单倍群

在分子演化的研究中,单倍群(Haplogroup)是一组类似的单倍型(Haplotype),它们有一个共同的单核苷酸多态性祖先。因为单倍群由相似的单倍型组成,所以可以从单倍型来预测单倍群。单核苷酸多态性试验被用来确认单倍型。单倍群以字母来标记,并且以数字和一些字母来做补充,例如O3e1. Y染色体和线粒体单倍群有不同的单倍群标记方法。单倍群可用来标记数千年前的祖先来源。

在中,最常被拿來研究的单倍群是Y染色体(Y-DNA)单倍群和线粒体DNA(mtDNA)单倍群,这两个都可以被用来定义遗传群体。Y染色体脱氧核糖核酸单倍群仅能以父系遗传,同时mtDNA仅能以母系遗传。

基于遗传标记的人类单倍型分类,特别是借助(UEPs),在过去几年中快速发展着。

单倍群群体遗传学
一般被认为对于某个存活到现在的特定单倍型突变,自然选择并不存在偏好与否,所以除去突变率(其会根据不同的标记而变化)群体遗传学中主要影响单倍群比例的原因是遗传漂变。

人類Y染色體DNA單倍型類群
人類Y染色體DNA(Y-DNA)單倍型類群被命名為A到T,其中部分被更進一步以數字及小寫拉丁字母細分。主Y染色體單倍型類群編號的設計係由Y染色體協會建立。

Y染色體亞當是由研究人員命名,用來指稱人類父系的最近共同祖先。主要的Y染色體單倍群及其在前歐洲殖民地發生狀況的地理分佈如下:

人類粒線體DNA單倍體群
人類粒線體DNA單倍體群被標為不同字母:
A,
B,
C,
CZ,
D,
E,
F,
G,
H,
pre-HV,
HV,
I,
J,
pre-JT,
JT,
K,
L0,
L1,
L2,
L3,
L4,
L5,
L6,
L7,
M,
N,
O,
P,
Q,
R,
S,
T,
U,
UK,
V,
W,
X,
Y, and
Z.

定義群體
單倍群可以用來定義遺傳學群體和地理分佈。例如,以下是mtDNA單倍群一般性區域分佈:

  • 非洲人:L0、L1、L2、L3、L4、L5、L6
  • 西部歐亞人:H、T、U、V、X、K、I、J、W
  • 東部歐亞人:A、B、C、D、E、F、G、Y、Z
  • 美洲原住民:A、B、C、D、X
  • 澳洲-美拉尼西亞人:P、Q、S

線粒體單倍群分為3群,以3個連續的字母L、M、N表示。人類第一次在群內分離成L0和L1-6。L1-6隨後引伸出其他群,其中的L3分離成M和N群。M群組成包括人類第一波由離開非洲,順著南部沿海地區向東的大遷移​​路線。

Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群的相同之處
以下是Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群大約的相同之處:

參看
*国际人类基因组单体型图计划
*遺傳系譜學
*遺傳學
註釋
參考文獻

外部連結
一般資料
*[https://web.archive.org/web/20080621100705/http://www.worldfamilies.net/y-haplogroups.htm World Families Network]

新聞
[http://www.springerlink.com/media/53f7mgywmp4qtqrgtav0/contributions/f/1/4/2/f142j25785572821_html/fulltext.html 印地安人的母系基因池],Journal of Human Genetics*
*[http://dienekes.blogspot.com/ Dienekes' Anthropology Blog] frequent highlights of new results.

所有單倍體群
*https://web.archive.org/web/20040728005528/http://www.scs.uiuc.edu/~mcdonald/WorldHaplogroupsMaps.pdf

Y染色體DNA單倍型類群
*[https://web.archive.org/web/20170116195823/http://ycc.biosci.arizona.edu/ Y Chromosome Consortium]
*[http://www.isogg.org/tree/index.html ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree 2006]
*[https://web.archive.org/web/20060218111549/http://dnaheritage.com/ysnptree.asp DNA Heritage's Y-haplogroup map]
*[https://web.archive.org/web/20061202091845/https://home.comcast.net/~whitathey/predictorinstr.htm Haplogroup Predictor]
*The Y Chromosome Consortium (2002), [http://www.genome.org/cgi/content/full/12/2/339 A Nomenclature System for the Tree of Human Y-Chromosomal Binary Haplogroups], Genome Research, Vol. 12(2), 339-348, February 2002. (Detailed hierarchical [http://www.genome.org/cgi/content-nw/full/12/2/339/F1 chart] has conversions from previous naming schemes)
*[http://dnaconsultants.com/images/links/49-conversion.pdf DNA Consulting's Conversion Chart for Male Haplogroups] (PDF)
*Semino et al (2000), [https://web.archive.org/web/20031125151213/http://hpgl.stanford.edu/publications/Science_2000_v290_p1155.pdf The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans], Science, Vol 290 (paper which introduced the "Eu" haplogroups).

粒線體DNA單倍體群
*[http://www.stats.gla.ac.uk/~vincent/images/skeleton07-08-02.jpg graphical mtDNA haplogroup skeleton]
*[https://web.archive.org/web/20080504045831/http://www.ajhg.org/AJHG/fulltext/S0002-9297%2807%2960403-0 The Making of the African mtDNA Landscape]
*[https://web.archive.org/web/20080504045835/http://www.ajhg.org/AJHG/fulltext/S0002-9297%2807%2961263-4 Do the Four Clades of the mtDNA Haplogroup L2 Evolve at Different Rates?]

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