高分辨率熔解
高分辨率熔解（英语：High Resolution Melt，缩写：HRM） 分析是分子生物学中的一项强大的技术。这项技术是用于检测双链DNA样本中的突变、多态性和表观遗传差异。它是由爱达荷科技公司和犹他大学发现并开发的。与其他基因型分型技术相比，它具有以下优势： 与其他基因分型技术（如DNA测序和TaqMan SNP基因分型）相比，它更具有成本效益。这使它成为大规模基因分型项目的理想选择。 它不仅快而且强大，因此它能够快速并准确地对许…
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重新编程
在生物学中，重新编程 ()，是指在哺乳類动物发育或细胞培养过程中，删除和重塑表观遗传标记，例如DNA 甲基化。 这种控制通常也与组蛋白的替代共价修饰有关。 現時在哺乳類动物中使用重新編程，可以用大規模 (10% 至100% 的表觀遺傳標記) 及快速 (數小時至數天內) 在三個生命階段中進行。幾乎 100% 的表觀遺傳標記，可在精子與卵子受精後，早期發育期間的兩個短時間內被重新編程。 在细胞培养系统中 转录因子 OSKM OSKM因子（O…
起始點識別複合物
在分子生物學中，起始點識別複合物（origin recognition complex, ORC）是指一種真核生物體內的含有多個亞基、與DNA結合的複合物。它與DNA通過一種ATP依賴性的方式相連，使得DNA複製得以啓動。該複合物的幾個亞基分別由、、、、、基因編碼。起始點識別複合物不僅在真核生物DNA複製期間存在，在整個細胞週期的其餘時段也與複製起點結合。起始點識別複合物對DNA複製的啓動來說不可或缺。與複製起點結合的起始點識別複合物使…
葉綠體DNA
葉綠體DNA（Chloroplast DNA，cpDNA）為真核生物細胞中葉綠體內的DNA。葉綠體等质粒体中具有一獨立於細胞核的基因組，且含有核糖體可轉譯合成自身的蛋白質，為一半自主的胞器，葉綠體DNA最早於1959年透過生化實驗發現，並於1962年透過電子顯微鏡實際觀測確認。1986年菸草與地錢的葉綠體DNA被定序發表，為最早完成定序的葉綠體基因組，目前已有的质粒体被定序發表。 基因组結構 葉綠體DNA為環狀，長度一般介於120至17…
脱氧核糖核酸
是按元素進行顏色编碼，還有兩個鹼基對的詳细结構示於右下角]] |替代=|440x440像素]] 是一種生物大分子，可組成遺傳指令，引導生物發育與生命機能運作。主要功能是資訊儲存，可比喻為「藍圖」或「配方」。其中包含的指令，是建構細胞內其他的化合物，如蛋白質與核醣核酸所需。帶有蛋白質編碼的DNA片段稱為基因。其他的DNA序列，有些直接以本身構造發揮作用，有些則參與調控遺傳訊息的表現。 DNA是一種長鏈聚合物，組成單位稱為脱氧核糖核苷酸，而…
线粒体DNA
粒線體DNA（，縮寫作'或'）是真核細胞中一些位於粒線體內的DNA，與一般位於細胞核內的DNA有不同的演化起源，可能是源自早期細菌。雖然現存真核生物體中絕大多數作用於粒線體的蛋白質，是由細胞核DNA所製造，但這些基因中有一些可能是源於細菌，並於演化過程中轉移到細胞核中，稱為。 現今人類體內的每個細胞中，大約有1000到10000個粒線體，而每一個粒線體內，則大約有2到10組mtDNA，每個mtDNA共包含16569個鹼基對，其中有37個…
核鹼基
核鹼基（）又称含氮鹼基（）、核苷酸碱基（），生物學常簡稱鹼基（），是一類性質為鹼性且擁有氮的化合物，也是在DNA和RNA中起配对作用的部分。例如嘧啶類是核碱基，胺類是最典型的含氮鹼基；核碱基与含氮碱基两者称呼只是强调重点不同而已，前者以生物学的角度强调此碱在核苷酸中，后者以化学的角度强调此有机碱含有氮原子。 核鹼基都是杂环化合物，其氮原子位于环上或取代氨基上，其中一部分（取代氨基，以及嘌呤环的1位氮、嘧啶环的3位氮）直接参與碱基配对。 …
八文字DNA
八文字DNA（，Hachimoji源自日語「八文字」的發音），是一種人工合成的核酸類似物，除含有四種天然DNA中含有的鹼基腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、鳥嘌呤（G）、胞嘧啶（C）外，還含有另外四種天然DNA中不含有的鹼基5-氮雜-7-脫氮鳥嘌呤（P）、6-氨基-5-硝基吡啶-2-酮（Z）、異鳥嘌呤（B）、1-甲基胞嘧啶（dS）。八文字DNA中的鹼基配對除天然DNA的A-T和G-C外，還存在Z-P與dS-B兩種配對方式。八文字DNA也存在…
核DNA
核DNA（英文：nuclear DNA，常简写为nDNA）即核脱氧核糖核酸，是存在于真核生物的细胞核内的DNA 。 它编码了真核生物基因组的大部分遗传信息，其余部分则由线粒体DNA和质体DNA编码。核DNA遵循孟德尔遗传规律，遗传自亲本双方，而不像线粒体或质体DNA那样仅通过母系遗传。 结构 核DNA是一种核酸，是一种聚合生物分子或生物聚合物，存在于真核细胞的细胞核中。其结构为双螺旋，即由两条链相互缠绕而成，这一结构最早由弗朗西斯·克里…
转录因子
在分子生物学中，转录因子（英語：Transcription factor）是指能够结合在某基因上游特异核苷酸序列上的蛋白质，这些蛋白质能调控其基因的转录，具体是通过调控核糖核酸聚合酶（RNA聚合酶，或叫RNA合成酶）与DNA模板股的结合。 转录因子的本质是与DNA特异性结合的一系列蛋白质。一般有不同的功能区域，如DNA结合结构域与效应结构域。转录因子不单与基因上游的启动子区域结合，也可以和其它转录因子形成转录因子复合体来影响基因的转录，…
田岛D检验
田岛D检验（）是日本学者田岛文生于1989年提出的一种统计检验方法，用于检验DNA序列在演化过程中是否遵循中性演化模型。 科学原理 在选择中性模型下，对于一个处于突变-漂变平衡且大小稳定的群体，群体参数「\theta」可以通过计算两两核苷酸差异的平均值「\pi」和分离核苷酸位点数量「S\,」两种方法来估算，且二者相等。因此： 对于双倍体DNA： : \theta=E[\pi]=E\left[\frac{S}{\sum_{i=1}^{n-…
C值謎
C值謎（C-value enigma）更常見且較早出現的名稱是C值悖論（C-value paradox）。指一個關於真核生物各物種的基因組大小差異的難題，也就是生物的C值（或基因組大小）並不與生物複雜程度相關的現象。例如植物與原生動物，可能具有比人類更大的基因組。 文獻 Gregory TR (2005). Genome size evolution in animals. In The Evolution of the Genome …
单倍群
在分子演化的研究中，单倍群（Haplogroup）是一组类似的单倍型（Haplotype），它们有一个共同的单核苷酸多态性祖先。因为单倍群由相似的单倍型组成，所以可以从单倍型来预测单倍群。单核苷酸多态性试验被用来确认单倍型。单倍群以字母来标记，并且以数字和一些字母来做补充，例如O3e1. Y染色体和线粒体单倍群有不同的单倍群标记方法。单倍群可用来标记数千年前的祖先来源。 在中，最常被拿來研究的单倍群是Y染色体（Y-DNA）单倍群和线粒体…
黏性末端与平末端
所谓黏性末端或黏状末端（），指DNA重组技术中，DNA限制酶在切开DNA的双链结构时，形成的突出末端，与平末端（Blunt Ends）相对。平末端则是上述切割过程中不突出的末端，所以DNA重组时操作难度稍大于黏性末端。 切割而成。]]
類轉錄活化因子核酸酶
類轉錄活化因子核酸酶（）是融合TAL因子DNA-结合区域和DNA剪切区域产生的人工制造的限制酶。 限制酶是在特定顺序剪切DNA链的酶。類轉錄活化因子(TALEs)可被快速改造后结合任意DNA顺序。 通过结合这样改造过的TALE和一个DNA剪切结构域，可以将限制酶改造以剪切任意想要的DNA顺序。当这些限制酶被引入细胞，可被用来做基因組原位编辑。 参考
遺傳指紋分析
遺傳指紋分析（），有时也称为基因标定或基因鉴定等，是一种使用通过比较DNA片段来区别不同个体的方法。于1984年，由莱斯特大学的亚历克·杰弗里斯教授发明。 用限制性内切酶消化含短重复序列的DNA，以分析不同个体产生的片段差异。因为它们对每个个体而言都是独一无二的（同卵雙胎例外），任何两个个体出现特定的长短的DNA片段，就能用于确定它们间有无共同的遗传来源。此技術廣泛使用於亲子鑒定、法證科學、譜系鑒證和辨別瀕危物種等領域。 鉴定方法 限制…
起始密码子
起始密码子（）是指定信使RNA（mRNA）上开始合成蛋白质的密码子，也是第一个被核糖体翻译的mRNA上的密码子。 的基因结构。]] 的基因结构。]] 起始密码子位于编码区内，紧邻5′非翻译区（原核生物的核糖体结合位点附近）。较为常见的起始密码子是AUG，编码真核生物中的甲硫氨酸和原核生物中的N-甲酰甲硫氨酸（fMet）。此外，GUG（缬氨酸）或AUA（异亮氨酸）、UUG （亮氨酸）等也用作起始密码子。部分研究还发现了几十种密码子可以用于…
环境DNA
环境DNA（）是指从土壤、海水、雪或空气等各种环境样本中采集的DNA ，而不是直接从个別生物体中采集的DNA。当各种生物体与环境相互作用时，DNA会从各种来源，排出至环境中累积。 近年来，环境DNA應用在偵測原本無法發現的濒危野生动物。 2020年，人类健康研究人员利用环境DNA技术追踪COVID-19大流行。 环境DNA 的樣本来源包括但不限于粪便、粘液、配子、蛻皮、尸体和毛发。 通过高通量DNA 测序方法（称为宏基因组学、元DNA条…
响应元件
响应元件或应答元件（）是基因啟動子区域的一段短的DNA序列，能与特异的转录因子结合，调控基因的转录。 在接受外界刺激条件下，转录激活蛋白会结合到响应元件上启动相应基因的转录。如果不同的基因在其调控区域有着相同的响应元件，这些基因会被相同的刺激条件激活，产生协同的应答。 激素反应元件 激素反应元件 (HRE) 是基因启动子内的一段短DNA序列，能够与特定的激素受体复合物结合，从而调节转录。 该序列最常见的是由三个核苷酸分隔的一对反向重复序…
核酸二级结构
核酸二级结构（）是单个核酸聚合物内或两个聚合物之间的碱基对相互作用。它可以被表示为在核酸分子中配对的碱基的一个列表。 生物DNA的和RNA的二级结构往往有所不同：生物DNA主要以完全碱基配对的双螺旋的形式存在，而生物RNA是单链的，并且由于来自核糖中额外的羟基增加的形成氢键的能力而形成错综复杂的碱基配对相互作用。 在非生物学背景下，由于碱基对的模式最终决定了分子的整体结构，因此二级结构对于DNA纳米技术和DNA运算的核酸结构的至关重要。…