普通細菌孔道蛋白家族
普通細菌孔道蛋白是一類存在於革蘭氏陰性菌外膜上的蛋白質。這類蛋白充當了對親水性物質的分子過濾器，在外膜上起着「分子篩」的作用。這些蛋白生成的裝滿水的通道可讓親水性物質進入週質空間中。部分孔道蛋白生成的擴散通路可允許大小小於排阻極限的溶質通過，而另一些則在孔道內有特異性的結合位點，只能允許一種溶質通過。孔道蛋白是細菌外膜上的一種主要蛋白質，噬菌體和常常會通過它們與細菌結合。 細菌孔道蛋白常常會結合成。而它們的β鏈則是這些蛋白質的跨膜核心。…
标签：#生物化学
共 77 篇文章
分子探针
分子探针（英语：Molecular probe）是分子生物学或化学中用于研究其他分子或结构的性质的一组原子或分子。如果所用分子探针的某些可测量特性在与相互作用时发生变化（例如吸光度变化），则可以研究探针与分析物之间的相互作用。这使得间接研究难以直接研究的化合物和结构的性质成为可能。 分子探针的选择取决于正在研究的化合物或结构以及感兴趣的性质。放射性DNA或RNA序列用于分子遗传学，通过分子杂交检测序列的存在。 常见探针 8-苯胺-1-萘…
1-羟基苯并三唑
1-羟基苯并三唑（HOBt），白色晶体，是苯并三唑的1H-N被羟基取代的衍生物。常用作多肽合成中的外消旋化抑制剂。经典方法用DCC脱水缩合制肽时，由于DCC活性很高，常使底物的手性中心无法在产物中很好地保持。一般加入羟基苯并三唑等助剂以降低活化酯的活性，从而抑制外消旋化。详见多肽合成一文。 1-羟基苯并三唑通常都是以单水合物结晶（~11.7%水，重）出售的。无水1-羟基苯并三唑有爆炸性，使用时需注意。 参考文献
生物能量学
生物能量学是生物化学和细胞生物学的一个领域，研究领域包括能量在生物体内的转化、细胞呼吸和一些能产生能量的代谢和酶促过程 。也就是说，生物能量学的目标是講述生物体如何获得和转化能量。因此，对代谢途径的研究对生物能量学至关重要。 参考文献
高斯网络模型
高斯网络模型是将生物大分子描述成一种伸缩性的弹簧网络来进行研究，理解，或描述大范围内动力学的力学特性。 高斯网络模型是一种研究生物分子的简化模型。在其中，氨基酸用其alpha碳原子替代，视作一个节点。类似的，在DNA和RNA中，每个核苷酸用一到三个节点来表示。在这个模型中节点之间的相互作用用同一种模式来近似（当距离低于某值时视作一个弹簧）。这种近似使该模型易于计算。 腳註 參考資料 外部文献 * Cui Q, Bahar I, (200…
AP位點
在生物化學和分子遺傳學之中，AP位點(缺嘌呤/缺嘧啶位點)，也被稱作是缺鹼基位點，通常位在由嘌呤或是嘧啶組成的DNA之內(也有極小機率出現在双链RNA之內)，不是自發的話就是由DNA損傷造成。在一般生理條件下，一個細胞每天估計產生約10,000個缺嘌呤位點和500個缺嘧啶位點。 AP位點能夠由自發的去嘌呤作用產生，但也可能充當鹼基切除修復機制中的中間產物。在這過程之中，DNA 糖苷酶識別受損的鹼基，並切下N-糖苷鍵結，使鹼基脫去產生AP…
超敏性
的反应体系对刺激（横轴）产生的反应强度（纵轴）简图]] 超敏性（）在分子生物学中是指某一体系对刺激的敏感性高，能产生强于米氏动力学理论值的反应。具有超敏性的反应体系在刺激强度低时反应强度也低，但刺激强度超过某一阈值后，反应强度会迅速升高。 超敏性反应体系的反应强度可以通过以下式子（希尔方程）计算，确定了希尔係數(n)就能对一个具超敏性的反应体系进行定量： :\ce{Response} = {Stimulus^n \over (\ce{E…
环境化学
拉赫的工業漏油事件附近的海岸上堆滿了裝滿受污染石頭的白色袋子。]] 环境化学是研究化学物质在环境中迁移、转化、降解规律，研究化学物质在环境中的作用的学科。它不应与绿色化学，即探求如何减少潜在的污染源头的学科搞混。它可以定义为研究源头、反应、物质运动、作用效果、以及化学元素在空气、土壤和水利环境的生存和人类活动对其的影响。 环境化学是在各个学科之间的科学，包括大气、水生以及土壤化学，也减轻在分析化学和使环境与其他有关科学的部分发生关系起到…
稀有元素
稀有元素是指自然界中储量稀少（一般地壳丰度为100ppm以下）或分布稀散、很少富集成礦的元素。部分稀有元素常用来制造特种金属材料或特殊元件，如特种钢、合金、永久磁鐵等，在飞机、火箭、汽車、原子能、半導體等工业领域属于关键性材料。代表性的稀有金属有鈹、鎵、銦、錸以及稀土金屬等。 在不同领域中的含义 在分析化學中「痕量元素」指的是「某一元素在樣本中的濃度小於100ppm需測量到原子的規模」或是「這個元素在每公克的樣本中含量少於100微克(µ…
胼胝質
' ' 質（Callose）是一種植物的多糖，由葡萄糖殘基彼此藉由β-1,3-連結相互連接，所以又被稱作是β-葡聚醣。一般認為它是在細胞壁被胼胝質合成酶所製成，並且它能夠被β-1,3-葡聚醣酶所分解。當進行細胞質分裂和花粉形成的時候，生成的胼胝質放置在原生質絲和細胞板之中。它在受傷、被病原感染、鋁以及脫落酸作用下時會被生成出來。在生長季節末期常生成並儲存在篩板之上。對於有性生殖的被子植物，胼胝質也能夠迅速生成，用以幫助成長中的母細胞和四…
细胞识别
细胞识别是指細胞對同種細胞、異種細胞、同源細胞、異源細胞的識別現象。细胞识别的作用部位位於細胞膜，细胞通过其表面的糖鏈參與識別作用。 参考文献
SELEX
SELEX是一種分子生物學試驗，用来找出和配體最親和的核酸序列。隨機核酸序列庫通過生物化學方法產生，序列庫和配體反應，然後通過免疫學方法分離出配體，清洁未和配體結合的核酸序列，然後再將結合了的核酸序列用聚合酵素鏈式反應複製数百萬倍，再選擇多次，和配體最親和既核酸序列就會產生。
28S rRNA
屬下三個種的16S以及28S rRNA的系統發生圖]] 28S rRNA（rRNA意爲核糖體RNA（ribosomal RNA））是組成真核生物核糖體大亞基的核糖體RNA，是所有真核細胞都會含有的化學組分之一。28S rRNA和原核生物的23S rRNA具有同源性。 編碼28S rRNA的基因稱爲28S rDNA。28S rDNA的基因序列常用於構建系統發生圖的分子分析。 參考
生物有机化学
生物有机化学是有机化学和生物化学的交叉领域，是将有机化学研究的理论和方法向生命科学渗透的学科，负责在分子水平上研究生物过程的化学本质，主要分析生物分子（如蛋白质、核酸）的结构、性质、合成，以及酶和酶促有机反应的具体机理。是目前有机化学研究中最为热门的子领域之一。 生物有机化学与生物无机化学一般是相对的，不过在某些方面，如在研究金属酶和辅因子时，两者亦有很大的重叠。 生物有机化学是生命科学的一个分支，是用化学手段处理生物学过程的学科。 與…
囊泡融合
囊泡融合(英文：Vesicle fusion)是囊泡與其他囊泡或細胞膜一部分的融合。在後一種情況下，這是分泌性囊泡分泌的最終階段，在那裡，其內容物通過胞吐作用從細胞中排出。囊泡還可以與其他靶細胞區室融合，例如溶體。 當分泌性囊泡暫時停靠並融合在稱為多孔體的細胞質膜的杯狀結構的底部時，細胞就會發生胞吐作用，這是細胞中的普遍分泌機制。在細胞內鈣離子（Ca2 +）濃度增加的情況下，囊泡融合可能取決於SNARE蛋白。
活性多肽
活性多肽，又称活性肽，指在生物体内有着特殊功能的肽。小到只含有两个氨基酸，大到由上百个氨基酸组成。 活性肽广泛分布于生物界。起着许多各种各样的作用。常见作为细胞内部或细胞间传输化学信号的信使，调控细胞间或器官间的行动。包括神经、免疫、衰老等许多最新的研究方向都与小小的活性肽有关。 常见而重要的活性多肽包括：穀胱甘肽GSH、催产素、脑肽等等。
Percoll层析液
感染的红血球因不连续的比重在Percoll层析液中分层。右图：正常红血球的Percoll层析液]] Percoll层析液是生物化学中一种非常高效的层析方法，该方法由Pertoft研究并制定。结合离心技术，可用于离析细胞、细胞器或病毒等。Percoll层析液的主要成分为经过聚乙烯吡咯烷酮（PVP）处理的直径15-30纳米的二氧化硅胶体颗粒悬浊液（在水中的重量百分比浓度为23% w/w）。 因为Percoll层析液的粘度低于其他替代品，所以…