組氨酸標籤
組氨酸標籤（，或 hexa histidine-tag, 6xHis-tag, His6 tag）是由連續六個以上的組氨酸所組合而成的一段氨基酸序列。最初為Roche公司發明，帶有組氨酸標籤的质粒則為Qiagen所有，由於原始的專利保護已經過期，故不論學術或商業皆可免費使用。一般而言，科學家藉由基因工程將此標籤放置於重組蛋白質的N端、C端或兩端。 應用 蛋白質純化 以大腸桿菌或其他原核生物表現的重組蛋白會累積在細胞質中，為了取得重組蛋白…
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整合膜蛋白
; P=細胞膜; I=細胞內空間]] 整合膜蛋白（，縮寫：IMP）是一種永久附著在生物膜上的膜蛋白。所有跨膜蛋白都是IMP，但並非所有IMP都是跨膜蛋白。IMPs占生物體基因組中編碼的蛋白質的很大一部分。穿過膜的蛋白質被包圍，環狀脂質被定義為與膜蛋白質直接接觸的脂質。只能使用去污劑，非極性溶劑或有時使用變性劑將此類蛋白質與膜分離。 參見 膜蛋白 跨膜蛋白 參考資料
低温电子显微镜
低温电子显微技術（，缩写：cryo-EM），是穿透式电子显微镜（TEM）的其中样品在超低温（通常是液氮温度-196℃）下进行型態研究的一种技术。 歷史 早在1960年，便開始有學者提出這個想法並且投入相關研究，結果卻不盡理想。 1974及1975年關鍵的兩年，開始有學者陸續提出各種更佳的解決方案。肯·泰勒（Ken Taylor）和羅伯特·格拉瑟（Robert Glaeser）博士發現冷凍樣品可以保持蛋白質的高解析度訊號。理查德·亨德森博…
雙硫鍵
二硫鍵，又称-{zh-cn:双硫键;zh-tw:二硫鍵;zh-hk:二硫鍵;}-或雙硫橋，是从硫醇衍生的單共價鍵，常见於生物化學的範疇。含有二硫鍵的有机硫化合物被称为二硫化物。與過氧化物（R-O-O-R）相似，它的整體連結是R-S-S-R。雙硫鍵一般都是從巯基的氧化形成： :\mbox{R-SH} + \mbox{R-SH} \rightarrow \mbox{R-S-S-R} + \mbox{2H}^{\mbox{+}} + \mbo…
N端
-甘氨酸-絲氨酸-丙氨酸）。其N端用綠色標記，而C端則由藍色標記]] N端（亦作N-端，），又稱氮端、氨基端，指多肽鏈具有遊離的α氨基的末端。在轉譯過程中，多肽鏈是從N端往C端合成的，因而在書寫多肽序列時，從N端開始書寫，從左到右寫到C端。 參見 *C端 參考
原聚體
原聚體(Protomer)指蛋白質的最大重複單位。 蛋白質可能由多個肽链組成，這些肽链稱為次單元(subnit)。一個蛋白質中可能由多種肽链組成，有的由重複的相同肽链組成。當其中有出現重複而相同的肽链，這些肽链就可以稱為原聚體。一個原聚體可能由一個或多個肽链組成，若蛋白質中有多組肽链相互連接且重複，這一整組肽链即可稱為一個原聚體。舉例來說，血紅素由兩個α肽链和兩個β肽链組成，其中每一個α肽链都和一個β肽链以非共價方式連接，因此除了說此蛋…
複合蛋白質
— 血红蛋白的辅基]] 复合蛋白质（），又称结合蛋白质、缀合蛋白质，是蛋白质多肽链通过化学共价或弱相互作用力与非氨基酸、非肽分子结合形成，该类分子包括金属离子、脂质、糖类和核酸等（即除氨基酸残基外，还含有其他化学组分的蛋白质），这些化学基团相互作用进而促进蛋白质发挥作用。根据辅基不同可分为糖蛋白（含糖类）、脂蛋白（含脂质）、磷蛋白（含磷酸）、核蛋白（含核酸）、色蛋白（含色素）、黄素蛋白（含核黄素）和金属蛋白（含铁、铜或锌等金属）7类。 …
蛋白质四级结构
蛋白质四级结构（）是生物化学中用于描述多亚基蛋白质复合体中各个折叠蛋白质亚基的排列组合。 描述和示例 许多蛋白质实际上是多个多肽链的组装。 四级结构是指蛋白质亚基相对于彼此的数目和排列。具有四级结构的蛋白质的实例包括血红蛋白，DNA聚合酶和离子通道。 由具有不同功能的亚基组成的酶有时被称为全酶，其中一些部分可以称为调节亚基，功能核被称为催化亚基。作为多蛋白质复合体的其它组件也具有四级结构。实例包括核小体和微管。四级结构的变化可以通过个体…
结构模体
结构模体（）也称结构基序，是链样生物分子（如蛋白质或核酸）中普遍存在且具有特征性的局部三维结构（超二级结构）单元模式。结构模体常为某种功能決定部位，可出现在各种不同的、演化上不相关的链样分子中。结构模体使得我们无法预测蛋白的生物学功能：不同蛋白质或酶中的相同模体可能存在较大功能差异。 因为一级结构和三级结构之间的关系并不简单直接，两个生物聚合物可以共享同一个模体又缺乏明显的一级结构的相似性。换言之，一个结构模体不必要具有与一个相关。另外…
C端
-甘氨酸-絲氨酸-丙氨酸）。其N端用綠色標記，而C端則由藍色標記]] C端（亦作C-端，），又稱碳端、羧基端，指多肽鏈具有遊離的α羧基的末端。在轉譯過程中，多肽鏈是從N端往C端合成的，因而在書寫多肽序列時，從N端開始書寫，從左到右寫到C端。 參見 *N端 參考
蛋白質一級結構
的一級結構是一串的胺基酸。]] 蛋白质一级结构（）是肽或蛋白质中氨基酸的线性序列，即氨基酸序列（amino acid sequence）。按照惯例，蛋白质的一级结构被报道从氨基末端（N）端到羧基末端（C）端。蛋白质生物合成最通常由细胞中的核糖体进行。肽也可以在实验室中合成。蛋白质一级结构可以直接进行蛋白质测序，或从DNA序列推断。 在生物化學裡，生物分子的一級結構是其分子組成和分子間化學鍵結的精確模樣。對於一典型的無分支、無交叉的生物聚…
蛋白质结构
蛋白质结构是指蛋白质分子的空间结构。作为一类重要的生物大分子，蛋白质主要由碳、氢、氧、氮、硫等化学元素组成。绝大部分蛋白质都是由20种不同的L型α氨基酸连接形成的聚合物，但还存在另外两种不常见氨基酸，硒半胱氨酸、吡咯赖氨酸，参与到极少数的蛋白质合成中（其翻译机制也不同于61种密码子）。在形成蛋白质后，这些氨基酸又被称为残基。 蛋白质和多肽之间的界限并不是很清晰，有人基于发挥功能性作用的结构域所需的残基数认为，若残基数少于40，就称之为多…
结构生物学
结构生物学（Structural biology）是分子生物学、生物化学和生物物理学的分支学科，其研究涉及生物大分子（如蛋白质的分子和核酸的分子）的三级结构（tertiary structure）（包括构架和形态）、它们是如何获得它们的结构、它们的结构改变如何影响其功能。 生物学家对该主题非常感兴趣，因为大分子实现了细胞的大多数功能，并且只有通过卷绕成特定的三维形状才能实现这些功能；这种结构是分子的“三级结构”，它以复杂的方式依赖于每个…
PDB (文件格式)
PDB文件格式（PDB为蛋白质数据库英语名称“Protein Data Bank”缩写），顾名思义是一种由蛋白质数据库最先采纳，用于储存蛋白质三维结构的文件格式。这种文件格式详细记录了 蛋白质中每个原子的坐标信息、蛋白质二级结构信息，以及原子之间的相互作用等信息，同时附有简要的蛋白质的名称与生物学性质信息。 历史 1976年，研究人员认为应该有一种人类可直接阅读的保存蛋白数据文件，将这种文件上传到数据库中将会有利于研究人员相互交流不同蛋…
热稳定性
热稳定性是指物质在相對較高的温度下阻止其化學或物理結構被破壞或出現變化的能力。如果一個物質熱穩定性好，它遇到高溫時就不容易出現分解反应或與其他物質聚合。這些熱穩定性好的物質被視為耐热材料，他們是阻燃剂的原料。热稳定性也是一些蛋白质的特性。热稳定性好的蛋白質在高溫環境下其蛋白质结构也能保持穩定。 参考文献
接触序
蛋白质的接触序(contact order,CO)是蛋白质天然状态三级结构中氨基酸间接触位置的量度。它计算方法为折叠蛋白质中形成天然接触的残基之间的平均序列距离除以蛋白质的总长度。较高的接触序表示较长的折叠时间, 并且低接触阶数已被建议作为潜在下坡折叠或在没有自由能垒的情况下发生的蛋白质折叠的预测指标。CO模型的提出表明蛋白质的折叠速率主要由它的天然态结构 (native state) 所决定。一般来说, α螺旋蛋白要比β蛋白折叠得快，…
Β桶状结构
β桶状结构（英语：Beta barrel）是蛋白质的一种三级构造。它由多条β折叠带通过反平行重叠成桶状，两段则由肽链残基间的氢键结束。常见采取这种构造的蛋白有孔蛋白、跨膜蛋白以及其他需要与非极性分子打交道的蛋白。 在β桶中，β折叠带往往同时带有亲水与疏水性残基。根据外部环境与管道需要，再将内外分别整理成亲水或疏水的管道面。 参考文献 外部链接 [http://www.cryst.bbk.ac.uk/PPS95/course/8_fold…