翻译后修饰

的轉譯後修飾之過程圖]]

翻译后修饰(英語:Post-translational modification,縮寫PTM;又稱後轉譯修飾)是指蛋白質在翻译後的化學修飾。蛋白質擁有不同功能且影響生物體許多的功能,而往往要經過修飾才具有相應的功能,此階段即為轉譯後修飾,包含甲基化、磷酸化和乙醯化等。對於大部份的蛋白質來說,這是蛋白質生物合成的較後步驟。PTM是細胞信號傳導中的重要組成部分。

蛋白質,或是多肽,是多條或一條胺基酸的鏈。當合成蛋白質時,20種不同的胺基酸會合併成為蛋白質。胺基酸的轉译後修飾會附在蛋白質其他的生物化學官能團(如醋酸鹽、磷酸鹽、不同的脂類及碳水化合物)、改變胺基酸的化學性質,或是造成結構的改變(如建立雙硫鍵),來擴闊蛋白質的功能。

再者,酶可以從蛋白質的N末端移除胺基酸,或從中間將肽鏈剪開。舉例來說,胰島素是肽的激素,它會在建立雙硫鍵後被剪開兩次,並在鏈的中間移走多肽前體,而形成的蛋白質包含了兩條以雙硫鍵連接的多肽鏈。

其他修飾,就像磷酸化,是控制蛋白質活動機制的一部份。蛋白質活動可以是令酶活性化或鈍化。

加入官能團
翻译後修飾包括以下加入官能團的反應:
*乙醯化——通常於蛋白質的N末端加入乙醯。
*烷基化——加入如甲基或乙基等烷基。
**甲基化——烷基化中常见的一種,在賴氨酸、精氨酸等的侧链氨基上加入甲基。
*生物素化——用生物素附加物令保存的賴氨酸醯化。
*穀氨酸化——在穀氨酸與導管素及其他蛋白質之間建立共價鍵。
*甘胺酸化——在一個至超過40種甘胺酸與導管素的C末端建立共價鍵。
*糖化——將糖基加入天冬醯胺、羥離氨酸、絲氨酸或蘇氨酸,形成糖蛋白。
*異戊二烯化——加入如法呢醇及四異戊二烯等異戊二烯。
*硫辛酸化——附著硫辛酸的功能性。
*磷酸泛酰巰基乙胺基化——像在脂肪酸、聚酮、非核醣體肽鏈及白氨酸的生物合成中,從乙醯輔酶A加入4'磷酸泛酰巰基乙胺基。
*磷酸化——加入磷酸根至絲氨酸、酪氨酸、蘇氨酸或組氨酸。
*硫酸化——將硫酸根加入至酪氨酸。
*硒化
*C末端醯胺化

加入其他蛋白質或肽
*干擾素激活基因化——與干擾素激活基因15(ISG15)蛋白質建立共價鍵。
*小泛素相關修飾化——與小泛素相關修飾子蛋白建立共價鍵。
*泛素化——與泛素建立共價鍵。

改變胺基酸的化學性質
*瓜氨化——將精氨酸轉為瓜氨酸。
*脫氨化——將穀氨醯胺轉為穀氨酸或將天冬醯胺轉為天冬氨酸。

結構改變
*雙硫鍵——與兩個半胱氨酸的胺基酸建立共價鍵。
*分解蛋白質——將蛋白質的肽鍵剪開。

數據庫與工具
蛋白質序列包含通過修飾酶識別的序列基序,並且可以在 PTM 數據庫中記錄或預測。 隨著發現大量不同的修改,需要在數據庫中記錄此類信息。 PTM 信息可以通過實驗手段收集,也可以從高質量、手動整理的數據中預測。 已經創建了許多數據庫,通常側重於某些分類群(例如人類蛋白質)或其他特徵。

資源列表

  • [http://www.phosphosite.org/ PhosphoSitePlus] – 用於研究哺乳動物蛋白質翻譯後修飾的綜合信息和工具數據庫
  • ProteomeScout – 實驗性蛋白質和翻譯後修飾數據庫
  • Human Protein Reference Database – 包括網站在內的多種類型 PTM 的共識模式數據庫

工具
蛋白質及其 PTM 可視化軟件列表

  • PyMOL——將一組常見的 PTM 引入蛋白質模型
  • AWESOME – 查看單核苷酸多態性對 PTM 的作用的交互式工具
  • Chimera – 可視化分子的交互式數據庫

案例

  • 胰島素生產過程中二硫鍵的裂解和形成
  • 作為轉錄調控的組織蛋白PTM:染色質結構對 RNA 聚合酶的控制
  • RNA聚合酶Ⅱ的 PTM 作為轉錄調控
  • 多肽鏈的切割對凝集素特異性至關重要

參考文献
外部連接

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