細菌小RNA

細菌小RNA(Bacterial small RNA,簡稱sRNA)泛指細菌中長50至500nt的非編碼RNA,通常具有許多莖環等結構,在大腸桿菌、沙門氏菌、金黃色葡萄球菌、黃單胞菌、根瘤菌與藍綠菌等常見細菌中均有發現。最早發現的細菌小RNA為1984年在大腸桿菌中發現的MicF RNA,可抑制外膜蛋白ompF之mRNA的轉譯,並使其mRNA被降解,不久後又在金黃色葡萄球菌發現了另一種小RNA,可影響其毒素的合成與釋放。

小RNA可與細菌的其他RNA或蛋白質結合,影響基因表現,調控代謝、感染、對環境反應與細胞結構等。許多mRNA結合後可能藉由阻擋或開啟核糖体结合位点而影響其轉譯,還有些小RNA為順式作用元件,是由編碼mRNA基因的另一股DNA轉錄產生,因此序列和該基因mRNA互補,可抑制其表現。

許多小RNA在細菌面臨低溫、缺鐵、缺氮、缺乏養分或DNA受損等壓力時會大量表現,例如藍綠菌在缺氮時會表現NsiR1、NsiR8、NsiR9等小RNA,可促進細胞分化成可固氮的;另外許多小RNA和細菌的致病能力有關,如金黃色葡萄球菌的RNAIII影響其毒素代謝,大腸桿菌的小RNA DsrA可促進的表現而增加其對抗生素的抗性;有些小RNA還可影響細菌之間的交互作用,例如弧菌的小RNA(Qrr sRNA)可調控群體感應,綠膿桿菌的小RNA SbrA為其形成生物薄膜所需 。

參考文獻
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外部連結
*[http://srd.genouest.org/ Staphylococcal regulatory RNAs]

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