MLL (基因)
组蛋白-赖氨酸N-甲基转移酶HRX()是人体中由MLL(ALL1)基因编码的一种酶。MLL代表髓样/淋巴样,或混合世系白血病。 MLL是一种组蛋白甲基转移酶,被认为是影响基因转录的全局正向调控物。该蛋白属于组蛋白修饰酶类家族,包含了转活化结构域9aaTAD,且参与了对转录记忆的表观遗传学维持。 MLL基因若发生重排(即染色体结构改变造成遗传物质的重新排列)则会导致严重的急性白血病,包括淋巴母细胞性及髓性。该基因亦可能参与了精神分裂症中G…
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组蛋白-赖氨酸N-甲基转移酶HRX()是人体中由MLL(ALL1)基因编码的一种酶。MLL代表髓样/淋巴样,或混合世系白血病。 MLL是一种组蛋白甲基转移酶,被认为是影响基因转录的全局正向调控物。该蛋白属于组蛋白修饰酶类家族,包含了转活化结构域9aaTAD,且参与了对转录记忆的表观遗传学维持。 MLL基因若发生重排(即染色体结构改变造成遗传物质的重新排列)则会导致严重的急性白血病,包括淋巴母细胞性及髓性。该基因亦可能参与了精神分裂症中G…
Kruppel样因子4(,缩写KLF4)或肠富集Krüppel样因子(,缩写GKLF)化学式为:C2399H3707O719N703S24是锌指转录因子的一个成员,后者属于一个较大的样转录因子家族。KLF4参与細胞增殖、细胞分化、细胞凋亡和体细胞重编程的调节。有证据表明KLF4在包括大腸癌在内的一些癌症中是肿瘤抑制基因。与类似,它在C端有三个C2H2型锌指。在胚胎幹細胞(ESCs)和間充質幹細胞(MSCs)中KLF4是显示多能化的很好标…
HMG盒转录因子1(,缩写为HBP1)化学式为:C2506H3847O798N705S32,是一种人类蛋白质。 相互作用 HBP1与SIN3A和视网膜母细胞瘤蛋白存在相互作用。 参考文献 延伸阅读 外部链接 *
内皮PAS结构域包含蛋白-1(,缩写EPAS1,也被称为缺氧诱导因子-2α亚基,,缩写HIF-2α)是一种由人类基因 EPAS1 所编码的蛋白质。 功能 EPAS1所表达的蛋白是一个转录因子的组成部分,该转录因子介导一些受氧气调控基因的表达,特别是低氧(缺氧)环境下。该蛋白包含一个碱性螺旋-环-螺旋蛋白二聚化结构域,此结构域也常见于其它氧应激相关信号通路蛋白。EPAS1涉及的发育,并在脐带的血管壁内皮细胞中表达。EPAS1维持儿茶酚胺类…
早期生长反应蛋白4(,EGR-4),也被称为AT133,是一个由人类基因EGR4编码的蛋白质。 EGR-4是一种锌指结构转录因子早期生长反应蛋白家族(EGF)的一员 参考文献 延伸阅读 *
早期生长反应蛋白3(,EGR-3)是一个由人类基因EGR3编码的蛋白质。 该基因编码的蛋白为EGR家族的Cys2His2型锌指结构转录因子。这是一个是由有丝分裂刺激诱导的早期生长反应基因。由该基因编码的蛋白参与了控制生物节律的转录调控。它也可能在肌肉发育中起作用。 参考文献 延伸阅读 外部链接 *
早期生长反应蛋白2(,EGR-2)是一个由人类基因EGR2编码的蛋白质。 EGR2是一个转录因子,包含三个串联的Cys2His2型锌指结构,该基因的多态性与I型进行性神经性腓骨肌萎缩症有关。 参考文献 延伸阅读 外部链接 [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=gene&part=cmt1 GeneReviews/NCBI/NIH/UW entry on Charcot-M…
转录因子E2F1是由人类E2F1基因编码出的蛋白质,化学式为:C2053H3297O660N573S11。 该基因编码出的蛋白质是E2F转录因子家族中的成员。E2F家族在控制细胞周期及抑癌基因功能上起到重要作用,也是小DNA致癌病毒转化蛋白的靶点。E2F家族中的多个成员蛋白包含许多进化保守的结构域。这些结构域包括:DNA结合域、与受分化调控的转录因子蛋白(DP)之间相互作用的二聚化结构域、富含酸性氨基酸的转活化结构域以及位于转活化结构域…
DNA结合蛋白()是指能透过(DBD)与单链或双链DNA结合的一类蛋白质。一般来说,能与特异DNA序列结合的DNA结合蛋白主要经由与B-DNA(生物体内DNA一般都是B-DNA形式)的大沟结合来识别DNA序列。因为B-DNA的大沟区域能容许更多蛋白质上的官能团靠近并与之进行相互作用。 蛋白质与DNA的相互作用 蛋白质与DNA的结合受到pH值、温度、离子强度、电场,以及等多种条件的影响,具体分为特异性与非特异性两种。非特异性的结合指蛋白质…
DNA结合位点()是存在于DNA上的与其它分子相绑定的各类结合位点。 DNA结合位点与其它结合位点的区别在于: 它们是DNA序列(如一个基因组)中的一部分; 它们被DNA结合蛋白所绑定。 DNA结合位点常常与一类被称为转录因子的特殊蛋白相联系起来,并因此联系到转录调控。针对特定的一个转录因子的DNA结合位点总和常被命名为该转录因子的顺反组。DNA结合位点也包括了其它蛋白的靶点,如限制性核酸内切酶、位点特异性重组酶(见位点专一重组)及甲基…
转录阻抑物CTCF,也被称为11锌指蛋白或CCCTC结合因子,是由人类CTCF基因编码的转录因子。CTCF参与多个细胞进程,包括转录调控、绝缘子活性调控、V(D)J重组、染色质结构调控等。 发现 CTCF最早被认为在鸡体内抑制c-myc基因表达。CTCF蛋白和以CCCTC为核心序列的三个规则间隔重复蛋白相结合,故得名CCCTC结合因子。 功能 CTCF的主要功能是调控染色质的3D结构。此外,CTCF还能充当常染色质和异染色质的边界。 D…
C-Myc或Myc是编码转录因子的调节基因。这一基因编码的蛋白在细胞核内被磷酸化,有多种功能:在细胞周期进程、细胞凋亡和细胞轉化中发挥作用。 相互作用 Myc可与以下蛋白质发生交互作用: ACTL6A Bcl-2 Cyclin T1 CHD8 DNMT3A EP400 HTATIP let-7 MAPK1 MAPK8 MAX MLH1 MYCBP NMI NFYB NFYC P73 PCAF PFDN5 RuvB-like 1 SAP1…
CCAAT/增强子结合蛋白δ,简称C/EBP-δ或CEBPD,化学式为:C1239H1960O378N374S6 ,是一种在人类中由CEBPD基因编码的蛋白质。 功能 由这种无内含子基因编码的蛋白质是一种bZIP转录因子,它可以作为同源二聚体与某些DNA调节区结合。它还可以与相关蛋白C/EBP-α形成异二聚体。编码的蛋白质在调节参与免疫和炎症反应的基因中很重要,并且可能参与调节与巨噬细胞活化和/或分化相关的基因。 CEBPD参与细胞凋亡…
CCAAT/增强子结合蛋白α,简称C/EBP-α或CEBPA,化学式为:C1656H2581O494N491S9,是一种由人类CEBPA基因编码的蛋白质。CEBPA是参与某些血细胞分化的转录因子。有关基因增强子中的CCAAT结构基序和CCAAT/增强子结合蛋白的详细信息,请参见特定页面。 功能 这种无内含子基因编码的蛋白质是一种bZIP转录因子,它可以作为同源二聚体与某些启动子和基因增强子结合。它还可以与相关蛋白C/EBP-β和C/EB…
同源框蛋白CDX-1(Homeobox protein CDX-1)化学式为:C1273H1946O364N350S5,是一种由基因CDX1编码的蛋白质。 该基因是尾型同源框转录因子基因家族的一员。其编码的DNA结合蛋白用以调控肠道特异性基因的表达和肠上皮细胞的分化。已知它能诱导肠道碱性磷酸酶的表达,并抑制β-连环素和T细胞因子的转录活性。 参考文献 延伸阅读 外部链接 *
与DNA结合。PDB条目]] CCAAT增强子结合蛋白,简称C/EBP,是一个由六个成员组成的转录因子家族,从C/EBPα到C/EBPζ命名。它们通过与其启动子的相互作用促进某些基因的表达。一旦与DNA结合,C/EBP就可以招募所谓的共激活因子(例如CBP),进而可以打开染色质结构或招募基础转录因子。 功能 C/EBP蛋白与CCAAT(胞嘧啶-胞嘧啶-腺苷-腺苷-胸苷)盒基序相互作用,该基序存在于几个基因启动子中。它们的特点是在C端具有…
B3 DNA结合结构域()是一些转录因子中的高度保守的DNA结合结构域(DNA-binding domain,DBD)在超过40个物种()中发现,与其它结构域一起()执行转录因子的功能。B3结构域的一级结构为100-120个氨基酸残基,二级结构为七个β折叠和两个α螺旋,三级结构为假棒状(pseudobarrel,),从DNA结构的大沟处结合DNA分子: ARF(Auxin Response Factors) ABI3(ABscisic …
BHLHE41基因(亦称DEC2、hDEC2、SHARP1,曾用名为BHLHB3)是一个编码一种碱性螺旋‑环‑螺旋转录因子抑制蛋白的基因,在人类和小鼠的多种组织中均有表达。该基因在昼夜节律的分子机制中发挥了关键作用,其参与调节睡眠时长;同时也涉及免疫功能,尤其与体液免疫相关的2型辅助性T细胞谱系成长过程密切相关。 蛋白结构 BHLHE41属于碱性螺旋‑环‑螺旋蛋白家族中的DEC亚族。该基因定位于人类12号染色体(反向链,26,120,0…
视黄酸受体α(,RAR-α),也称为NR1B1(核受体第一亚族B组成员1,nuclear receptor subfamily 1, group B, member 1)化学式为:C2224H3555O679N613S32,是一个核受体,在人类基因组中由 RARA 基因编码。 相互作用 视黄酸受体α可以与下列蛋白質发生进行交互作用: BAG1, CLOCK, CCND3, NCOA6, NCOR1, NCOR2, NPAS2, NR0B…
芳香烃受体(,或称为芳烃受体或芳基烃受体,简称为AhR或AHR)是一种在人类中由 AHR 基因编码的蛋白质。芳香烃受体是调节基因表达的转录因子。 它最初被认为主要作为异生化学物质的传感器发挥作用,同时也作为代谢这些化学物质的细胞色素P450等酶的调节剂。 这些异生化学物质中最引人注目的是芳香族(芳基)烃,受体的名字也来源于此。 最近,已经发现AhR被许多内源性吲哚衍生物如犬尿氨酸激活(或失活)。 除了调节代谢酶外,AhR 还具有调节免疫…