拓扑结构域()或称为拓扑相关结构域(,简称)是染色质亚结构的学术名称。类似的定义还包括接触结构域()、DNA环结构域()、等。这一结构最先通过高通量染色质三维构象捕获技术(Hi-C)被发现,之后又被显微成像技术确认。拓扑结构域目前在细菌、真菌、动物和一些植物中都有所发现,一般其尺度约在千到百万DNA碱基。
尽管对拓扑结构域的功能理解尚不明朗,目前学界认为这是染色质施行诸如转录、复制、表观遗传修饰等功能的基本单位。一些证据表明,当拓扑结构域边界被破坏后,较大规模的基因表达会受到影响。
拓扑结构域的发现和定义
拓扑结构域是通过高通量染色质捕获技术最先于2012年被发现和蛋白质复合体黏连蛋白 (cohesin)。这些蛋白通过染色质免疫共沉淀测序技术被发现富集在拓扑结构域的边界上。由于边界还富集有大量常表达基因 (housekeeping gene) 和转运 RNA (tRNA) 基因得以实现。这一理论预测黏连蛋白在 DNA 上滑动,直到遇到CTCF二聚体之后停止运动。
在拓扑结构域中,DNA 环是更高分辨率的原位全基因组染色质三维构象捕获技术(in situ Hi-C) 。
參考資料
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