“全物种活树”项目(,或译“全物种生命树枝”项目)是、数据库项目和LPSN等多个学术团体/机构之间的合作,旨在组建一个包含所有有效发表的细菌和古菌物种的16S rRNA序列数据库。 在某个阶段,还收集了23S序列, 但后来停止了。
目前,对齐的数据集中已包含超过10,950个物种,并且随着新物种的发现或数据库中未收录物种的测序,还会添加更多物种。后者最初占物种总数的7%。
类似(以及最近)的项目包括细菌和古菌基因组百科全书(,),该项目专注于细菌和古菌的全基因组测序。
树
该树是通过最大似然法分析创建的,未使用引导法:因此,准确性会因大小而降低,并且许多门级分支(例如厚壁菌门)无法正确解析。(真核生物未在分析中出现)。此系统发育树是基于16S rRNA的LTP_08_2023的总结,包含截至2023年8月所有已有效发布名称的模式种。
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参阅
- 细菌门分支顺序 (乌斯,1987年)
- 细菌门分支顺序 (古普塔,2001年)
- 细菌门分支顺序 (卡弗利尔-史密斯,2002年)
- 细菌门分支顺序 (拉佩和乔瓦诺尼,2003年)
- 细菌门分支顺序 (巴蒂斯图齐等人,2004年)
- 细菌门分支顺序 (奇卡雷利等人,2006年)
- 细菌门分支顺序 (基因组分类学数据库,2018年)
- 细菌门
- 古菌属列表
- 细菌属列表
- 细菌目列表
- LPSN(原核生物标准命名列表),公认的细菌和古菌名称列表
参考文献
外部链接
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