全内反射荧光显微镜(,TIRFM),利用光線全反射後在介質另一面產生衰逝波的特性,激發荧光分子以觀察螢光標定樣品的極薄區域,觀測的動態範圍通常在200nm以下。因為激發光呈指數衰減的特性,只有極靠近全反射面的樣本區域會產生螢光反射,大大降低了背景光雜訊干擾觀測標的,故此項技術廣泛應用於細胞表面物質的動態觀察以及动态单分子荧光成像。
全反射荧光显微镜的激发方式分为物镜式(Cis)和棱镜式(Trans)。在物镜式显微镜中,激发光束直接穿过物镜并在盖玻片/样品交界处发生全反射。而在棱镜式显微镜中,激发光束通过棱镜折射在棱镜/样品交界处发生全反射。虽然物镜式显微镜因为激发光束与发射光束光路接近的原因通常有更低的信噪比,但相比与棱镜式激发范围更可控(仅限于视场)。因此物镜式的应用更加广泛。
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