查戈夫法則
查戈夫法则（，也称查加夫法则、查格夫法则），是由埃尔文·查戈夫于1940年提出，指在任何物种和任何生物体的DNA中，鸟嘌呤（G）的含量应等于胞嘧啶（C）的含量，腺嘌呤（A）的含量应等于胸腺嘧啶（T）的含量。此外，嘌呤（G、A）和嘧啶（C、T）碱基的化学计量比应为1:1（即A+G=T+C ）。该规则在 DNA 的两条链中都有发现。 定义 查加夫第一对等规则 第一对等规则认为，构成双链DNA分子的碱基总体上具有百分比对相等性：A% = T%…
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游离DNA
循环游离DNA（cfDNA） （也称为游离DNA，有时称为游离核酸）是释放到血浆、尿液、脑脊液等体液中的降解DNA片段。cfDNA片段的典型大小反映了染色体颗粒（~165 bp）以及多个核小体，可保护DNA免受凋亡核酸酶的消化。游离核酸存在于细胞外，具有胞间通讯及免疫调节功能，贯穿机体生老病死各个过程，可用于描述在体液中自由循环的各种形式的DNA，包括循环肿瘤DNA（ctDNA） 、无细胞线粒体DNA（ccf mtDNA）、无细胞胎儿D…
核酸双螺旋
之间的氢键结合]] 在分子生物学中，双螺旋是指由核酸（如DNA和RNA）的双链分子所形成的结构。核酸复合物的双螺旋结构是它的二级结构的结果，并且是确定其三级结构的基本组成部分。这个术语因詹姆斯·杜威·沃森于1968年出版的《双螺旋：发现DNA结构的故事》而闻名。 双螺旋结构的聚合物，是由核酸的单体核苷酸的碱基配对在一起在最常见的双螺旋结构物质B-DNA中（见下）中，双螺旋是右手螺旋，环绕一圈大概经过10–10.5 个核苷酸.DNA的双螺…
核酸三级结构
核酸三级结构是核酸聚合物的三维形状。 RNA和DNA分子具有从分子识别到催化的各种功能。 这些功能需要精确的三维三级结构。 虽然这种结构多样且看似复杂，但它们由重复的，易于识别的三级结构基序组成，用作分子构建模块。 RNA和DNA三级结构的一些最常见的基序如下所述，但该信息基于有限数量的解析结构。 螺旋结构 双螺旋 双螺旋是生物DNA的主要三级结构，也是RNA的可能结构。据信在自然界中发现了三种DNA构象，即A-DNA，B-DNA，和Z…
染色质免疫沉淀-测序
染色质免疫沉淀-测序（，简称为ChIP-seq）被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀（ChIP）与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前，ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。 ChIP-seq的应用 ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA…
梅瑟生–史達實驗
梅瑟生-史達實驗（Meselson-Stahl experiment）是馬修·梅瑟生（Matthew Meselson）與富蘭克林·史達（Franklin Stahl）在1958年所作的實驗，該實驗證明了由華生及克里克所提出的DNA複製的半保留性質假說。在半保留複製中，當雙鏈DNA螺旋被複製時，兩個新的雙鏈DNA螺旋中的每一個都由一條來自原始螺旋的鏈和一條新合成的鏈組成。此實驗被稱為「生物學中最美的實驗」。 實驗過程與結果 氮是DNA的…
核酸序列
核酸序列（）是指核酸結構中的含氮鹼基，共有四種，分別為A（腺嘌呤）、T（胸腺嘧啶）、C（胞嘧啶）、G（鸟嘌呤），並且有無窮盡的線性排列組合來表達基因，而各個基因都具有獨特的鹼基序列。两个碱基形成一个碱基对，碱基对的配对规律是固定的，即A配對T，C配對G。三个相邻的碱基对形成一个密码子。一种密码子对应一种氨基酸，不同的氨基酸合成不同的蛋白质。在DNA的复制及蛋白质的合成过程中，碱基配对规律是十分关键的。 DNA的字母排列有A、C、G、T，…
核糖体脱氧核糖核酸
核糖体脱氧核糖核酸（，缩写：rDNA），简称核糖体DNA（），是一种DNA序列，该序列用于rRNA编码。核糖体是蛋白质和rRNA分子的组合，翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件。如该图所示，真核生物的rDNA包括一个单元段，一个操纵子，以及由、、18S 核糖体RNA、、5.8S rRNA、和28S rRNA束组成的串联重复序列。rDNA的还有另一个基因，由5S rRNA基因编码，位于大多数真核生物的基因组中。5S rDNA序列也存在于果蝇…
嘧啶二聚体
嘧啶二聚体（，简称PD），是DNA或RNA中的相邻碱基，如胞嘧啶及胸腺嘧啶，在紫外线的诱导下進行光化学合成，於碳-碳雙鍵生成共价键而形成的一种化合物，是突变产生的原因之一 。在双链RNA中，紫外線也可能導致脲嘧啶二聚體生成。紫外線二聚體的常見例子包括环丁烷嘧啶二聚体及6-4光产物。它們改變了DNA原有結構，令聚合酶無法正常運作，DNA無法複製。嘧啶二聚体可通過光致活作用或核苷酸切除修复的作用來修復。如果最終無法修復，可引致突變。 種類 …
單核苷酸多態性
的位点上存在差异（此图为“G/A 多态性”）。]] 單核苷酸多態性（single-nucleotide polymorphism，SNP，讀作）是在同一物种不同个体的基因组DNA中的等位序列上，因同一特定位点的单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性。SNP通常特指生殖细胞系的单核苷酸置换变异（germline substitution），此变异可通过遗传传递给后代，并成为群体中稳定的遗传多态性。 單核苷酸多態性（SNP）是DNA序列中单…
啟動子
在遺傳學中，啟動子（）是指一段能使特定基因進行轉錄的DNA序列。啟動子可以被RNA聚合酶辨認，并开始转录合成RNA。在RNA合成中，啟動子可以和调控基因转录的转录因子产生相互作用，控制基因表达（转录）的起始时间和表达的程度，包含核心启动子区域和调控区域，就像“开关”，决定基因的活动，繼而控制細胞开始生產哪一種蛋白質。 启动子位于控制基因表达的调控序列中、基因转录起始位点的上游（朝向DNA-{zh-hans:正义链;zh-hant:編碼股…
义 (分子生物学)
“义”（）在分子生物学中指一段核酸分子（如DNA与RNA）及其互补序列，在指定合成RNA序列（转录）或指定合成氨基酸序列（转译）中的作用性质。 例如，若RNA含有一个可被翻译为多肽的编码区，则该段RNA称为：正义链（股）、有义链（股），或简称：正链、正股、正义、有义；反之，若RNA需要先形成mRNA，再合成蛋白质，则其为：负义链（股）、反义链（股），或简称：负链、负股、负义、反义。 參考
有义链
遗传学中，有义链（，又称编码链、密碼股、非模板链）是指双链脱氧核糖核酸（DNA）中，在5'端到3'端方向上携带可翻译编码的链。由于双链 DNA在转录 RNA时，只有一条 DNA链会转录成 RNA，此“有义DNA链”的序列具有与 RNA（尤其是 mRNA，但也包括 ncRNA）“相当”的脱氧核糖核苷酸序列（U以T代替）。在转录 RNA时，这条有义DNA链只提供编码，而非转录过程的模板。 与其“相对”的另一条DNA链称为反义链（，又称模板链…
脫氨作用
脫胺作用（，亦可称为脱胺基），是指移除分子上的一個氨基。人類的肝臟經由脫氨作用將氨基酸分解，當氨基酸的氨基被去除之後，會轉變成氨。由碳及氫所組成的殘餘部分，則回收或氧化產生能量。對人體而言，氨具有毒性，因此某些酵素將會在尿素循環中將二氧化碳分子附加其上，使氨轉變成尿素或尿酸。之後這些尿素及尿酸再經由尿液排出體外。 經脫氨作用成為尿嘧啶]] 除了氨基酸之外，DNA的構成物之一胞嘧啶（C）也會因為脫氨作用而轉變成尿嘧啶（U）；胞嘧啶受到甲基…
碱基类似物
碱基类似物（）是具有取代核苷酸中核碱基功能的化学物质，是一类能够诱发点突变的试剂。例子有：5-溴尿嘧啶和2-氨基嘌呤。 碱基类似物在进入细胞后通过补救途径转化为相应的脱氧核苷三磷酸类似物，并接下来在DNA复制中代替dNTP进入DNA分子中。由于它们与正常的碱基在结构上毕竟有差异，因此它们的配对性质将与正常的碱基有所不同。错误的配对性质最终会导致DNA中的碱基对发生转换。
核酸結構
核酸結構（）是指如DNA与RNA的核酸。从化学角度上讲，DNA与RNA是非常相似的。DNA与RNA的结构常分为四个不同水平：一级、二级、三级及四级。 能夠直接計算出DNA機械性質的實驗技術相對較新，且要在溶液中進行高解析度觀察也較困難，不過科學家仍然解出了許多關於DNA機械性質的數據。關於DNA機械性質的研究，包括不同型態的DNA雙螺旋、DNA超螺旋、非螺旋型態、鹼基配對鍵結、熔點等。 一级结构 一级结构是由通过磷酸二酯键连接在一起的核…
方向性 (分子生物学)
原子的呋喃糖分子。]] 方向性（）亦称定向性、指向性、指向，在分子生物學与生物化学中，是指单链核酸的端到端化学方位取向。 在单链 DNA 或 RNA 中，按照核苷酸中戊糖环（pentose-sugar-ring）碳原子位次编号化学命名惯例，指定 5′端（five-prime end）代表「上游」和 3′端（three-prime end）代表「下游」{{NoteTag|1=注意：此处使用符号为 prime【′】角分符号，而非 apost…
内含子
内含子（）是一个基因中非编码DNA片段，它分开相邻的外显子。更精确的定义是：内含子是阻断基因线性表达的序列。DNA上的内含子会被转录到前mRNA中，但RNA上的内含子会在RNA离开细胞核进行转译前被剪除。在成熟mRNA被保留下来的基因部分被称为外显子。真核生物的基因含有外显子和内含子，是前者区别原核生物的特征之一。但是注意，这并不代表原核生物的基因没有内含子，如细菌核糖核苷酸还原酶基因中罕见的有内含子。 内含子可能含有“旧码”，就是在演…
互補脫氧核醣核酸
的輸出。]] 互補DNA（，缩写）是一種利用逆轉錄酶，以RNA（通常是mRNA）為模板做成的複製品，經常用來將真核生物的基因（以mRNA形式）複製到原核生物細胞中。 一个cDNA可含有一个或多个mRNA，含有許多來自不同基因的mRNA的cDNA稱為cDNA基因庫（cDNA library) cDNA克隆的关键环节是以mRNA为模板利用逆轉錄酶合成cDNA。 用途 逆转录PCR过程中，RNA单链会被逆转录为cDNA之后通过PCR进行复制。…
DNA甲基化
分子的中心，两个胞嘧啶被甲基化。 DNA甲基化对于在发育和疾病表观遗传基因调控中起重要作用。]] DNA甲基化（）為DNA化學修飾的一種形式，能在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。為表觀遺傳編碼（epigenetic code）的一部分，是一種外遺傳機制。DNA甲基化過程會使甲基添加到DNA分子上，例如在胞嘧啶環的5'碳上：這種5'方向的DNA甲基化方式可見於所有脊椎動物。 在人類細胞內，大約有1%的DNA鹼基受到了甲基化。在成熟…