附枝藻科
**'（学名：Epiphytaceae）是蓝藻纲的一科。未指定目。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
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共 12 篇文章
蓝藻纲
聚球蓝细菌纲或蓝藻纲（学名：Cyanophyceae）是蓝菌门的一个纲。 下属分类 本纲包括以下目： ;目的地位未定的科： ;目和科的地位未定的属： 参考文献
螺旋藻目
**'（学名：Spirulinales）为蓝藻纲的一目。原本只有螺旋藻科（Spirulinaceae）一个科。2023年， Strunecky O, Ivanova AP, Mares J.将Lusitaniellaceae科划入本目。 下级分类 本目包括以下科： 参考文献
拟甲色球藻目
**'（学名：Chroococcidiopsidales）为蓝藻纲的一目蓝藻。 下级分类 本目包括以下科： ;科的地位未定的属： 参考文献
戈芒藻目
**'（学名：Gomontiellales）为蓝藻纲的一目蓝菌。 下级分类 本目包括以下科： 参考文献
色球藻目
色球藻目（）是藍藻門藍藻綱的一個目，有害微生物銅綠微囊藻即屬於此目。當水中懸浮物高居不下、溫度上升、氧氣不足、氨氮濃度升高等因素使水質惡化時，這種藻類即會出現。 下级分类 色球藻目现有 35个属，250种。绝大多数淡水产。 色球藻目有以下几科： 生境 色球藻目分布极广，在各种生境中都能生存；水生的属种多数营浮游生活，或附着于水体中的物体上；亚气生及气生的属种，多数聚集成各式团块状，粘附在各种基质（如石块、墙壁、树干、藓类以及比较大形的其…
聚球藻菌目
聚球藻菌目（学名：）为蓝藻纲的一目蓝藻。此目的模式属为聚球藻菌属(Synechococcus)。 下级分类 本目包括以下科： ;科的地位未定的属： 参考文献
节线藻目
**'（学名：Nodosilineales）为蓝藻纲的一目蓝藻。 下级分类 本目包括以下科： 参考文献
念珠藻目
念珠藻目（学名：Nostocales）为蓝藻纲的一目蓝藻。 下级分类 本目包括以下科： ;科的地位未定的属： 参考文献
束鞘藻目
**'（学名：Coleofasciculales）为蓝藻纲的一目蓝藻。 下级分类 本目包括以下科： 参考文献
假鱼腥藻目
**'（学名：Pseudanabaenales）是蓝藻纲下的一个目。 下属分类 本目包括以下科： ;科的地位未定的属： 参考文献
宽球藻目
宽球藻目（学名：Pleurocapsales）为蓝藻纲的一个目。 下级分类 本目包括以下科： 水球藻科 Hydrococcaceae Kützing, 1843 宽球藻科 Pleurocapsaceae Geitler, 1925 * 异球藻科 Xenococcaceae Ercegović, 1932 参考文献