RmYN02病毒（BetaCoV/Rm/Yunnan/YN02/2019）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，於2019年在中國雲南馬來亞菊頭蝠的糞便樣本中發現，並於次年（2020年）發表。此病毒與造成2019冠狀病毒病疫情的嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型（SARS-CoV-2）親緣關係接近，兩者全基因组的核酸序列相似度為93.3%，是已知與SARS-CoV-2相似度次高的病毒，僅次於RaTG13病毒的96.2%。
研究歷史
2019年5月至10月，研究人員在中國雲南省勐臘縣採集了302件蝙蝠皮膜與糞便標本，RmYN02與RaTG13皆只有一個位點和SARS-CoV-2的相同，2019年發現的穿山甲冠狀病毒（pangolin/GD/2019）和SARS-CoV-2全基因組序列的相似度雖較低，但兩者RBD的胺基酸序列相似度高達97.4%，且6個關鍵位點的胺基酸均與SARS-CoV-2相同。
以病毒全基因組序列繪製的系統發生樹顯示RmYN02與SARS-CoV-2的關係最接近，共同組成一個演化支；以複製酶序列繪製的系統發生樹中RmYN02和RaTG13為一演化支；以S基因與RBD序列繪製的系統發生樹中RmYN02與SARS-CoV-2的關係則較遠。這些病毒中各區域序列的相似度不一致，顯示它們可能曾發生基因重組。
演化樹
註腳
參考文獻
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