调节基因
调节基因（）是指用来控制一个或多个其他基因表达的基因。调控序列用于给调节基因编码，通常在转录起始点的5′端。 在原核生物中，调节基因通常用于编码。阻遏蛋白与operators或启动子结合，阻止RNA聚合酶转录RNA 。 参考资料 外部链接 [https://web.archive.org/web/20160422025922/http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/ Plant Transcription Fac…
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GenePattern
*'是一款免费开源的计算生物学软件包，最初由博德研究所为分析基因组数据在2004年开发，现由加州大學聖地牙哥分校团队负责维护。 参考文献 外部链接 [http://www.broadinstitute.org/cancer/software/genepattern/ Official GenePattern website] [http://genepattern-notebook.org/ Official GenePattern N…
DNA微陣列
DNA微陣列（DNA microarray）又稱DNA陣列或DNA芯片，比較常用的名字是基因芯片（gene chip）。是一塊帶有DNA微阵列（microarray）的特殊玻璃片或矽晶圓片，在數平方公分之面積上佈放數千或數萬個核酸探針；檢體中的DNA、cDNA、RNA等與探針結合後，藉由-{zh-cn:荧光;zh-tw:螢光}-或電流等方式偵測。經由一次測驗，即可提供大量基因序列相關資訊。它是基因组学和遗传学研究的工具。研究人員應用基因…
調控序列
調控序列（，又譯調節序列）是生物体内可以促进或抑制基因表达的核酸片段。调控序列可以是DNA中一段包含啟動子、強化子、沉默子，以及一些調節蛋白（如轉錄因子）附着位点的核酸片段。這些序列調控了基因的表达，進而影響蛋白質的合成。除此之外，mRNA也有調控序列，可與RNA結合蛋白或其他RNA結合。 基因表达的调节是所有生物（包括病毒）的基本特征。 描述 在DNA中，基因表达的调节通常发生在转录时，通过DNA序列与转录因子的特异性结合来实现。转录…
乳糖操縱子
乳糖操縱子() 是一個在大腸桿菌及其他腸道菌群內負責乳糖的運輸及代謝的诱导操縱子。儘管葡萄糖是大多數細菌的首選碳源，但是當葡萄糖無法通過β-半乳糖苷酶的活性被獲得時，乳糖操縱子可以有效地消化乳糖。乳糖操縱子基因調控是第一個被清楚了解的遺傳調控機制，因此它已成為原核生物的基因調控的最重要样例之一。乳糖操縱子也因此經常被在分子和細胞生物學入門課程中被討論。方斯華·賈克柏及賈克·莫諾研究确定了这种乳糖代谢系统，发现了細胞合成不同酶的机制。 他…
非編碼DNA
非編碼DNA（non-coding DNA，ncDNA）谑称“垃圾DNA”，是指不包含製造蛋白質的指令，或是只能製造出無轉譯能力RNA的DNA序列。此類DNA在真核生物的基因組中佔有大多數。有很长的一段时间科学家认为非编码DNA没有作用，因此这些重复的DNA片段曾被冠以「垃圾DNA」的称号。随着时间的推移，科学家对垃圾DNA的认识逐渐深入，慢慢地发现很多垃圾DNA有其独特的作用，它们在基因剪切等方面起重要的作用。 近年的證據顯示，非編碼…
轉錄噪音
轉錄噪音（Transcriptional noise）爲近等基因細胞群體中各個細胞轉錄差異產生的主要原因（參見）。人們認爲，轉錄噪音的一個誘因爲，不過其他異質性誘因，比如細胞在有絲分裂過程中發生的不等分裂，也可能在相當程度上誘發了轉錄噪音。暴增的轉錄，和轉錄簡單的概率模型不同，反映了不定期來回波動的基因活性的多樣狀態。這在細胞之間產生了蛋白質表達的差異。基因表達的噪音對細胞行爲有着巨大的影響，而且，這種噪音不是達到協調統一的狀態，就是逐…
轉錄前起始複合體
轉錄前起始複合體（Transcription preinitiation complex，簡稱PIC）是真核生物與古菌細胞基因轉錄前由約100個蛋白質組成的複合體，真核生物轉錄mRNA的前起始複合體包括負責轉錄的RNA聚合酶Ⅱ、6種通用轉錄因子（、、、、、）與其他輔助蛋白，組成過程中TFIID的TATA結合蛋白次單元首先在TFIIA的幫助下與DNA啟動子的TATA盒（或等其他元件）結合，接著TFIIB也會與啟動子上的BRE元件（TFII…
超級強化子
在遺傳學，超級強化子（Super-enhancer）是哺乳類基因體中包含多個強化子的區域，可以結合許多轉錄因子來啟動決定細胞分化結果之基因的轉錄。由於超級強化子經常出現於控制、定義細胞身份基因的附近，因此它們也可被用來快速定位基因組中調控細胞身份的關鍵位點。 超級強化子會與許多與轉錄調控相關的蛋白結合，並常用於調控高表現量的基因表現與超級強化子相關的基因表現會特別對擾動敏感，可能控制細胞狀態的轉換，這也導致由超級強化子調控的基因常對影響…
芳香烃受体
芳香烃受体（，或称为芳烃受体或芳基烃受体，简称为AhR或AHR）是一种在人类中由 AHR 基因编码的蛋白质。芳香烃受体是调节基因表达的转录因子。 它最初被认为主要作为异生化学物质的传感器发挥作用，同时也作为代谢这些化学物质的细胞色素P450等酶的调节剂。 这些异生化学物质中最引人注目的是芳香族（芳基）烃，受体的名字也来源于此。 最近，已经发现AhR被许多内源性吲哚衍生物如犬尿氨酸激活（或失活）。 除了调节代谢酶外，AhR 还具有调节免疫…
終止子
終止子（）是一段位於基因或操縱組末端的DNA片段，可中斷轉錄作用。真核生物擁有兩種類型的終止子，包括： #本體轉錄終止子（Intrinsic transcription terminators），一個髮夾結構。 #ρ-依賴轉錄終止子（Rho-dependent transcription terminators），ρ因子與RNA螺旋酶蛋白複合物。 終止子為RNA（核糖核酸）轉錄的一部分。在真核生物中，對於釋放從轉錄複合體新作出的RNA，…
真核转录
真核转录是真核生物将存储在DNA中的遗传信息复制到RNA中的复杂过程。转录既发生在真核生物中，也发生在原核生物中。原核生物中的RNA聚合酶可以启动所有类型的转录；不同于原核生物，真核生物（包括人类）的RNA聚合酶有三种变体，每种变体编码不同类型的基因。真核生物的转录与翻译在不同的场所进行。真核细胞的转录发生在细胞核内，核中的DNA一般被包装成核小体以及更高级的染色质结构。真核生物基因组的复杂性决定了基因表达控制的多样性和复杂性。 概述 …
遗传密码
序列編碼所對應的氨基酸。]] 分子上一系列的密碼子（codons），每個密碼子由3個含氮鹼基，對應單個氨基酸。核苷酸使用縮寫字母A、U、G和C。信使RNA採用U（尿嘧啶）代替DNA採用T（胸腺嘧啶）。此信使RNA分子將責成一個核糖體根據這個密碼合成的蛋白質。]] 遺傳密碼（Genetic code）又稱遺傳編碼，是遺傳-{信息}-的傳遞規則，將DNA或mRNA序列以三個核苷酸為一組的“（codon）”轉譯為蛋白質的氨基酸序列，以用於蛋白…
RAN轉譯
病患的基因的CAG重複數目較一般人多，可進行RAN轉譯產生致病蛋白]] RAN轉譯全稱為重複區關聯的非AUG轉譯（），是真核生物細胞中一種異常的mRNA轉譯機制，發生在具簡單重複序列（微衛星）的mRNA上，不需起始密碼子AUG即可轉譯重複序列，產生由一或兩種（少數案例為數種）胺基酸組成的重複蛋白。此轉譯機制最早於2011年在第八型小腦萎縮症（SCA8）與第一型強直性肌肉失養症（DM1）患者中發現，上述兩種疾病與亨丁頓舞蹈症及肌萎缩性脊髓…
高迁移率族
高迁移率族蛋白（，缩写HMG，或译为高速泳动族蛋白）是一类染色质蛋白质，参与调控多种DNA依赖性过程，如DNA转录、复制、重組和修复。 历史与名称 高迁移率族蛋白最初是从哺乳动物细胞中分离出来的，其名称是根据它们在聚丙烯酰胺凝胶中的电泳迁移率命名的。 家族 高迁移率族蛋白可细分为3个超家族，每个超家族都含有一个具有特征性的功能结构域： HMGA – 包含一个AT-hook结构域 HMGA1 HMGA2 HMGB – 包含一个HMG-bo…
起始因子
起始因子（）是指翻译起始阶段端结合到核糖体小亚基上的一些蛋白质，翻译是蛋白质生物合成中的一部分。 主要分为三种： 原核起始因子 古菌起始因子 真核起始因子 外部链接
DNA密码子表
碱基，称为核苷酸的三联密码子。]] 传统上，遗传密码以RNA密码子表的形式表示；这是因为在细胞核糖体制造蛋白质时，指导合成蛋白质的是信使RNA。信使RNA的序列则由基因组DNA确定。随着计算生物学和基因组学的兴起，现今可在DNA水平上发现大多数基因，因此DNA密码子表变得愈加有用。下表中的DNA密码子存在于有义DNA链上，并以5'端→3'端的方向排列。 参见 RNA密码子表 RNA DNA 参考文献 外部链接 [https://web.…
信使核糖核酸
被創造出來；在經過增加5'端帽、剪接和加上多聚腺苷酸尾鏈之後成為mRNA，被運送到細胞質，然後由核糖體進行轉譯產生蛋白質。]] 信使核糖核酸（，缩写：）简称信使RNA（），是由DNA經由轉錄而來，帶著相應的遺傳訊息，為下一步轉譯成蛋白質提供所需的訊息。在细胞中，mRNA從合成到被降解，經過了數個步驟。在轉錄的過程中，第二型RNA聚合酶（RNA polymerase II）從DNA中複製出一段遺傳訊息到前mRNA（尚未經過修飾或是部分經過…
翻譯 (生物學)
中的翻译过程]] 翻译（），是蛋白質生物合成（基因表达中的一部分，基因表达还包括转录）过程中的第一步。翻译是根據遺傳密碼的中心法則，将成熟的mRNA分子（由-{zh-cn:通过;zh-tw:透過}-转录而生成）中「碱基的排列顺序」（核苷酸序列）解码，并生成对应的特定氨基酸序列的过程。但也有许多转录生成的RNA，如tRNA、rRNA和小核RNA等并不被翻译为氨基酸序列。 翻译的過程大致可分作三個階段：起始、延長、终止。翻译主要在细胞质内的…
终止密码子
在遗传密码中，终止密码子（），或稱終止子，是信使RNA上的一个核苷酸三联体序列，代表翻译的终止。蛋白质是由特定氨基酸生成的多肽序列折叠而成。轉譯發生時，信使RNA中的大部分密码子被tRNA識別後，tRNA可添加一个额外的氨基酸到成长中的多肽链上，而终止密码子則通过被释放因子識別，给这个过程发出终止的信号，最终使核糖體的大小亚基解离、轉譯終止，並將合成的多肽链释出。 DNA序列的無義突變可能導致信使RNA上基因的編碼區中產生終止密碼子，而…