WIV16病毒
WIV16病毒（SL-CoV-WIV6）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，與造成SARS事件的SARS-CoV全基因組序列相似度為96%，同使用ACE2為受體感染細胞，是迄今發現和SARS-CoV序列相似度最高的蝙蝠病毒，於2016年發表。 發現 WIV16病毒於2013年在雲南昆明的中華菊頭蝠糞便樣本中發現並成功分離，其基因組長度為30290nt，與SARS-CoV的序列相似度為為96%，略高於W…
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Rs672病毒
Rs672病毒（Rs672/2006）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，於2006年在中國貴州的中華菊頭蝠糞便樣本中被發現，其基因組已被完整定序，長29059nt，與造成SARS事件的SARS-CoV基因組序列相似度為93.4%，在SARSr-CoV中屬於SARS-CoV相關病毒，於2010年發表。 參考文獻
BtKY72病毒
BtKY72病毒（BtKY72/Rhinolophus sp./Kenya/2007）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，在肯亞菊頭蝠屬蝙蝠的糞便樣本中發現，其基因組已被完整定序，於2019年發表。 病毒學 BtKY72病毒的基因組長29259nt，基因順序為複製酶（ORF1a/b）－刺突蛋白（S）－ORF3a－外膜蛋白（E）－膜蛋白（M）－ORF6－ORF7a－ORF7b－衣殼蛋白（N），相較於SA…
BM48-31病毒
BM48-31病毒（BtCoV/BM48-31/Rhi bla/Bulgaria/2008；BM48–31/BGR/2008）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，在保加利亞的糞便樣本中發現，其基因組已被完整定序，於2010年發表，與其他SARSr-CoV相較之下，此病毒株缺乏ORF8（2019年發表的肯亞BtKY72病毒亦不具有ORF8），另外此病毒株的ORF3b和其他蝙蝠SARSr-CoV的一樣比S…
16BO133病毒
16BO133病毒是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，在韓國的馬鐵菊頭蝠中發現，於2019年發表，其基因組被完整定序，是首個被完整定序的韓國SARSr-CoV病毒株，在SARSr-CoV中屬於SARS-CoV相關病毒，與其基因組序列相似度為82.8%。 發現 16BO133病毒於2016年在韓國馬鐵菊頭蝠的口腔樣本中被發現，此病毒株的基因組長29075nt。在SARSr-CoV中，16BO133和20…
蝙蝠冠狀病毒HKU3
蝙蝠冠狀病毒HKU3（BtCoV HKU3；Bat-SARS-CoV HKU3）屬嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV），為SARS-CoV相關病毒，在中華菊頭蝠樣本中發現，是第一個在蝙蝠中發現的SARS相關病毒，是首次在蝙蝠樣本中發現SARS相關病毒，此前僅知果子貍、貉與鼬獾帶有SARS病毒。 2010年，又有10個與此三個病毒株相近的新病毒株被發表，即為HKU3-4至HKU3-13，基因組長度介於29677nt至2…
果子貍SARS冠狀病毒
果子貍SARS冠狀病毒（Civet SARS-CoV）是感染果子貍的嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV），與感染人類、造成2002年至2003年SARS事件的严重急性呼吸道综合征冠状病毒（SARS-CoV）高度相似，基因組序列相似度約99.8%。由於疫情初期染病的幾名病人都曾在市場中與果子貍接觸，果子貍可能是人類SARS冠狀病毒的直接來源；2003年底中國廣州又有四人染疫，經序列分析發現與果子貍的病毒相似度達99.9…
WIV1病毒
WIV1病毒（SL-CoV-WIV1）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，與造成SARS事件的SARS-CoV全基因組序列相似度為95%，與在同一批樣本中發現且同時發表的Rs3367序列幾乎完全相同。此病毒株在中國雲南的中華菊頭蝠中發現，於2013年發表，是第一個被成功分離的蝙蝠SARSr-CoV，也是第一個被證實與SARS-CoV一樣可使用血管紧张素转化酶2（ACE2）為受體感染細胞的蝙蝠SARSr…
SHC014病毒
SHC014病毒（RsSHC014）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，在中國雲南的中華菊頭蝠中發現，於2013年發表。此病毒株與造成2003年SARS事件的嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒（SARS-CoV）關係接近，全基因組核酸序列的相似度為95%。2015年，有研究人員製造表現SHC014病毒刺突蛋白的SARS重組病毒，意外發現此重組病毒可感染人類細胞與實驗小鼠，顯示自然界中的許多蝙蝠SARSr-C…
Rm1病毒
蝙蝠冠狀病毒Rm1（Bat SARS CoV Rm1/2004）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，為SARS-CoV相關病毒，在中國湖北的大耳菊頭蝠樣本中發現，於2005年發表。 發現 2004年3月至11月，研究人員在中國廣東、天津、廣西與湖北四省市採集蝙蝠樣本，在湖北宜昌皮氏菊頭蝠的糞便樣本中發現SARS相關病毒，即Rm1病毒，於2005年和Rf1病毒與Rp3病毒一起發表。 基因組 Rm1病毒的…
穿山甲冠狀病毒
穿山甲冠狀病毒（Pangolin CoV；Pan SL-CoV）為感染穿山甲的冠狀病毒，屬嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV），包含許多不同病毒株，最早於2019年在廣州被查獲走私的馬來穿山甲身上發現。2019冠狀病毒病疫情爆發後，廣東與廣西截獲的走私穿山甲身上再次發現了冠狀病毒，這些病毒株基因組序列皆與造成疫情的SARS-CoV-2相似，且在與宿主受體結合的受體結合結構域（RBD）相似度特別高，是已知病毒中與其RB…
RaTG13病毒
RaTG13病毒（BatCoV RaTG13），是乙型冠狀病毒屬一種感染蝙蝠的病毒，屬於嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV），於2013年在中國雲南墨江通關鎮礦坑中中菊頭蝠（学名：Rhinolophus affinis）的糞便樣本中被發現，最早發表於2016年，原稱RaBtCoV/4991病毒。 發現經過 2012年4月，四名雲南墨江哈尼族自治縣通關鎮的礦工在清理銅礦坑內的蝙蝠糞便後，出現嚴重的呼吸道症狀，他們被送至…
Rp3病毒
蝙蝠冠狀病毒Rp3（Bat SARS-CoV/Rp3/2004）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，為SARS-CoV相關病毒，在中國廣西的皮氏菊頭蝠樣本中發現，於2005年發表。 發現 2004年3月至11月，研究人員在中國廣東、天津、廣西與湖北四省市採集蝙蝠樣本，在廣西南寧皮氏菊頭蝠的糞便樣本中發現SARS相關病毒，即Rp3病毒，於2005年和Rf1病毒與Rm1病毒一起發表，序列與SARS-CoV…
LYRa11病毒
LYRa11病毒是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，於2011年在中國雲南保山中菊頭蝠的樣本中被發現。此病毒株的基因組長29805nt，與造成SARS事件的SARS-CoV全基因組序列相似度為91%，於2014年發表 演化樹 參考文獻
Rf1病毒
蝙蝠冠狀病毒Rf1（Bat SARS CoV Rf1/2004）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，為SARS-CoV相關病毒，在中國湖北的馬鐵菊頭蝠樣本中發現，於2005年發表。 發現 2004年3月至11月，研究人員在中國廣東、天津、廣西與湖北四省市採集蝙蝠樣本，在湖北宜昌馬鐵菊頭蝠的糞便樣本中發現SARS相關病毒，即Rf1病毒，於2005年和Rp3病毒與Rm1病毒一起被發表，序列與SARS-Co…
ZC45病毒與ZXC21病毒
ZC45病毒（SL-CoV ZC45）與ZXC21病毒（SL-CoV ZXC21），被部分媒體稱為舟山蝙蝠病毒，皆為嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的病毒株，在中國浙江舟山的小菊頭蝠樣本中發現，於2018年發表。這兩個病毒株屬於SARS-CoV-2的演化支，全基因組核酸序列與SARS-CoV-2的相似度約為88%，與SARS-CoV的相似度則約為81%。 發現 2015年至2017年間，研究人員在浙江舟山採集33…
RmYN02病毒
RmYN02病毒（BetaCoV/Rm/Yunnan/YN02/2019）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，於2019年在中國雲南馬來亞菊頭蝠的糞便樣本中發現，並於次年（2020年）發表。此病毒與造成2019冠狀病毒病疫情的嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型（SARS-CoV-2）親緣關係接近，兩者全基因组的核酸序列相似度為93.3%，是已知與SARS-CoV-2相似度次高的病毒，僅次於RaTG13病…
Rc-o319病毒
Rc-o319病毒是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，在日本的角菊頭蝠中發現，於2020年11月發表，屬於SARS-CoV-2的演化支，全基因組核酸序列與SARS-CoV-2的相似度為81%，是該演化支中與SARS-CoV-2關係最遠的病毒株。此病毒是與SARS-CoV-2相關的完整病毒株序列中，首個在中國以外發現者。 發現 2013年，研究人員在日本岩手縣的一洞穴中捕獲四隻角菊頭蝠，初步分析其糞便樣…
YNLF 31C病毒與YNLF 34C病毒
YNLF_31C病毒（bat SL-CoV YNLF-31C；SARSr-Rf-BatCoV YNLF_31C）與YNLF_34C病毒（bat SL-CoV YNLF-34C；SARSr-Rf-BatCoV YNLF_34C）皆為嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的病毒株，在中國雲南的馬鐵菊頭蝠樣本中發現，於2015年發表。這兩個病毒株的基因組序列與造成SARS事件的SARS-CoV相似度皆為93%，略低於WIV1…