以防止短暂的致病生物在…

病原体

(host-pathogen interface):鸡的回肠(宿主)实验性感染人类沙门菌(病原)后18小时透射电镜显微图。]] (systemic response)是植物受病原侵染后,能从感染部位蔓延至全株的反应。此反应利用生物、物理、化学因子,诱导植物系统获得抗性,此抗性称作系统获得抗性(systemic acquired resistance,SAR)。当另一病原再次感染此植物时,免疫系统能更快地做出反应。]] 病原體()簡稱病原…

阿提斯微生物博物館

阿提斯微生物博物館(,簡稱:),是一間位於阿姆斯特丹的微生物博物館,隸屬於阿提斯皇家動物園。Micropia於2014年9月30日開幕,是世界上第一間以微生物學為主題的博物館。 該博物館致力於推廣微生物學知識,強調微生物在人類生活中不可或缺的重要性。 該館展示日常生活中的微生物,並在顯微鏡下展示活體微生物培養(包括藻類、細菌、真菌、黏菌、線蟲、水蚤、水熊蟲等)。博物館配有微生物學實驗室,負責更換館內微生物樣本,以及提供解說導覽。 201…

微生物

细菌。]] 微生物(或)是指体积微小、通常需借助显微镜才能清楚观察的生物个体或群体。微生物学研究对象包括细菌、古菌、许多单细胞或显微尺度的真核生物,如原生生物、真菌和藻类;在实际研究和医学语境中,病毒、类病毒和朊毒体等非细胞性因子也常被一并讨论,但其是否属于“生物”依语境而定。 微生物几乎遍布地球各类环境,从土壤、水体、空气到动植物体内外均可发现。部分微生物能在高温、低温、强酸、高盐或高压等极端环境中生存。微生物在生态系统中参与有机质分…

螺旋菌

屬一種螺旋菌,常造成食源性胃肠道疾病]] 螺旋菌()係按形態分出的一種細菌種類。其種類次於球菌、桿菌,在細菌家族中位列第三。。螺旋超過一週的螺旋菌被称爲螺旋菌,而不滿一週的則被稱爲弧菌。另外,有鞭毛、體大而柔軟、螺旋超過6週的細菌被稱爲螺旋體(Spirochaeta)。 螺旋菌 螺旋菌是一種擁有剛性螺旋形菌體的革蘭氏陰性菌。其菌體的螺旋超過了一週。其典例有: 空腸彎曲桿菌:一種食源性致病菌,能引起彎曲菌病 幽門螺桿菌:消化性潰瘍的元兇,…