真核起始因子2
eIF2（eukaryotic Initiation Factor 2，真核起始因子2）是一个重要的真核起始因子，它的作用是在真核翻译起始过程中介导起始tRNA（Met-tRNAi）与核糖体结合。它是一个异源三聚体，由α、β、γ三个亚基组成。eIF2也是第一个被发现的其蛋白磷酸化作用能够调控真核翻译的起始因子。 功能 eIF2在真核翻译起始过程中扮演着关键角色。它与GTP以及起始tRNA形成三聚体复合物（TC），在eIF3和eIF5的作…
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真核起始因子
]] 真核起始因子（英文：eukaryotic initiation factor，简称为eIF），又称为真核翻译起始因子，是指参与真核翻译起始这一过程的蛋白质。与原核起始因子只有三种（IF1、IF2、IF3）相比，真核起始因子种类多且复杂，目前已鉴定的真核起始因子共有12种。 通过这些真核起始因子之间以及不同的真核起始因子与核糖体、mRNA和起始tRNA之间的相互作用，来完成真核生物的翻译起始。因此相比于原核生物，真核生物的翻译起始过…
翻译后修饰
的轉譯後修飾之過程圖]] 翻译后修饰（英語：Post-translational modification，縮寫PTM；又稱後轉譯修飾）是指蛋白質在翻译後的化學修飾。蛋白質擁有不同功能且影響生物體許多的功能，而往往要經過修飾才具有相應的功能，此階段即為轉譯後修飾，包含甲基化、磷酸化和乙醯化等。對於大部份的蛋白質來說，這是蛋白質生物合成的較後步驟。PTM是細胞信號傳導中的重要組成部分。 蛋白質，或是多肽，是多條或一條胺基酸的鏈。當合成蛋白…
无义介导的mRNA降解
无义介导的mRNA降解（，常简写为NMD机制或NMD）是一种存在于所有真核生物中的。这一机制透过降解含有提前终止密码子的异常mRNA转录子以减少基因表达上的错误。如果没有这一机制，这些异常的mRNA可能会翻译出有害的功能获得性或的蛋白质，可能损害生物体正常的生理机制。 NMD机制在1979年几乎同时于人类和酵母菌细胞中发现，显现出这一机制在广泛种系间的保守性，体现了这一机制重要的生物学意义。无义突变导致了终止密码子的提前出现，使得正常的…
转录因子
在分子生物学中，转录因子（英語：Transcription factor）是指能够结合在某基因上游特异核苷酸序列上的蛋白质，这些蛋白质能调控其基因的转录，具体是通过调控核糖核酸聚合酶（RNA聚合酶，或叫RNA合成酶）与DNA模板股的结合。 转录因子的本质是与DNA特异性结合的一系列蛋白质。一般有不同的功能区域，如DNA结合结构域与效应结构域。转录因子不单与基因上游的启动子区域结合，也可以和其它转录因子形成转录因子复合体来影响基因的转录，…
拓扑结构域
拓扑结构域（）或称为拓扑相关结构域（，简称）是染色质亚结构的学术名称。类似的定义还包括接触结构域（）、DNA环结构域（）、等。这一结构最先通过高通量染色质三维构象捕获技术（Hi-C）被发现，之后又被显微成像技术确认。拓扑结构域目前在细菌、真菌、动物和一些植物中都有所发现，一般其尺度约在千到百万DNA碱基。 尽管对拓扑结构域的功能理解尚不明朗，目前学界认为这是染色质施行诸如转录、复制、表观遗传修饰等功能的基本单位。一些证据表明，当拓扑结构…
熱圖
生成的熱圖呈現出基因表現]] 热图（）在二维空间中以颜色的形式显示一个现象的绝对量，是一种数据可视化技术。颜色的变化可能是通过色调或明度，给读者提供明显的视觉提示，说明现象是如何在空间上聚集或变化的。热图有两种完全不同的类别：聚集热图和空间热图。在聚集热图中，幅度被排列成一个固定单元格大小的矩阵，其行和列是离散的现象和类别，行和列的排序是有意的，而且有些随意，目的是暗示聚集或描绘出通过统计分析发现的聚集。单元格的大小是任意的，但足够大，…
選擇性剪接
選擇性剪接（；又称“可变剪接”）是基因表达的方式，在複雜的動物例如人類细胞是非常普遍的。真核细胞的基因序列中，包含了內含子（intron）與外顯子（exon），兩者交互穿插。其中內含子在基因轉錄成mRNA前体後會被RNA剪接體移除，剩下的外顯子才是能夠存在於成熟mRNA（之後再進一步轉譯成蛋白質）的片段。 而選擇性剪接便是利用這樣的特性，一條未經剪接的RNA，含有的多種外顯子被剪成的不同組合，可轉譯出不同的蛋白質。就能將同一基因中的外顯…
转录调控
转录调控（）指通过改变转录速率从而改变基因表达的水準。 转录调控 转录调控可以控制转录何时发生以及产生多少RNA。被RNA聚合酶转录的基因可被至少五种机制所调控： 特异性因子会改变RNA聚合酶对于特定啟動子或一套启动子识别的特异性，使得RNA聚合酶更多或更少地结合到这些启动子上（如原核转录中用到的σ因子）。 阻遏因子会结合到DNA链上的靠近或覆盖启动子区域的那些非编码序列上，阻碍RNA聚合酶顺利进入此链，故阻碍了基因的表达。 通用转录因…
基因剪切位點突變
基因剪切位點突變（）是一種發生於核苷酸特定位點的遗传突變。這些突變包括插入、删除或序列的改變，影響了RNA剪接處，並可能導致產生的蛋白质失去功能。 臨床意義 侏儒症併肌肉、肝、腦、眼異常 （Mulibrey nanism）是一種表現為先天性生長障礙的罕見常染色體隱性遺傳病，可以波及身體內多個器官，最初於1970年在芬蘭首次報道。目前已有TRIM 37基因剪接位點突變導致此疾病的報道。例如在芬蘭患者中檢出TRIM37基因剪接區IVS6-2…
结构基因
结构基因（）是指基因编码的产物为调节因子（调控基因）以外的蛋白质的基因，可以用于编码结构蛋白、酶或不涉及调控的非编码RNA。 这些基因对细胞的形态和功能特征非常重要。在真核生物中，这些基因是以片段化的形式存在，即分为外显子和内含子。但在原核生物中，这些基因是连续的，甚至几个功能相关的基因与调控基因组成一个操纵組来共同转录。 如在乳糖操纵組中，结构基因编码的就是与乳糖代谢有关的酶，这三个结构基因是： Lac Z 基因编码β-半乳糖苷酶； …
JAK-STAT信号通路
JAK-STAT信号传送途径（）使得细胞外的化学信号跨越细胞膜并将信息传送到细胞核内DNA上的基因启动子上，最终引起细胞中DNA转录与活性水平发生改变。JAK-STAT系统是除了第二信使系统外最重要的信号途径。 JAK-STAT系统由三个主要部分组成：（1）受体、（2）JAK激酶与（3）信号转导及转录激活蛋白（STAT）。 白细胞中表达了许多JAK-STAT通路，并因此参与免疫系统的调控。 来自干扰素、白细胞介素、生长因子或其它化学信使…
转录
下看到的轉錄中的DNA與RNA，DNA周圍的物質是正在合成的RNA。]] 转录（）是在RNA聚合酶的催化下，遗传信息由DNA复制到RNA（尤其是mRNA）的过程。作为蛋白质生物合成的第一步，转录是合成mRNA以及非編碼RNA（tRNA、rRNA等）的途径。 真核生物合成蛋白质的转录过程以特定的单链DNA片段作为模板，RNA聚合酶作为催化剂，合成前mRNA，前mRNA经进一步加工后转为成熟mRNA。转录时，DNA分子的双链打开（是否需要D…
無終止密碼子媒介式分解
無終止密碼子媒介式分解（Non-stop decay，簡稱NSD）為真核生物細胞移除不含終止密碼子的異常mRNA之機制。核糖體轉譯不具終止密碼子的mRNA（可能因突變、多腺苷酸化位點異常、在開放閱讀框中間被切割等原因產生。 核糖體停滯發生後，細胞會啟動無終止密碼子媒介式分解途徑（NSD），蛋白（酵母菌）或Hbs1及Dom34蛋白{{Notetag|1=這兩種蛋白也被用於轉譯停滯分解途徑（NGD）中；另外酵母菌還有另一不使用ski7蛋白的…
核糖體移碼
核糖體移碼（Ribosomal frameshift）又稱轉譯移碼（Translational frameshift），是生物細胞中核糖體進行轉譯時，mRNA上的特定序列與二級結構使核糖體發生位移而破壞開放閱讀框的現象。由於mRNA上的密碼子是由3個核苷酸對應一個氨基酸，+1、-1等核糖體移碼會影響下游的開放閱讀框，進而轉譯出完全不同的蛋白質。核糖體移碼可使一個mRNA得以轉譯出數種不同的蛋白質產物，此機制主要在病毒（反轉錄病毒、（RS…
操縱子
操縱組（，又稱操縱子或操縱元）是共同调控相关功能的基因簇，包括一個操縱基因（operator），及一個或以上的結構基因被用作生產信使RNA（mRNA）的基元，受一個單一的啟動子控制。首个被發現操縱子是乳糖操縱子，由方斯華·賈克柏及賈克·莫諾於1961年發現。 操縱子是與調節子及刺激子有關：操縱子包含了一組受操縱基因調節的基因，調節子包含了一組受單一調節蛋白質的基因，而刺激子則包含一組受單一細胞調節的基因。 最初，操纵子被认为仅存在于原核…
強化子RNA
強化子RNA（Enhancer RNA，簡稱eRNA）是真核生物基因組中強化子序列轉錄產生的非編碼RNA，長50nt至4000nt之間，此類RNA於2010年由RNA測序與ChIP-seq等大規模測序技術測得。強化子為基因組中與RNA聚合酶Ⅱ、中介體和轉錄因子結合以啟動基因轉錄的重要序列，其轉錄生成的強化子RNA大多留在細胞核中，此類RNA大多不穩定，易被細胞核中的外切體降解，但可能可調控其他基因的轉錄。並非所有強化子皆可轉錄，有研究顯…
強化子
-{zh-hant:強化子;zh-hans:增强子;zh-hk:增強子;zh-mo:增強子}-（）又可譯為-{zh-hant:增強子;zh-hans:强化子;zh-hk:強化子;zh-mo:強化子}-，是DNA上一小段可與蛋白質（反式作用因子；trans-acting factor）結合的區域，與蛋白質結合之後，基因的轉錄作用將會加強。強化子可能位於基因上游，也可能位於下游。且不一定接近所要作用的基因，甚至不一定與基因位於同一染色體。這…
四環素轉錄調控系統
（小干擾RNA）的表達，以達到定時敲低（knock-down）基因表達等目的]] 四環素轉錄調控系統（Tetracycline-Controlled Transcriptional Activation）是一種能夠定時調控（開啓或關閉）特定基因表達的轉錄調控系統。該系統由一個順式作用元件和一個活性受四環素調控的特殊轉錄調控蛋白（反式作用因子）構成。當四環素或多西環素（Doxy）等四環素衍生物存在時，處於該系統調控下的基因表達會開啓或關閉…
副突变
颜色的影响]] 在表观遗传学中，副突变（paramutation）又称類突變，是单个基因座上两个等位基因之间的相互作用，其中一个等位基因诱导另一个等位基因发生可遗传变化；此为一種打破常規的遺傳模式。這種情況首先在玉米中發現，隨後在其他植物、真菌、甚至小鼠中發現。而，用玉米所做的研究指出副突變是由RNA引導的。 参考 文獻 [http://news.bbc.co.uk/2/hi/science/nature/5011826.stm BBC…