CP2K
CP2K是一個以GPL授權、可自由取得的量子化學和固態物理程式套件，使用Fortran 2008編寫，用於對固態、液態、分子、週期性、材料、晶體和生物系統進行原子級模擬。它為不同的計算方法提供了一個通用框架：使用混合高斯和平面波方法 (GPW) 的密度泛函理論 (DFT)，可透過、廣義梯度近似 (GGA)、 或 等理論層級；經典對勢和多體勢；半 empirical 方法 (、、、MNDOd、PM6) 和緊束縛哈密頓量；以及依賴靜電潛能高…
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共 15 篇文章
Geant4
Geant4（GEometry ANd Tracking，几何和跟踪）是由欧洲核子研究组织（CERN）基于C++面向对象技术开发的蒙特卡罗应用软件包，用于模拟粒子在物质中输运的物理过程。相对于MCNP、EGS等商业软件来说，它的主要优点是源代码完全开放，用户可以根据实际需要更改、扩充Geant4程序。 历史 CERN和KEK（日本高能加速器研究機構）在1993年曾经研究如何在Geant3中使用现代化的计算机技术，后来CERN的探测器研究…
MODFLOW
MODFLOW软件是由美國地質調查所（USGS）發展之地下水數值模式，為有限差分法開發之三維飽和地下水流數值模式，其為Modular three-dimensional groundwater flow model之縮寫，最早版本於1988年发布。本软件為目前最被廣泛使用之地下水模式之一，可以應用於飽和地下水流問題，在時間方面不論是穩態（steady）抑或是非穩態（unsteady）均可使用；在分層上，承压含水層（confined aq…
Marble (KDE)
Marble是一款由KDE開發的免費、開源的虛擬地球和世界地圖軟件。可以用來更了解地球：平移和縮放周圍，可以尋找地方和道路。鼠標點擊位置標籤將提供各自的維基百科文章。 當然也可以來測量兩地之間的距離或觀賞目前雲層。Marble提供不同的專題地圖：一個教室風格地形圖、衛星照、街道圖、地球在夜間和氣溫和降雨的地圖 。所有地圖包括一個自定地圖鍵，所以它也可以用來作為教育工具。您也可以更改日期和時間，觀察星空和陰影區在地圖上的變化。 参考资料 …
VTK
視覺化工具函式庫（VTK， Visualization Toolkit）是一個開放源碼，跨平台、支援平行處理（VTK曾用於處理大小近乎1個Petabyte的資料，其平台為美國Los Alamos國家實驗室所有的具1024個處理器之大型系統）的圖形應用函式庫。2005年曾被美國陸軍研究實驗室用於即時模擬俄羅斯製反飛彈戰車ZSU-23-4受到平面波攻擊的情形，其計算節點高達2.5兆個之多。 該函式庫以開放源碼的BSD授權釋出。 發展過程 V…
Word2vec
Word2vec是一群用來產生詞向量的相關模型。這些模型為淺层雙層的神經網路，用來訓練以重新建構語言學之詞文本。網路以詞表現，並且需猜測相鄰位置的輸入詞，在word2vec中词袋模型假設下，詞的順序是不重要的。 訓練完成之後，word2vec模型可以把每個詞映射到一個向量，來表示詞与詞之間的關係。該向量為神經網路的隱藏層。 Word2vec依賴skip-grams或連續詞袋（CBOW）來建立神經詞嵌入。Word2vec為托馬斯·米科洛夫…
Caffe
CAFFE（快速特征嵌入的卷积结构，Convolutional Architecture for Fast Feature Embedding）是一个深度学习框架，最初开发于加利福尼亞大學柏克萊分校。Caffe在BSD许可下开源，使用C++编写，带有Python接口。 历史 贾扬清在加州大学伯克利分校攻读博士期间创建了Caffe项目。项目现在托管于GitHub，拥有众多贡献者。 特色 Caffe支持多种类型的深度学习架构，面向图像分类和…
Fluentd
Fluentd是一个开源的数据收集器，用作统一化数据收集和使用。Fluentd在2011年由Sadayuki "Sada" Furuhashi构思而成，在2011年十月开源。 参考文献 外部链接
自然语言工具包
]] 自然语言工具包（，简称NLTK）是一套用Python编写的用于英语的自然语言处理（NLP）的函式庫和程序。它支持分类、词干提取、标记、解析和语义推理功能。它由宾夕法尼亚大学计算机和信息科学系的Steven Bird和Edward Loper开发。 NLTK旨在支持自然语言处理及相关领域的研究和教学，包括语言学、认知科学、人工智能、信息檢索、机器学习。 参见 参考资料 外部链接
GrADS
網格分析與顯示系統（，簡稱GrADS）是一種可用於存取、操作及可視化地球科學數據的互動式桌面工具。數據格式可以是二進制、GRIB、NetCDF或HDF-SDS（科學數據集）。GrADS已能在全球各種常用的操作系统上執行，並通過互聯網自由分發。 GrADS使用4維數據環境：經度、緯度、高度和時間。通過使用描述檔將數據集放置在4維空間中。GrADS可以闡釋定點數據及網格數據，而網格可以是等分、非線性間隔、、或具可變解析度的。來自不同數據集的…
HashClash
HashClash是一个项目，运行在伯克利开放网络计算基础设施的软件平台上，这个项目的目的查找MD5哈希算法中的冲突。 它位于埃因霍温理工大学数学与计算机科学系，马克·史蒂文斯将该项目作为他的硕士学位论文的一部分启动。 该项目在马文·史蒂文斯完成理学硕士学位答辩后结束。 2007年6月，史蒂文斯发表了与其相关的论文。 2017年，项目的源代码公开在了GitHub 。 参考资料 外部链接 [https://www.win.tue.nl/h…
Cartes du Ciel
Cartes du Ciel是一個開放原始碼的天象儀程式，可以在Linux、Mac OS X及Windows的平台上執行，目前已經發行到第四版，並且加入了Linux做為目標平台，使用授權也已從免費軟體成為GPL，並且專案移到新的網站。 這個軟體為所有的星座、行星和大多數用望遠鏡能看見的天體都製做了標籤。 它有一些在最昂貴的天文軟體中才有的應用程式中的許多功能。例如，Cartes du Ciel can可以下載數位化的巡天星圖，和在星圖上…
LAMMPS
LAMMPS （"Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator"，大尺度原子/分子并行模拟工具）是由桑迪亚国家实验室开发的一套分子动力学模拟的开源程序包。 LAMMPS使用MPI实现多机器并行计算，在新的版本中，支持基于CUDA和OpenCL的GPU计算。其以GNU通用公共许可证发布，因而开源自由。或水的密度，得到与实验吻合的结果。另一方面也提供了多种模型势函数，可用…
Nek5000
Nek5000是一款基於譜元素法且擴展性良好的計算流體力學程式，使用四邊形或六面體網格，用於求解不可壓縮Navier-Stokes方程。Nek5000榮獲1999年戈登貝爾獎。 参考资料
Weka
Weka是由新西兰怀卡托大学用Java开发的資料探勘常用软件，Weka是怀卡托智慧分析系统的缩写。Weka限制在GNU通用官方证书的条件下发佈，它几乎可以运行在所有操作系统平台上，包括Linux、Windows、OS X等。