“全物种活树”项目
“全物种活树”项目(,或译“全物种生命树枝”项目)是、数据库项目和LPSN等多个学术团体/机构之间的合作,旨在组建一个包含所有有效发表的细菌和古菌物种的16S rRNA序列数据库。 在某个阶段,还收集了23S序列, 但后来停止了。 目前,对齐的数据集中已包含超过10,950个物种,并且随着新物种的发现或数据库中未收录物种的测序,还会添加更多物种。后者最初占物种总数的7%。 类似(以及最近)的项目包括细菌和古菌基因组百科全书(,),该项目…
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“全物种活树”项目(,或译“全物种生命树枝”项目)是、数据库项目和LPSN等多个学术团体/机构之间的合作,旨在组建一个包含所有有效发表的细菌和古菌物种的16S rRNA序列数据库。 在某个阶段,还收集了23S序列, 但后来停止了。 目前,对齐的数据集中已包含超过10,950个物种,并且随着新物种的发现或数据库中未收录物种的测序,还会添加更多物种。后者最初占物种总数的7%。 类似(以及最近)的项目包括细菌和古菌基因组百科全书(,),该项目…
ε-變形菌(学名:Epsilonproteobacteria)是一个革兰氏阴性细菌纲。此纲是五种變形菌中最小的纲,只有少数属被鉴定出来,包括沃林氏菌、幽门螺杆菌和弯曲菌。2021年ICSP修订细菌分类学之前,此纲被归类为假單胞菌門,修订之后被归类为弯曲菌门 历史 2005年,Garrity等人基于16S rRNA基因序列分析,将变形菌门划分为五个纲,其中ε-变形菌纲为第五个纲,由弯曲菌目形成。 2017年,Waite等人通过对16S和2…
卢瑞亚-德尔布吕克实验是指生物学家萨尔瓦多·卢瑞亚与马克斯·德尔布吕克在1943年所做的一些生物学实验,这些实验证实细菌对噬菌体的抵抗能力主要来自于自然选择而非适应性变异。因此,该研究得出结论:达尔文关于自然选择作用于随机突变的理论同样适用于细菌及更复杂的生物体。马克斯·德尔布吕克与萨尔瓦多·卢瑞亚因这项工作等成就,共同荣获1969年诺贝尔生理学或医学奖。 分子生物学 对噬菌体T1的抗性机制似乎是由于fhuA基因的突变所致——fhuA是…
德氏乳杆菌保加利亚亚种(學名:)简称保加利亚乳杆菌(学名:),是德氏乳杆菌的一个亚种,目前被广泛的应用在優格(酸奶)制作的过程当中。 该亚种最初由保加利亚微生物学家赛德蒙·格里戈罗夫在1905年时确定并以其祖国的名字命名,1984年时韦斯等人又将其确认为德式乳杆菌的亚种。 形态 保加利亚乳杆菌外观为长杆形的革兰氏阳性菌,摄入乳糖,产生乳酸。最适宜的生长温度为40℃左右、pH值在4.6-5.4的嗜酸菌。不能自主运动,不产生孢子。 参考文献
觀察到的L型細菌。這種細菌沒有原核生物普遍擁有的高電子密度的細胞壁。本圖的比例尺為500納米]] L型細菌()係一類在突變後細胞壁缺損的細菌,能在固體培養基上形成煎蛋形的小菌落。L型細菌必須生活在高滲透壓的環境中,否則就會裂解死亡。其細胞膨大,對滲透壓十分敏感。其之所以叫做L-型細菌,是因這類細菌是在1935年最早由英國的發現的,故以李斯德研究所名稱的首字母「L」為其命名。 兩種L型細菌並不完全相同。不穩定L型細菌,即原生質球(Sphe…
GFAJ-1是一种杆状盐单胞菌科()嗜极细菌。该细菌能在缺乏磷元素的环境中吸收通常被认为有剧毒的砷元素进入细胞内,并利该元素合成类似ATP、磷脂等有机化合物或对蛋白质进行翻译后修饰。这种细菌甚至能用砷元素合成DNA与RNA等重要的生物高分子。 长期以来,大部分假说都认为外星生命或与地球生命有着截然不同的化学组成。如这项发现被确认,其将在很大程度上拓宽科学界以往对构成生命的基本元素的认知,还可能为科学家探索外星生命提供新参考依据。 发现历…
裏的嗜熱生物]] 嗜極生物(),或者稱作嗜極端菌,是可以(或者需要)在中生長繁殖的生物,通常爲單細胞生物。与此相对的,在较为温和的环境中生活的生物,可称为中温生物(Mesophile)和(Neutrophile)。“極端”環境的定義是人類中心論的,而對這些生物本身而言,這些環境卻是很普通的。也就是說,嚴格來講,這些“極端環境”是一些生物可以生存的地方,不論人類認爲這些地方是普通的還是極端的。舉例來説,人可以被分類爲嗜溫好氧生物。 當我們…
“候选属级 艾吉里细菌属”"Ca. Aegiribacteria" “好氧球菌属” "Aerosphaera" "Anhaltia" “古颤藻菌属” Archaeoscillatoriopsis “蓝藻菌类属” Cyanotheca “细丝藻属” "Eoleptonema" “铁链菌属” "Ferrimonilis" “候选属级 铁层菌” "Ca. Ferristratum" "Hafniella" "Hygrocrocis" "Kou…
双球菌(,复数)是球菌的一类,其细胞沿一平面分裂,而子细胞成双排列。代表种类有脑膜炎双球菌(Neisseria meningitidis)、淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)等。 參考文獻
綠彎菌門(学名:Chloroflexota)是一類通過光合作用產生能量的細菌,又稱作綠非硫細菌,儘管還有一部分稱作熱微菌的細菌也屬於綠非硫細菌。它們具有綠色的色素,包括作爲反應中心的菌綠素a和作爲天線分子的菌綠素c,通常位于稱作綠体的微囊中。 典型的綠彎菌門細菌是線形的,通過滑行來移動。它們是兼性厭氧生物,在光合作用中不產生氧氣,不能固氮。利用,而不是常見的卡爾文途徑來固定二氧化碳。細胞壁的肽聚糖中含有D-鳥氨酸,類似于革蘭氏陽性菌,但…
產金菌門(学名:Chrysiogenota)是一支獨特的細菌,目前只發現了一個種,即砷酸產金菌(Chrysiogenes arsenatis)。它具有獨特的生活方式和生化過程。它經營化能無機自養,利用對绝大多數生物劇毒的砷作爲其營養。砷酸產金菌利用亞砷酸鹽作爲電子供體,將其氧化成砷酸鹽。 砷酸產金菌可以在富含亞砷酸鹽的地方被發現,比如被砷污染的湖底或者含砷的金礦中。 下属分类 本门包括以下纲: 參見 *細菌分類表
是傳統的菲律宾食品,是由椰子水用木質醋酸菌發酵後所得]] 細菌纖維素()也稱為生物纖維素或生技纖維素,是由特定细菌所產生,化學式為的纖維素。纖維素是大部份植物支持自身的材料,不過一些細菌也會產生纖維素,特別是驹形杆菌属、醋杆菌属、八叠球菌属及农杆菌属的細菌。細菌纖維素和一般的植物纖維素有不同的特性,細菌纖維素的特性包括高純度、強度、摺疊性,以及其較強的保水力。大多數的細菌在其自然棲息環境下,會合成細胞外的多糖(像是纖維素)來形成細胞外的…
綠菌門是一類進行不產氧光合作用的細菌。這類細菌沒有已知的近親,最近的類群爲擬桿菌門。 綠菌門通常不活動(一個種具有鞭毛),形狀爲球狀、桿狀或者螺旋狀。其生存要求無氧環境和光。它們的光合作用利用一種稱作綠體的微囊中附在膜上的菌綠素c、d和e吸收光能。 綠硫細菌还在印度尼西亞的馬塔納湖被發現,在約110-120米的深度。物種可能包括綠硫桿菌。 參見 細菌分類表 着色菌目 綠非硫細菌 紫細菌 參考資料
屬一種螺旋菌,常造成食源性胃肠道疾病]] 螺旋菌()係按形態分出的一種細菌種類。其種類次於球菌、桿菌,在細菌家族中位列第三。。螺旋超過一週的螺旋菌被称爲螺旋菌,而不滿一週的則被稱爲弧菌。另外,有鞭毛、體大而柔軟、螺旋超過6週的細菌被稱爲螺旋體(Spirochaeta)。 螺旋菌 螺旋菌是一種擁有剛性螺旋形菌體的革蘭氏陰性菌。其菌體的螺旋超過了一週。其典例有: 空腸彎曲桿菌:一種食源性致病菌,能引起彎曲菌病 幽門螺桿菌:消化性潰瘍的元兇,…
分裂(),又叫裂殖,在生物学中是指一个细胞(或身体、种群或物种)分为两个或多个部分,以及这些部分再生为细胞(身体、种群或物种)。通常是單細胞生物所形的生殖方式。該種生物直接行細胞分裂後就可產生兩個(或更多)新個體。例如:草履蟲、變形蟲以及多數的細菌等。 二分裂()产生两个细胞、种群或物种等,而複分裂()产生多于两个的细胞、种群或物种等。 註釋 參見 細胞質分裂, cell division in eukaryotes Fission-f…
的結構圖|400px]] 細菌(真細菌)的細胞結構獨特,與古菌和真核生物細胞結構有很大不同。 細菌的細胞結構相比真核生物,要簡單很多。細菌最外層的結構爲細胞壁。往內,則依次爲細胞膜、細胞質及擬核(環形DNA)。部分細菌還具有莢膜、芽孢、鞭毛等特殊結構。另外,細菌還有膜內摺形成的間體結構。與真核細胞不同,細菌一般來說沒有核膜包被的細胞核,也沒有複雜的內膜系統。其唯一的細胞器爲核糖體。通過革蘭氏染色,可以將細菌分爲革蘭氏陽性菌與革蘭氏陰性菌…
細菌孢子是一種孢子或類孢子的結構,由細菌所生成。其中包括內孢子,(藍藻綠藻的絲狀體的)厚壁孢子,以及放線菌和固氮菌生成的孢子。 在細菌中,孢子的形成僅僅是一種在惡劣環境中生存的辦法,而非一種生殖的方式。 細菌孢子擁有以下的特色: #能夠忍受極端的乾燥; #部分能生存於零下的溫度; #部分會散布毒性的化合物,例如蘇力菌合成Cry毒素。 細菌孢子的環境耐性很強。舉個例子,破傷風桿菌和炭疽桿菌有能力存活於土壤中數年的時間。細菌孢子的發現起源於…
螢光假單胞菌,又稱螢光菌(學名Pseudomonas fluorescens),為革蘭氏陰性菌,是一種常見的細菌,廣泛存在於自然界之中。对植物无致病作用(non-pathogenic),使用抗生素莫匹羅星可以從這種菌分离出。 名稱由來 螢光假單胞菌之所以稱之螢光菌是因為當生存在缺乏鐵的環境下,便會產生出一種稱為鉗鐵化合物(siderophore)的螢光色素,因此得名。 外部連結 *http://www.pseudomonasfluore…
益生菌()是指一般認為食入後對宿主(如動物或人類)有正面效益的食入性微生物;而益菌生(益生元)(Prebiotics)則指透過飲食補充,可增加腸內益菌生長(養菌)之物質,包括寡糖(低聚糖)、膳食纖維(水溶性、非水溶性),及某些中草藥等。含有益生菌及益菌生兩者成分的製劑稱為合生元(助生質)(Synbiotics)。而利用多種共生乳酸菌培養後,將菌體物質及其分泌物萃取之產物,稱為益生素(Biogenics),亦稱乳酸菌生成物質萃取物(ALB…
黄素氧还蛋白()是一种含有黄素单核苷酸的细菌电子传递蛋白。黄素氧还蛋白在结构上的特点是具有五股平行的β-折叠以同一侧围绕着一个α-螺旋。此蛋白广泛分布于厌氧菌、蓝细菌以及一些真核藻类之中。 参考文献 外部链接 [https://web.archive.org/web/20071109222936/http://biochemistry.wur.nl/Biochem/research/Mierlo/opening.htm "Flavodo…