酮体
、乙醯乙酸、β-羟丁酸。]] 酮体（）是脂肪酸在肝内β-氧化时特有的中间代谢产物，它包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟丁酸三种化合物。不过严格意义上来讲，β-羟丁酸是一种羟基酸，而非酮类。当机体处于饥饿、禁食或某些病理状态（如糖尿病），酮体才会大量堆积。酮体可以提供一种替代的能源，对某些组织细胞来说非常重要。 身體在上述状态时，脂肪动员加强，大量的脂肪酸被肝细胞吸收和氧化；而同时为了维持血糖浓度的稳定，也會刺激体内糖質新生作用。糖質新生所需原料…
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磷酸单酯水解酶
磷酸单酯水解酶（或 phosphomonoesterases）是一种催化O-P键水解的酶，利用半胱氨酸残基或金属离子攻击磷原子来进行亲核取代反应。 这类酶的EC編號为：3.1.3. 例子包括： 酸性磷酸酶（acid phosphatase） 碱性磷酸酶（alkaline phosphatase） fructose-bisphosphatase glucose-6-phosphatase 磷酸果糖激酶2（phosphofructokina…
代谢物组
、转录组、蛋白质组、和代谢物组（脂质组、糖组）之间关系的一般模式。]] 代谢物组（）是指在一个生物样品中发现的完整的一套小分子化学物质。所述生物样品可以是一个细胞，一个细胞器，一个器官，一个组织，一个组织提取物，一个生物流体或整个生物体。在给定的代谢物组发现的小分子的化学物质可能既包括内源性代谢物，它们是由生物体天然产生的（如氨基酸，有机酸，核酸，脂肪酸，胺，糖，维生素，辅因子，颜料，抗生素等），又包括外源化学物质（如药物，环境污染物，…
代谢流量
代谢流量或代谢通量是分子通过代谢途径的周转速率。在細胞內，流量由途徑中涉及的酵素調節不同條件下途徑的活性，對於所有代謝途徑至關重要。因此，流量在代谢网络建模中非常受关注，通过流量平衡分析和代谢控制分析来分析流量。 通过这种方式，流量是物质通过由代谢物和辅因子连接的代谢网络的運動，因此是使用單一特徵來描述整個代謝網絡活動的一種方式。 代谢流量 透過單獨考慮反應步驟來描述代謝物通過途徑的流量是最簡單的。每个反应的代谢物流量 (J) 是正向反…
异化作用
异化作用（），又稱作分解代謝，是生物的新陈代谢途径，将分子分解成更小的单位，并被氧化释放能量的过程，或用于其他合成代谢反应释放能量的过程。 异化作用将大分子（例如多糖、脂类、核酸和蛋白质）分解成更小的单元（例如分别为单糖、脂肪酸、核苷酸和氨基酸）。 细胞使用从分解聚合物释放的单体来构建新的聚合物分子，或进一步将单体降解为简单的废物产物，释放能量。 细胞废物包括乳酸、乙酸、二氧化碳、氨和尿素。 呼吸作用是异化作用中重要的过程。根据生物的呼…
过氧化物酶体
期间HEK 293细胞中过氧化物酶体（白色）的分布]] 过氧化物酶体（）是一种被称为的细胞器，几乎存在于所有真核细胞中。它们参与，，D-氨基酸和多胺的异化作用，活性氧类的还原-尤其是过氧化氢-以及缩醛磷脂的生物合成，即-对于哺乳动物大脑和肺的正常功能至关重要。它们还含有大约10％的在戊糖磷酸途径中两种酶全部活动，这对能量代谢很重要，锥虫中的糖酵解（“(glycosome)”），以及某些酵母中的甲醇和/或胺氧化和同化。 過氧化體用外表的單…
细胞色素P450
细胞色素P450（，缩写 CYP）是包含血基質（heme）作为辅因子的一个庞大的酶超家族，具单加氧酶功能。 CYP酶已在所有生命界中被发现：动物，植物，真菌，原生生物，细菌和古菌以及病毒。 但是，它们并不是无处不在。 例如，在大肠杆菌中尚未发现它们。 已知有超过50,000种不同的CYP蛋白。 CYP通常是电子转移链中的末端氧化酶，大致可归类为(P450-containing systems)。 术语“ P450”是从处于还原状态并与一…
遗传性代谢缺陷
遗传性代谢缺陷（）在新陳代謝過程中，除了製造出營養外，如果身體未能將食物其他部份成功代謝成為可以從排泄器官（如消化系統，泌尿系統及排汗系統、呼吸系統等）排出之廢棄物，這些廢棄物將遺留在身體器官裡，最終會對身體產生不良後果，形成毒害。 外部連結 The National Institutes of Health offers the[http://rarediseases.info.nih.gov/ office of rare dise…
初级代谢产物
初级代谢产物（，或称为初生代谢产物）是一种直接涉及到正常生长、发育与生殖的代谢产物。它通常在生物体中执行生理功能（即内在功能）。初级代谢产物通常存在于许多生物体或细胞中。 它也被称为中心代谢产物，其具有更加有限的意义（存在于任何自主生长的细胞或生物体中）。一些常见的初级代谢产物包括：乙醇，乳酸和特定的氨基酸。 相反地，次级代谢产物不会直接涉及这些过程，而是具有重要的生物学功能。次级代谢产物通常存在于分类学限制的生物体或细胞（植物，真菌，…
Leloir途径
[[File:Leloir pathway.png|thumb|right|400px|alt=Steps in the Leloir pathway of galactose metabolism.|Leloir途径代谢半乳糖的中间产物和酶 }}
咪唑-4-乙醛
咪唑-4-乙醛或咪唑-5-乙醛是一种含氮有机化合物，化学式为C5H6N2O，它是组胺的代谢产物。它可以被NAD依赖性乙醛脱氢酶进一步氧化，生成咪唑-4-乙酸。 参考文献
胆色素原
胆色素原（，亦称为卟胆原，简称为PBG）是一种作为卟啉(Porphyrin)生物合成中间体的吡咯(Pyrrole)衍生物，而卟啉(Porphyrin)為合成血基質的原料之一。 由两分子(下圖dALA) 在(又稱下圖之，圖上ALA dehydrogenase為誤植)催化下缩合、环化而成。 而后4分子胆色素原在（下圖右側 PB deaminase）催化下，将脱去侧链上的氨基，缩聚为含有4个吡咯(Pyrrole)环的。(見下圖右側 Hydro…
核酶
核酶（），亦稱核糖核酸酵素、RNA酵素，是具有催化特定生物化学反应的功能的RNA分子，类似于蛋白质中的酶。 機制 大多数核酶通过催化转磷酸酯和磷酸二酯键水解反应参与RNA自身剪切、加工过程。在核酶的发现之前，“酶”定义为催化作用的蛋白质，是唯一已知的生物催化剂。 和酶（蛋白质催化剂）相比，细胞内的RNA催化剂是极少的。现在已知的几十种天然RNA催化剂的绝大部分参与RNA的加工和成熟。按它们的作用方式可分为剪切型（把RNA前体的多余部分切…
硫循环
硫循环（）是一些过程的集合，其中包括硫在矿物质（包括水体）和生命系统之间移动进出过程。这样的生物地质化学循环对于地质学是重要的，因为它们会影响多种矿物质。生物地质化学循环对于生命也很重要，因为硫是一个基本元素，是作为许多蛋白质和辅因子的组成成分。 硫循环的步骤是： 矿化的有机硫成为无机的形式，例如硫化氢（H2S），元素硫，以及硫化矿物。 氧化的硫化氢，硫化物和元素硫（S），变为硫酸盐（SO42−）（SO42-）。 硫酸盐还原为硫化物。 …
呼吸作用
结构]] 呼吸作用（），是生物体细胞把有机物氧化分解並转化能量的化學过程，该过程也稱為釋放作用。无论是否为自养，细胞内完成生命活动所需要的能量都是来自呼吸作用。在真核细胞中，线粒体是與呼吸作用密切相关的细胞器，呼吸作用的幾個關鍵性步驟都在其中進行。 呼吸作用是一種酶促氧化反应。雖名為氧化反應，不論有否氧气参与，都可称作呼吸作用（這是因為在化學上，有電子轉移的反應過程，皆可稱為氧化）。有氧气参与時的呼吸作用，稱之為有氧呼吸；没氧气参与的反…
脫氨作用
脫胺作用（，亦可称为脱胺基），是指移除分子上的一個氨基。人類的肝臟經由脫氨作用將氨基酸分解，當氨基酸的氨基被去除之後，會轉變成氨。由碳及氫所組成的殘餘部分，則回收或氧化產生能量。對人體而言，氨具有毒性，因此某些酵素將會在尿素循環中將二氧化碳分子附加其上，使氨轉變成尿素或尿酸。之後這些尿素及尿酸再經由尿液排出體外。 經脫氨作用成為尿嘧啶]] 除了氨基酸之外，DNA的構成物之一胞嘧啶（C）也會因為脫氨作用而轉變成尿嘧啶（U）；胞嘧啶受到甲基…
代谢网络
代谢网络（）是完整的一决定细胞生理学和生物化学属性的整套代谢与物质过程。这些网络包含了代谢的化学反应以及指导这些反应的调整性相互作用。 随着基因组测序完成，重建从细菌到人类的有机体中的生化反应网络现已成为可能。一些代谢网络已经上线：京都基因与基因组百科全书（KEGG），EcoCyc ，BioCyc 与metaTIGER 。 对于学习及代谢建模来说，代谢网络是十分强大的工具。 File:MetabolicNetwork.png| File…
丙二酰辅酶A
丙二酰辅酶A（，或称为丙二酸单酰辅酶A）是一种辅酶A的衍生物。 作用 该化合物在脂肪酸的生物合成的延伸阶段以及聚酮化合物的生物合成中起到重要作用。 丙二酰辅酶A同时也被用于使α-酮戊二酸跨过线粒体膜转运到线粒体基质中。 脂肪酸的生物合成 在脂肪酸合成中，它为脂肪酸提供二碳单位，将二碳单位加到延长中的脂肪酸碳链中。 丙二酰A是在乙酰辅酶A羧化酶的作用下使乙酰辅酶A羧化而形成的。一分子乙酰辅酶A与一分子碳酸氢盐相结合，其中需要三磷酸腺苷以提…
生酮作用
生酮作用（，又称酮体生成）是指脂肪酸降解过程结果所致的酮体生成过程。 酮体的产生 酮体主要是在肝臟细胞中的粒線體中生成。发生生酮作用是对血液中葡萄糖濃度低下或是细胞中的碳水化合物储备（如肝糖）耗竭情况下作出做出的一种反应。接下来，酮体的生成作用便启动以使储存在脂肪酸中的能量释放出来。脂肪酸在β-氧化中被酶降解而形成乙酰辅酶A。在正常情况下，乙酰辅酶A被进一步氧化，而其中的能量以电子的形式被转移给还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸和还原型黄素腺嘌…
氮循环
。]] 氮循环（）是描述自然界中氮单质和含氮化合物之间相互转换过程的生态系统的物质循环。 基本概念 空气中含有大约78%的氮气，占有绝大部分的氮元素。氮是生物体的重要组成部分，为许多生物过程的基本元素；它存在于所有组成蛋白质的氨基酸中，是构成诸如DNA等的核酸的四种基本元素之一。在植物中，大量的氮素被用于制造可进行光合作用供植物生长的叶绿素分子。将空气中的氮转化为生物体可利用的形式的过程称为氮循环。这一过程包括一系列步骤，其中包括： #…