BioModels
[http://www.ebi.ac.uk/biomodels BioModels Database] 是一个完全免费的，用来存储描述生化反应的数学模型的数据库。同时也提供很多其他功能，例如反应模拟、提取子模型等。 什么是BioModels Database BioModels Database是一个免费的生物模型在线数据库。数据库中主要存储数量型生物化学模型。所有的模型都是在相关的科学文章中发表过的并且经过了同行评审。 所有BioMo…
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共 3 篇文章
Theano
Theano及其分叉PyTensor，是一个Python库和优化的编译器，用来操纵和求值数学表达式特别是矩阵值表达式。在其中，计算使用NumPy风格的语法来表达并被编译，用来在CPU或者GPU架构上高效的运行。 历史 Theano是开源项目，主要由蒙特利尔大学的（MILA）开发。软件名字取自古代哲学家。在2017年9月28日，Pascal Lamblin发布了来自约书亚·本希奥的一则信息，MILA负责人说：由于更强大的工业参与者的竞争，…
SimPy
SimPy是“Simulation in Python”的缩写，意为“在Python中模拟”，是一個基於標準Python的過程型離散事件模擬框架。它使用戶可以將活動組件（如客戶、車輛或代理）建模為簡單的Python 生成器函數。SimPy作为開源軟體在MIT許可證下，第一個版本於2002年12月發布。 概述 SimPy的事件調度器是基於Python的生成器，這使得它可以應用於異步網絡或實現多代理系統（包括模擬和真實的通信）。模擬可以以“…