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基质辅助激光解吸/电离

质谱仪]] 基质辅助雷射脫附电离( ,MALDI)是一种用于质谱法的溫和离子化技术,可以得到用常规离子化方法容易解离為碎片的一些完整大分子质谱訊息,比如生物分子类的DNA,生物高分子、蛋白质、多肽和糖,以及其他大分子量的有机分子,如高分子、树状分子和其他高分子。在这方面类似于同样是软离子化方法的(ESI),不过MALDI更容易得单电荷的离子峰。 MALDI方法过程分为三个步骤。首先,将样品溶液與合适的基质水溶液混合,並取微量混合液體滴置…

同位素标记

同位素标记是一项用于追踪同位素在某个化学反应、代谢通路、或细胞定位中的路径和去向的技术。在使用时,通过把特定的反应物分子中的某个原子替换为其同位素来进行“标记”,再让标记过后的反应物发生反应,产物分子中同位素标记的位置就反映了反应过程中被标记原子的变化。在同位素标记中使用的核素可以是稳定核素,也可以是放射性核素,在后面这种情况中,特称放射性示踪技术。 在同位素标记技术中,检测同位素标记的方法有很多种。质谱可以用于检测不同同位素的质量差异…

全染料

全染料(),也称染料-ALL,是一种羰花菁阳离子染料,能与众多阴离子生物大分子结合产生不同颜色,包括阴离子蛋白质、核酸、阴离子多糖等。 性质 全染料是一种异染性染色剂,根据结合的分子不同,呈现出不同的颜色。染色1小时后,磷蛋白的检测限可以达到1 ng以下,多糖的检测限则在10 ng到500 ng之间。与高阴离子蛋白质结合显蓝色、与蛋白聚糖显紫色、与一般阴离子蛋白显粉色。与RNA结合为蓝紫色,且检测限为90 ng;与DNA结合显蓝色,检测…

XDNA

xDNA是一种经过特殊修改后的DNA分子,一共有8种,原有的四种碱基,以及在原有的四种碱基上增加苯环,形成新的四种碱基:xA, xC, xG,和xT. A和xT配对,C和xG配对,G和xC配对,T和xA配对。通过这种方法,增加了DNA双链的间距,从而使DNA分子双链的氢键断裂温度提高。 研究xDNA是为了更好的了解自然DNA分子。而且,新DNA分子还自带荧光,这有助于研究DNA的突变以及其他一些生物系统。 参考来源

N,N'-二異丙基碳二亞胺

N,N'-二異丙基碳二亞胺是一种用于肽合成的碳二亚胺。因為N,N'-二異丙基碳二亞胺在常溫常壓下作液体,它比常用的蜡状固体N, N′-二环己基碳二亚胺更容易处理。此外,N,N'-二異丙基碳二亞胺在许多化学反應中生成的N,N'-二異丙基脲可溶于大多数有机溶剂,这一特性有助于產物的后处理。 参考文献 擴展阅读

GCaMP

GCaMP是一种基因编码钙指示剂(GECI),最初由中井淳一于2001年开发。 它由绿色荧光蛋白(GFP)、钙调蛋白(calmodulin,CaM)和源自肌球蛋白轻链激酶的肽序列M13通过人工融合构成。 当与Ca2+结合时,GCaMP会发出绿色荧光,其激发峰波长峰值为480 nm,发射峰波长约为510 nm。 在生物学研究中,GCaMP被广泛用于测量体外和体内细胞内Ca2+水平,通常通过病毒转染或在转基因细胞系与动物品系中表达。 GCa…

荧光共振能量转移

5'-三磷酸 水解酶 ARF 显示蛋白在活巨噬细胞里位于高尔基体。]] 荧光共振能量转移(),是描述两个生色团之间能量转移的一种机制。 激发态上的供体生色团,有可能通过偶极耦合将能量传递给受体生色团(两者距离通常在1nm附近)。 福斯特能量共振转移(FRET)类似于近场传输,即反应的作用距离远小于激发光的波长。在近场区域,激发态的供体生色团发射虚拟光子,光子旋即被受体发色团吸收。该些光子是无法探测的,因为他们的存在违反了能量和动量守恒。…

尺寸排除色谱法

尺寸排除色谱法(,縮寫:SEC),也称为分子筛色谱法, 是一种将溶液中的分子按其大小(在某些情况下为分子量)分开的色谱法。 这种方法通常被用于分离大分子或高分子复合物(例如蛋白质和工业聚合物)。当使用水溶液将样品运输通过色谱柱时,该技术通常称作凝胶过滤色谱法,而不是叫做(用有机溶剂作流动相时使用的技术才叫凝胶渗透色谱法)。色谱柱中装有细小的多孔珠,它们的成分是葡聚糖聚合物(Sephadex)、琼脂糖(Sepharose)或聚丙烯酰胺(S…

N,N'-二环己基碳二亚胺

*N,N-二環己基碳二亞胺(簡稱為DCC)是一個常用的脫水劑,化學式為C13H22N2,在多肽合成時尤其重要。 性质 白色有气味的晶体,熔点很低,可溶于二氯甲烷、四氢呋喃、乙腈和二甲基甲酰胺,但不溶于水。 分子中的C-N=C=N-C一部分不是平面结构,为正交排列,类似于丙二烯。它有以下共振式: :\rm \ RN\!=\!C\!=\!NR \leftrightarrow RN^+\! \equiv \!C\!-\!N^-R \leftr…

拉氏图

拉氏图(又名 Ramachandran 图、[φ,ψ]图、α-碳与酰胺平面交角图,),起初是于1963年由納拉亞南·拉馬錢德蘭、C·拉瑪克里希南(C. Ramakrishnan)和提出的,是一种使蛋白质结构中,主链氨基酸残基的二面角 ψ 和 φ 可视化的方法。 左侧的图形说明了主链二面角φ 和 ψ 的定义(当时被Ramachandran叫做 φ 和 φ')。肽键处的 ω 角通常是 180°,因为肽键的部分双键性质使它保持平面结构。右上方…

动态光散射

动态光散射(),也称作光子相关光谱或准弹性光散射,是一种物理表征手段,用来测量溶液或悬浮液中的粒徑分布,也可以用来测如量高分子浓溶液等的复杂流体的行为。 原理 当光射到遠小于其波長的小颗粒上时,光会向各方向散射(瑞利散射)。如果光源是雷射,在某一方向上,我们可以观察到散射光的强度随时间而波动,这是因为溶液中的微小颗粒在做布朗运动,且每个发生散射的颗粒之间的距离一直随时间变化。來自不同顆粒的散射光因相位不同產生建設性或破壞性干涉。所得到的…

FLAG標籤

FLAG標籤(FLAG-Tag)是一種生命科學領域常用的。可使用分子生物學手段將FLAG標籤與目的蛋白結合,形成一個新的重組蛋白分子。這個重組蛋白分子可以與抗FLAG標籤的抗體結合,可以節約專門針對蛋白設計抗體的費用和精力。FLAG标签是第二个在文献中常被使用的功能齐全的蛋白标签。 序列 FLAG標籤的氨基酸序列是: ;DYKDDDDK(D=Asp(天冬氨酸), Y=Tyr(酪氨酸), K=Lys(賴氨酸)) 參見 HA標籤 組氨酸標籤…

TRIzol

TRIzol,是一種能分離RNA、DNA、蛋白質的試劑。該試劑常溫下爲紫紅色液體。其主要成分爲苯酚和。苯酚具有毒性和腐蝕性,而則具有刺激性。該試劑是以Piotr Chomczyński與Sacchi, N在1987年提出的一步分離RNA法爲基礎發明的。 TRIzol爲由(Life Technologies)持有的商標,而由MRC生產的同種試劑則名爲TRI Reagent(Reagent,意爲「試劑」)。 用法簡述 將組織或培養的細胞與T…

核酸酶保护分析

核酸酶保护分析(,亦称为核糖核酸酶保护测定)是一项用于生物化学与遗传学的实验室技术,可用以从细胞中提取出来混杂的RNA样本中鉴定出单独的RNA。此技术可以在即使总浓度很低的情况下鉴定一种或多种已知序列的RNA分子。被提取出来的RNA首先与反义RNA或DNA探针相混合,探针是与被研究的序列相互补的,接下来互补链相互杂交以形成双股RNA(或DNA-RNA杂交分子)。此混合物接下来接触核糖核酸酶,这种酶特异性地切割仅为单股的RNA,但对双股R…

N-乙基马来酰亚胺

*N-乙基马来酰亚胺(,缩写NEM*)是一种含氮有机化合物,化学式C6H7NO2,是马来酰亚胺的N-乙基取代物,带有酰亚胺官能团,其碳碳双键可以与硫醇反应,常用于修饰肽链上的半胱氨酸残基。 参考文献 外部链接 The MEROPS online database for peptidases and their inhibitors: [http://meropstest.sanger.ac.uk/cgi-bin/smi_summary…

蛋白酶K

在分子生物学中蛋白酶K(),,化学式为:C1247H1933O416N357S10,也被称为内肽酶K(endopeptidase K)、腐生真菌碱性蛋白酶(Tritirachium alkaline proteinase)、腐生真菌丝氨酸蛋白酶(Tritirachium album serine proteinase)、腐生真菌蛋白酶K(Tritirachium album proteinase K),是一种用途广泛的丝氨酸蛋白酶。这种…

組氨酸標籤

組氨酸標籤(,或 hexa histidine-tag, 6xHis-tag, His6 tag)是由連續六個以上的組氨酸所組合而成的一段氨基酸序列。最初為Roche公司發明,帶有組氨酸標籤的质粒則為Qiagen所有,由於原始的專利保護已經過期,故不論學術或商業皆可免費使用。一般而言,科學家藉由基因工程將此標籤放置於重組蛋白質的N端、C端或兩端。 應用 蛋白質純化 以大腸桿菌或其他原核生物表現的重組蛋白會累積在細胞質中,為了取得重組蛋白…

放射性示踪剂

放射性示蹤劑(),又稱放射性標記物(),一種化合物,其中的一個或多個原子被替換為放射性同位素(radioisotope),是同位素標記(isotopic labeling)的一种。由于這種化合物在衰變過程中會產生放射性,經由追踪其放射性,可以了解化合物從反應物到產物的路徑,从而研究化学反应机理。 氫(H)、碳(C)、磷(P)、硫(S)和碘(I)的放射性同位素被廣泛地用来追蹤生化反應路徑。放射性示蹤劑也可用於在細胞和組織等生物系統中追踪某…

脂类组学

脂类组学()是生物系统中细胞脂类途径和网络的大规模研究。“(Lipidome)”一词用于描述细胞,组织,生物或生态系统中的完整脂类谱, 是“代谢物组(Metabolome)”的一个子集,其中还包括其他三大类生物分子:蛋白质/氨基酸,糖类和核酸。脂类组学是一个相对较新的研究领域,它受到质谱法(MS),核磁共振波谱法(NMR),荧光光谱,,和计算方法等技术的快速发展的推动,并且结合到脂类在许多代谢疾病中的角色的认识,例如肥胖症,动脉粥样硬化…