标签:#分子生物学

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磷酸二酯酶

]] ]] 磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)是能催化寡核苷酸及多核苷酸中双重酯化的磷酸分子(正磷酸二酯)进行水解的酶,进而生成磷酸单酯和醇。 由於在細胞內生化途徑的廣泛運用,磷酸二酯酶通常指的是環核苷酸磷酸二酯酶(cyclic nucleotide phosphodiesterase,cNPDE),其將環核苷酸(cyclic nucleotide),也就是细胞内第二信使(环磷酸腺苷或环磷酸鸟苷等)的磷酸二酯鍵水解…

植物病毒

]] 感染的鬱金香花朵上有白色條紋,在十七世紀的鬱金香狂熱中價值高昂]] ]] 植物病毒(Plant virus)泛指感染植物的病毒,大多為正單鏈RNA病毒,一般不具有外膜(布尼亞病毒目與單股反鏈病毒目的病毒則有),有許多外觀呈棒状,也有呈正多面體者,其中雙生病毒科的病毒由雙生的兩個正二十面體組成。植物病毒的传播分为横向传播和纵向传播。横向传播通常以植食动物(如昆虫、螨虫、线虫)为媒介,较少像那样直接接触传染,但在农业生产中这样的情况也…

磷酸二酯鍵

磷酸二酯鍵(phosphodiester bond)又称磷酸双酯键,是磷酸分子的一个羟基和其他分子的一个羟基形成的酯键。最常见的是核酸链骨架的3′,5′-磷酸二酯键。 在生物化学中,磷酸二酯鍵常指核酸分子中的磷酸基团的磷原子與另外兩個五碳糖分子的碳原子之間形成的共價鍵。這種形式的鍵結於DNA及RNA分子中負責將分別位於兩個核糖上的3號碳與5號碳連結起來。 參見 磷酸二酯酶 磷酸二酯酶抑制药 DNA复制 DNA ATP 磷壁酸 PDE5抑…

多位点序列分型

多位点序列分型()是一种分子生物学分析方法。 该技术通过分析管家基因核心片段的核酸序列,对菌株的等位基因和DNA序列,进行比较性分析。多位点序列分型方法大量应用于研究不同的抗生素抵抗株、毒力或抗原的相关特殊基因型,以及新变异株引起的疾病流行病学研究。 参考

硬蛋白

硬蛋白()又称纤维状蛋白(fibrous protein),是三种蛋白质结构中的一种,另两种是球状蛋白及膜蛋白。硬蛋白普遍存在于动物体内,不容易变性,主要行保护和支持功能。 角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白与絲心蛋白都是硬蛋白,构成结缔组织、腱、骨基质与肌纤维等等结构。 生物分子结构 硬蛋白构成长蛋白丝,后者的形状像电线。硬蛋白是结构蛋白或贮存蛋白,这些通常是惰性的且水溶性的。因为从分子上伸出来的疏水性侧链的缘故,硬蛋白成为一个聚集体而存在。…

义 (分子生物学)

“义”()在分子生物学中指一段核酸分子(如DNA与RNA)及其互补序列,在指定合成RNA序列(转录)或指定合成氨基酸序列(转译)中的作用性质。 例如,若RNA含有一个可被翻译为多肽的编码区,则该段RNA称为:正义链(股)、有义链(股),或简称:正链、正股、正义、有义;反之,若RNA需要先形成mRNA,再合成蛋白质,则其为:负义链(股)、反义链(股),或简称:负链、负股、负义、反义。 參考

蛋白質電泳

分离的蛋白质, 考马斯亮蓝染色法]] 蛋白质电泳()是根据蛋白质带电量或分子量的大小把不同的蛋白质分开,起到分离纯化的效果。根据带电量分离的叫“等电点电泳”(二維電泳),根据分子量分的是用“十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳”。后者的运用较广泛,与转膜技术,抗原抗体反应,和成像技术合起来就是分子生物学实验室常用的“蛋白质印迹法”(western blotting)。

甲基化DNA免疫沉淀

甲基化DNA免疫沉淀(,简称为MeDIP或mDIP)在分子生物学中是一种大规模(全染色体或全基因组)纯化技术,被用于富集甲基化的DNA序列。该技术包括了通过抗5-甲基胞嘧啶(5mC)的抗体分离出甲基化的DNA片段。该技术由迈克尔·韦伯及其同事所阐述并为切实可行的甲基组水平鉴定工作铺平了道路,这是因为经纯化的甲基化DNA片段可输入到各种高通量DNA检测方法之中,这些方法包括高分辨率DNA微阵列(MeDIP-芯片)或下一代测序(MeDIP-…

帽分析基因表达

帽分析基因表达(,简称为CAGE)是在分子生物学领域应用的一种技术,该技术用于产生生物样本中整个mRNA总体的5'端快照。首先抽取出总mRNA(加帽转录物的5'端)最开头的小片段(通常20~21核苷酸长),接下来逆转录为DNA,后者通过PCR得到扩增,最后对扩增产物进行测序。CAGE法最初由林崎及同事于2003发表。 FANTOM研究计划广泛地应用了CAGE法。 分析 CAGE法输出的结果是一组短核苷酸序列(常被称为“标签”)及其所测数…

原核翻译

原核轉譯(Prokaryotic translation)是指原核生物细胞中mRNA被70S核糖体轉譯为蛋白质的过程。该过程可分为起始、延伸、终止与再循环四个主要步骤。 起始 原核生物的轉譯起始阶段涉及到以下几种轉譯系统元件的组合:两个核糖体亚基(50S与30S亚基)、需要被轉譯的信使RNA、第一个氨基酸(甲酰)氨酰tRNA(携带第一个氨基酸的tRNA)、GTP(作为能量的来源)与三种起始因子(IF1、IF2和IF3)用于帮助组装起始复…

焦磷酸测序

焦磷酸测序()是一种基于聚合酶链反应原理的DNA测序(确定DNA中核苷酸 的顺序)方法。它与桑格法不同,依赖于核苷酸掺入中焦磷酸盐的释放,而非双脱氧核苷三磷酸参与的链终止反应。该技术是由和于1996年在斯德哥尔摩的皇家工学院发展出来的。 参考资料

生物聚合物

的显微结构中,是一对生物聚合物,多核苷酸形成了DNA中的双螺旋]] 生物聚合物()又称为生物多聚体、生物聚合体或生物高分子,是由活的生物体产生的聚合物。因为他们是聚合物,生物聚合物包含有单体单元,相互之间以共价键相连以形成更大的结构。根据所使用的单体以及形成的生物聚合物的不同,主要有三大类主要的生物聚合物:多核苷酸是由13个或更多核苷酸单体所组成的长聚合物,多肽是氨基酸的短聚合物,而多糖通常是糖类线性链接而成的结构 。生物聚合物的其它实…

生物晶片

生物晶片()是利用微電子技術,在基材上放置可與檢體產生特異性生化反應的生物材料,且能被高靈敏偵測系統定量反應訊號的微型裝置。 生物晶片運用微電子學、微流體學、分子生物學、生物技術、基因檢測、分析化學等原理進行設計,並以矽晶圓、玻璃或高分子為基材,配合微機電自動化、或其他精密加工技術,所製作之高科技元件,有如半導體晶片一般能快速進行繁複運算;生物晶片具有快速、精確、低成本之生物分析檢驗能力。在分子生物學,生物晶片基本上是小型化的實驗室,可…

反式作用因子

反式作用因子(),也称为反式因子,是指能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上,参与靶基因转录效率调控的蛋白质或RNA。无论是原核生物还是真核生物,基因表达调节总是通过反式作用因子与顺式作用元件之间的作用来完成的。前者是蛋白质或RNA,后者是一段DNA或一段RNA。顺式是指DNA或RNA同一分子,反式是指不同分子。 根据不同功能,常将反式作用因子分为以下3类:具有识别启动子元件功能的基本转录因子、能识别增强子或沉默子的转录调…

核小體

核小體(,也译作核體或核仁小體)是組成真核生物染色質(除精子染色質外)的基本單位。 核小体是由DNA與4對組織蛋白(共8個)组成的複合物,其中有H2A和H2B的二聚體兩組以及H3和H4的二聚體兩組。另外還有一種H1負責連結兩個核小體之間的DNA。 核小體假說是在1974年,由Don Olins、Ada Olins與羅傑·科恩伯格等人首次提出的。 参见 前核小体 參考文獻 外部链接 [https://web.archive.org/web…

方向性 (分子生物学)

原子的呋喃糖分子。]] 方向性()亦称定向性、指向性、指向,在分子生物學与生物化学中,是指单链核酸的端到端化学方位取向。 在单链 DNA 或 RNA 中,按照核苷酸中戊糖环(pentose-sugar-ring)碳原子位次编号化学命名惯例,指定 5′端(five-prime end)代表「上游」和 3′端(three-prime end)代表「下游」{{NoteTag|1=注意:此处使用符号为 prime【′】角分符号,而非 apost…

分子遺傳學

分子遺傳學()是生物學中的一個領域,專門在分子層次下研究遺傳學,這一學門使用許多分子生物學與遺傳學的研究方法 。對生物體染色體和基因表達的研究可以深入了解遺傳、遺傳變異和突變。 這在發育生物學的研究和理解和治療遺傳疾病中很有用。 历史 确认DNA为遗传因子 的过程。]] 1928年,弗雷德里克·格里菲斯通过格里菲斯实验发现平滑型肺炎链球菌中有一种物质能使粗糙型肺炎链球菌转化为平滑型。1944年奥斯瓦尔德·埃弗里、科林·麦克劳德与麦克林·…

雜交探針

雜交探針()又稱核酸探針(nucleic acid probe),是为了核酸分子杂交实验设计制备的示踪物,此示踪物利用标记核酸分子作为探针,来探测目标分子,鉴定与其互补或同源分子。 雜交探針通常为一小段單鏈DNA片段(十幾到幾百個鹼基),用於檢測與其互補的核酸序列。雙鏈DNA加熱變性成爲單鏈,隨後用放射性同位素(通常用32P)、荧光染料或者酶(如辣根過氧化物酶)標記成爲探針。32P通常被摻入組成DNA的四種核苷酸之一的磷酸基團中,而螢光…

高通量基因克隆技术

高通量基因克隆技术(Gateway Cloning Technology),是由英潍捷基公司在二十世纪九十年代末发明并应用于分子生物学基因克隆的一项专利技术。该技术利用专有的重组序列使得DNA片段能够更有效地被转入质粒当中,可应用于大片段的基因克隆,并且在保持正确阅读框的前提下让不同表达载体间的DNA转移成为可能。 这一技术在插入的目的DNA片段两端整合att L1和att L2两个侧端重组序列(Flanking Recombinati…

真核翻译

真核翻译(Eukaryotic translation)是信使RNA在真核生物中翻译成蛋白质的生物学过程。 它由四个阶段组成:起始,延伸,终止,和再循环。 起始 翻译起始是翻译过程中的第一步,也是最为复杂的一步。在真核生物中,这一过程可以被分为三段:首先,甲硫氨酸起始tRNA(Met-tRNAimet)结合到40S核糖体小亚基上,从而形成43S前起始复合物;接着,前起始复合物结合到被激活的mRNA的5'端末端,并沿着5'至3'的方向在5…