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Σ因子

σ因子(sigma factor),原核生物RNA聚合酶上的一个亚基。可以协助聚合酶与模板链上的启动子专一性的识别并结合,极大地提高聚合酶对DNA启动子区的结合力。 特殊的σ因子 原核生物会使用不同的σ因子来适应不同的环境条件。这些特殊的σ因子可结合与环境条件相适应的基因的启动子区,增加这些基因的转录来适应环境。 在大腸桿菌中,有以下6种σ因子: 参考

蛋白質生物合成

內,基因被轉錄成RNA。RNA接著被後轉錄修飾及控制,形成成熟的信使RNA(mRNA),並運往細胞核外的細胞質進行轉譯。mRNA由核糖體翻譯成與mRNA的基本密碼子,通过与轉運RNA上的反密碼子形成配对进行翻譯。新合成的蛋白質會被再行修飾,并可以與效應分子結合,最终成為具有生物学活性的蛋白質。]] 蛋白質生物合成是指在生物細胞內製造新的蛋白質;此合成是为了平衡蛋白酶解或所造成的細胞蛋白損耗。蛋白质的生物合成也称为轉译,它是基因表达的最后…

弱化子

弱化子(attenuator,又译衰减子)是指原核生物的操纵子中可以明显衰减乃至终止转录作用的一段核苷酸序列,位于操纵子的上游。在研究大肠杆菌(E. coli)的色氨酸操纵子表达弱化现象时发现。该区域可以形成不同的二级结构。 参考

43S起始前複合物

43S起始前複合物(英文:43S preinitiation complex,43S PIC)是一種核糖核蛋白複合物,存在於真核轉譯起始的早期階段。43S PIC包含由起始因子eIF1,eIF1A,eIF3和eIF2-Met-tRNAiMet-GTP三元復合物(eIF2-TC)結合的40S核糖體亞基。 功能 結構 參見 真核轉譯 40S核糖体亚基 *eIF3 參考資料

5′非翻译区

5′非翻译区(5′ UTR)是指成熟mRNA位于编码区(CDS)上游、5′端帽下游不被翻译为蛋白质的区域。 5′非翻译区从转录起始位点开始,在起始密码子的前一个核苷酸处结束,可以包含通过调控元件控制基因表达的元件。在原核生物中,5′非翻译区通常含有核糖体结合位点(RBS),即夏因-达尔加诺序列(AGGAGGU)。 真核生物5′非翻译区的中位数长度一般约为150核苷酸(nt),但有些可长达数千碱基。有些病毒和细胞的基因有着非常长和结构性的…

上游开放阅读框

上游开放阅读框(Upstream open reading frame,簡稱uORF)是位於真核生物mRNA5′非翻译区(5′ UTR)的開放閱讀框(ORF),可調控(一般為抑制)mRNA主要ORF的轉譯,少數案例中(如酵母菌的Gcn4基因)uORF則可促進主要開放閱讀框的轉譯,為細胞調控基因表現的機制之一。 人類基因中約有50%在mRNA的5′ UTR具有uORF,一般長2至100個密碼子,多為抑制主要開放閱讀框的轉譯,有些mRNA含…

STAT4

STAT4是转录因子中信号转导及转录激活蛋白(STAT蛋白)家族的一员。在幼稚CD4+ T cells发育为Th1细胞的过程和细胞响应IL-12产生IFN-γ的过程中是必需的。 结构 人类和鼠类的STAT4基因都位于STAT1基因的附近,这一点暗示了这两个基因由基因重複而来。 表达 STAT4 的分布仅限于骨髓细胞、胸腺和睾丸。 IFNα 和 INFβ 分别由白细胞、成纤维细胞分泌的I型干扰素IFNα和IFNβ 共同调节抗病毒免疫、细胞…

非翻译区

非翻译区(UTR,untranslated region)在分子遗传学中,是指任意一个位于mRNA链编码序列两端的片段。如果其位于5′端,则称为5′非翻译区(或“前导序列”), 反之若位于3′端,则称为3′非翻译区(或“尾随序列”)。 参见 5′非翻译区 3′非翻译区 参考资料 [https://web.archive.org/web/20080923202457/http://www.ba.itb.cnr.it/UTR/ UTReso…

基因靜默

是細胞達成基因靜默的一種機制]] 基因靜默(Gene silencing)又稱基因沈默、基因沈寂,泛指生物細胞藉各種機制抑制某一基因表現的現象,機制包括DNA甲基化、、基因組銘印、基因轉應、重复序列诱导点突变、副突變、(包括RNA干擾、基因压制{{Notetag|1=gene quelling,由miRNA、siRNA、piRNA與rasiRNA等小RNA引導)和mRNA降解等,例如許多mRNA的3'非轉譯區(3'UTR)即可和miRN…

RNA聚合酶III

RNA聚合酶III(又称Pol III)是真核细胞中通过转录DNA来合成核糖体5S rRNA、tRNA等小RNA的酶。 由RNA Pol III转录的基因属于“管家”基因。因为这些基因需要在所有类型的细胞和大多数环境条件中表达,所以Pol III转录的调控主要与细胞增殖和细胞周期关联,需要的调控蛋白少于RNA聚合酶II。然而,在压力下,蛋白质会 MAF1 抑制Pol III的活性。 雷帕霉素 是另一个Pol III抑制剂。 转录 任何聚…

普里布諾盒

普-{里}-布諾盒(英語:Pribnow box)又稱普-{里}-布諾-夏勒盒(英語:Pribnow-Schaller box),是一段TATAAT序列DNA,位於原核生物的轉錄啟動子上,詳細位置大約是轉錄起始點上游的10個鹼基對處。 名稱源自David Pribnow與Heinz Schaller。 == 參見 * TATA盒 參考文獻

TATA盒

TATA盒(英語:TATA box)又稱高得堡-哈葛尼斯箱(英語:Goldberg-Hogness box),是一段DNA序列,位於真核生物和古菌的轉錄啟動子上,大約位在轉錄起始點上游第25個鹼基對。TATA盒是RNA聚合酶II結合的位置。TATA盒的细菌同源物称为普里布諾盒(Pribnow box),其共有序列较短。 TATA盒在轉錄的過程中,時常和一種TATA结合蛋白(TATA binding protein,TBP)結合,TBP負…

基因产物

基因产物是基因表达的产物,是一种生物化学物质,通常是RNA或蛋白質。基因产物的数量用于衡量基因的活跃程度。基因产物的数量异常可能是由某些致病性的等位基因引起,例如过度活跃的癌基因会导致癌症。

GRO-seq

GRO-seq测序技术(全称“Global Run-On Sequencing”),可以在整个基因组范围上绘制参与转录的RNA聚合酶的位置、数量并进行定位。通过GRO-seq技术,研究人员可以观测到基因组水平进行的转录,这是一种对所有参与DNA聚合酶位置定向的高分辨率虚拟图谱。