梭桿菌門
梭桿菌門（学名：Fusobacteriota）是一個小類群的革蘭氏陰性細菌。其中梭桿菌屬（Fusobacterium）常見于消化道，是口腔菌群之一，也可導致一些疾病。 今年10月份，两个研究小组发布了几乎相同的研究报告，指出一种叫做“梭杆菌”的稀有生存在人体肠道的细菌在结肠癌细胞中处于异常活跃状态，表明它与结肠癌高发病率具有一定的联系。对比健康的结肠组织和癌细胞，研究人员发现癌细胞中的梭杆菌数量是健康结肠组织的数百倍。 这是首次证实梭杆…
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產金菌門
產金菌門（学名：Chrysiogenota）是一支獨特的細菌，目前只發現了一個種，即砷酸產金菌（Chrysiogenes arsenatis）。它具有獨特的生活方式和生化過程。它經營化能無機自養，利用對绝大多數生物劇毒的砷作爲其營養。砷酸產金菌利用亞砷酸鹽作爲電子供體，將其氧化成砷酸鹽。 砷酸產金菌可以在富含亞砷酸鹽的地方被發現，比如被砷污染的湖底或者含砷的金礦中。 下属分类 本门包括以下纲： 參見 *細菌分類表
疣微菌門
疣微菌門（学名：Verrucomicrobiota）是一門被劃出不久的細菌，包括少數幾個被識別的種類，主要被發現於水生和土壤環境，或者人類糞便中。還有很多未被成功培養的種類是和真核宿主共生的，包括一些原生生物的外共生菌和線蟲動物配子中的内共生菌。 疣微菌門生物中的疣微菌屬（Verrucomicrobium）和突柄桿菌屬（Prosthecobacter）具有胞質突出形成的兩個到多個突起，因此得名。它們通過二分裂繁殖。它們的最近類群可能是衣…
酸桿菌門
酸桿菌門（学名：Acidobacteriota，英语：Acidobacteria）是新近被分出的一門細菌。它們是嗜酸菌。現在對它們研究還很少，但它們在生態系統中具有重要作用，比如土壤中。 下属 Blastocatellia 全噬菌綱 Holophagae 石鱉桿菌目(Acanthopleuribacterales) 石鱉桿菌科(Acanthopleuribacteraceae) 石鱉桿菌屬(Acanthopleuribacter) 全噬…
紅螺菌目
紅螺菌目（学名：）是變形菌門α-變形菌綱下的一目。进行不产氧的光合作用。本目很多细菌属于紫細菌。 下级分类 本目包括以下科： 参考文献
醋杆菌属
醋杆菌属（學名：）是红螺菌目醋酸菌科的一属好氧或兼性厌氧非发酵革兰氏阴性杆菌。其特点是能够在有空气的条件下将乙醇转化为乙酸（醋酸）。醋酸杆菌属包含有多个种。很多其它的细菌也能在不同的条件下产生乙酸，但醋酸杆菌属中的细菌只在这一个条件下。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献 *
副球菌属
副球菌属（学名：）為红杆菌目副球菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。呈球状或短杆状。原属红杆菌科，2022年建立副球菌科后，现归属副球菌科。 大多分离来源自环境，出现在土壤、天然和人工的盐水中，也有一些来自动物和植物。此属的模式种为脱氮副球菌(Paracoccus denitrificans)。 下属物种 本属包括以下物种： 參考文獻 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standi…
盐厌氧杆菌属
盐厌氧杆菌属（学名：）為盐厌氧菌目盐拟杆菌科的一属厌氧革兰氏阴性菌。分离于盐场有机沉积物。此属的模式种为食几丁质嗜盐厌氧杆状菌(Haloanaerobacter chitinivorans)。 下属物种 本属包括以下物种： 參考文獻 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
热酸菌属
热酸菌属（学名：）為热酸菌目热酸菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。细胞呈细长杆状和细长丝状。在美国黄石国家公园的酸性环境(pH4~5.5，温度45~65℃)汀温泉分离到的。此属的模式种为解纤维热酸菌(Acidothermus cellulyticus)。 下属物种 解纤维热酸菌 Acidothermus cellulolyticus Mohagheghi et al.* 1986 參考文獻
藍菌門
藍菌（学名：，）又称藍綠菌、蓝细菌，舊稱藍綠藻（）或蓝藻（），是细菌域藍菌門（学名：）屬下的格兰氏阴性菌，是一类能透過产氧光合作用将光能转化为化学能并生产有机物（如碳水化合物）的自营生物，但其中一些也退化失去了光合能力只依赖異營獲取生存所需的能量。其学名*'，源于其细胞内的感光色素在吸收日光中的红色和部分蓝色光谱后反射出蓝绿混合的青色；“蓝藻”的旧称则是因为其菌落的生物薄膜漂在水面时酷似浮游绿藻——然而作为原核生物，蓝绿菌沒有细胞核和有…
鼠疫耶爾森菌
鼠疫耶爾森菌（学名：）又稱鼠疫耶氏桿菌，俗稱鼠疫桿菌或鼠瘟疫杆菌，是一種桿菌，屬於腸桿菌科耶爾森菌屬，同時也是腺鼠疫、肺鼠疫和敗血性鼠疫的病原體。所有的類型都在人類歷史上造成嚴重的傷亡（例如查士丁尼大瘟疫、黑死病、第三次鼠疫大流行）。 耶爾森菌屬是一種革蘭氏陰性菌，為雙球株桿菌，和其他腸細菌相似，它有新陳代謝作用。鼠疫耶爾森菌能產生反吞噬細胞的黏液。該生命體在隔離培養時是可動的，但在哺乳動物寄主裡時會變成不可動的。 歷史 第三次鼠疫大流…
麦氏交替单胞菌
{{Speciesbox | taxon = Alteromonas macleodii | genus = Alteromonas | authority = Baumann et al. 1972 (Approved Lists 1980) | synonyms = | synonyms_ref = | type_strain = [https://www.atcc.org/products/27126| ATCC 27126]它是…
酸养互营菌
酸养互营菌，革兰氏阴性杆菌。它不能移动，不会产孢，只能在严格厌氧条件下生长，因而是专性厌氧菌。在与耗氢微生物互养时能降解脂肪酸和苯甲酸。其基因组于2007年发表。 参考 外部链接 [https://web.archive.org/web/20131104115830/http://www.bacterio.net/s/syntrophus.html LPSN]
近海单胞菌属
{{Autotaxobox | taxon = Thalassomonas | authority = Macián et al. 2001 | type species = 绿色近海单胞菌 Thalassomonas viridans | type species authority = Macián et al. 2001此属的物种是革兰氏阴性、过氧化氢酶阳性、非运动性或运动性、嗜盐且嗜温的杆状细菌。此属的物种用单极鞭毛运动。此属的…
运动单胞菌属
{{Autotaxobox | taxon = Motilimonas | authority = Ling et al. 2017 | type species = 象牙白运动单胞菌 Motilimonas eburnea | type species authority = Ling et al. 2017此属的物种是革兰氏阴性、兼性厌氧、运动性、不形成孢子的杆状细菌。此属的模式种是象牙白运动单胞菌（Motilimonas ebur…
费氏弧菌
费氏弧菌（学名：Aliivibrio fischeri）是別弧菌屬的一种非自养、有運動性的细菌，广泛分布于世界各大洋。它可以发光，和许多海洋生物（如夏威夷短尾乌贼）存在共生关系。其名来自德国微生物学家伯恩哈德·费舍尔的姓。它的基因组测序工作在2004年完成。 它原属弧菌属，但rRNA研究指出它应该属于別弧菌屬，因此在2007年划归后者，但很多科学文献仍采用旧名Vibrio fischeri。 基因组 它包含两条染色体，基因组测序工作在2…
黄杆菌属
黄杆菌属（学名：）為黄杆菌目黄杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。直杆状，端圆。广泛分布在土壤和水中，在生肉、乳类和其他食物以及医院环境和人类的临床标本中都有检出。此属的模式种为水生黄杆菌(Flavobacterium aquatile)。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
脆弱拟杆菌
脆弱拟杆菌是一种專性厭氧菌、革兰氏阴性菌。它是人類微生物群系的一部分，該細菌主要位於大肠，通常表现为偏利共生特性。不過如果在手术、疾病或创伤后进入血液或周围组织，则可能引起感染 。 參考文獻
綠菌門
綠菌門是一類進行不產氧光合作用的細菌。這類細菌沒有已知的近親，最近的類群爲擬桿菌門。 綠菌門通常不活動（一個種具有鞭毛），形狀爲球狀、桿狀或者螺旋狀。其生存要求無氧環境和光。它們的光合作用利用一種稱作綠體的微囊中附在膜上的菌綠素c、d和e吸收光能。 綠硫細菌还在印度尼西亞的馬塔納湖被發現，在約110-120米的深度。物種可能包括綠硫桿菌。 參見 細菌分類表 着色菌目 綠非硫細菌 紫細菌 參考資料
稻草假单胞菌
稻草假单胞菌是一类杆状革兰氏阴性菌，它所包含的菌株以前属于赭色假单胞菌（P. ochracea）。根据16S rRNA分析，目前稻草假单胞菌属于绿脓杆菌。 参考文献 外部链接 [http://bacdive.dsmz.de/index.php?search=13128&submit=Search Type strain of Pseudomonas straminea at BacDive* - the Bacterial Divers…