BED (文件格式)
BED(,字面意思是“(基因组)浏览器可延展数据”)是一种基因组学中用于表示、标记基因组区域位置信息中的文件格式,于人类基因组计划中首次出现。BED文件是目前基因组学事实上的标准格式之一。 格式 引入BED格式的人类基因组计划并未详细规范BED文件格式,因此一般较通用中的描述文件。2021年,(GA4GH)发布了首份BED文件格式的规范文件。 BED文件最少需要有3个分别表示区域染色体序号、起始位置,以及终止位置的列,根据不同需求可增加…
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BED(,字面意思是“(基因组)浏览器可延展数据”)是一种基因组学中用于表示、标记基因组区域位置信息中的文件格式,于人类基因组计划中首次出现。BED文件是目前基因组学事实上的标准格式之一。 格式 引入BED格式的人类基因组计划并未详细规范BED文件格式,因此一般较通用中的描述文件。2021年,(GA4GH)发布了首份BED文件格式的规范文件。 BED文件最少需要有3个分别表示区域染色体序号、起始位置,以及终止位置的列,根据不同需求可增加…
,简称文件,是存储在某种长期储存设备或臨時儲存裝置中的一段数据流,並且歸屬於計算機文件系統管理之下。所谓“长期储存设备”一般指磁盘、光盘、磁带等。而“短期存儲裝置”一般指電腦記憶體。需要注意的是,儲存於長期存儲裝置的文件不一定是長期儲存的,有些也可能是程序或系統運行中產生的臨時數據,並於程序或系統退出後刪除。 历史 ]] 計算機“檔案”一词最早在1952年用于计算机数据方面,指的是在打孔卡所储存的信息。 计算机文件的定义 具有某种特定格…
檔案結尾(,縮寫為),是作業系統无法从数据源读取更多数据的情形。資料源通常为檔案或串流。 在C標準函式庫中,像getchar这样的数据读取函数返回一个与符号(巨集)EOF相等的值来指明文件结束的情况发生,EOF的真实值与不同的平台有关(但通常是-1,比如在glibc中),并且不等于任何有效的字符代码。块读取函数返回读取的字节数,如果它小于要求读取的字节数,就会出现一个文件结束符。 EOF字符 终端的输入通常是不会结束的,除非设备被断开。…
定义。]] 稀疏文件()是一种计算机文件,它能尝试在文件内容大多为空时更有效率地使用文件系统的空间。它的原理是以简短的信息(元数据)表示空数据块,而不是在在磁盘上占用实际空间来存储空数据块。只有真实(非空)的数据块会按原样写入磁盘。 在读取稀疏文件时,文件系统会按元数据在运行时将这些透明转换为“真实”的数据块,即填充为零。应用程序不会察觉这个转换。 大多数现代的文件系统支持稀疏文件,包括大多数Unix变种和NTFS。苹果的HFS+不提供…
文件大小能衡量一个计算机文件的大小。通常情况下以带前缀的字节数表示。文件实际所占磁盘空间取决于文件系统。文件系统的最大文件大小取决于保留存储尺寸信息的位数量,及文件系统的总大小。例如,在FAT32文件系统中,单个文件的大小不能超过4 GiB。 一些常见的文件大小单位是: 1 byte = 8 bits 1 KB = 1,024 bytes 1 MB = 1024 KB 1 GB = 1024 MB 1 TB = 1024 GB 换算表 …
塗銷空間(),在硬碟上的一塊記憶空間,只提供暫時的資料儲存,不能被用來儲存可以被永久備份的檔案。系統可以設定周期性的清空這個區域的所有資料,讓這塊磁碟空間在將來可以繼續使用。這個區域的管理,通常是動態式的,只有在需要使時用時才進行。 塗銷空間通常使用於圖形設計程式,像是Adobe Photoshop。當程式需要更多記憶體空間,而系統的RAM提供的數量不足時,也可以使用這塊空間來暫時儲存資料。
的自述文件]] ,是隨著軟件發佈的一種說明文件,裡面通常包含有軟件的描述或使用的注意事項。這種檔案通常是純文字文件,被命名為README、Read Me、READ.ME、README.txt等等,但也有RTF、DOC或Markdown格式的讀我檔案。檔名通常是以大写英文字母組成,這是因為大写字母比小寫字母有著較小的ASCII碼,因此在一些以ASCII順序來排序檔案名稱的作業系統裡,它會被列在檔案列表的第一個。即使這些人沒有關於讀我檔案的…
归档文件,又作存檔文件,是由一个或多个计算机文件以及元数据组成的文件,用于将多个数据文件收集到一个文件中,以便于传输和存储,或者压缩以减少存储空间。也称打包文件,归档并压缩时常称为压缩文件。通常会存储目录结构,错误检测与纠正信息,注释,有时还使用加密。 应用 归档文件将文件系统数据和元数据存储在特定文件的内容内,因此即便不支持文件系统,也可以存储在系统上,或通过通道发送文件内容。例如:通过电子邮件的发送目录结构。 除存档目的外,归档文件…
文件名是一註明電腦上每一檔案的特別字串。在不同的作業系統中,對檔案名稱在長度及可允許使用的字元上可能作出限制。檔案中的「通用资源标志符 - URI」最少是由四個部份組成的: 電腦ID (IP位址,網名或LAN電腦名稱。例如: wikipedia.org、207.142.131.206或\\MYCOMPUTER ) 裝置(磁碟、根掛載點、磁碟區。例如: C:,/) 路徑 (目錄樹的位置:在第一個和最後一個路徑分隔線之間的任何字元) 檔案名…
更改日志(Changelog)或变更日志是程序員在開發軟件時對项目更改所做的记录。该项目通常是一个網站、软件或數據庫。变更日志內容通常包括错误修复、增加的新功能等軟件变更记录。 参考文献
GTF(,字面意思是基因转移格式)是一种基因组学中用于标记基因在基因组中位置并同时提供一些基本注释信息的文件。GTF文件可与第二版本完全互相兼容。Ensembl、,以及等项目都提供常见模式生物基因组的GTF注释文件。 参见 人类基因组计划 BED_(文件格式) 参考资料
数据文件是一种计算机文件,用于存储计算机应用程序或系统所要使用的数据,這些數據包括输入和输出数据。数据文件通常不包含所要执行的指令或代码(即计算机程序)。 参考文献