二面角()是两个相交平面之间的夹角。在立体几何中,它被定义为一条直线和两个半平面的并集,这条直线是两个半平面的公共边。在高维中,二面角表示两个超平面之间的夹角。
在化学中,二面角是分子中的两个分别由三个原子组成的平面之间的夹角,一共涉及四个原子,公共边是一个化学键(两个原子),平面则由另两个原子分别与该化学键构成。
立体几何
一条直线和两个半平面的并集组成的图形叫做二面角,这条直线叫做二面角的棱,这两个半平面叫做二面角的面。
由直线 l 、半平面 \alpha 和半平面 \beta 组成的二面角,记作:“二面角\alpha -l-\beta ”,也可记作“^2\angle l”。
也可在直线 l 外、半平面 \alpha 和半平面 \beta 内,分别取点P和点Q,将这个二面角记作“二面角P-l-Q”。
在 二面角\alpha -l-\beta 的棱 l 上任取一点O,以点O为垂足,在半平面 \alpha 和 \beta 内分别作射线 OA 和射线 OB 垂直于棱 l ,那么射线OA 和射线OB 所构成的 \angle AOB 叫做二面角的平面角。
在非解析几何方法中,常通过建立二面角的平面角,通过求出平面角的大小,来求出二面角的大小:
\because AB \perp OB
\therefore OB 为OA在平面 \beta 中的射影。
\because OA\perp l , OB\perp l
\therefore \angle AOB 是二面角\alpha -l-\beta 的平面角。
解析几何
若两个相交平面在笛卡尔坐标中的方程分别为
: a_1 x + b_1 y + c_1 z + d_1 = 0
: a_2 x + b_2 y + c_2 z + d_2 = 0 \,\, ,
则它们之间的二面角 \varphi 为:
:\cos \varphi = \frac{\left\vert a_1 a_2 + b_1 b_2 + c_1 c_2 \right\vert}{\sqrt{a_1^2+b_1^2+c_1^2}\sqrt{a_2^2+b_2^2+c_2^2}} \,\, .
另一种方法是计算两个平面的法向量nA和nB之间的夹角:
:\cos \varphi = \frac{ \left\vert\mathbf{n}_\mathrm{A} \cdot \mathbf{n}_\mathrm{B}\right\vert} \,\, ,
其中nA • nB是两个向量的点积,|nA| |nB|是两个向量的模的乘积。
任何平面也可以由位于该平面的两个非共线向量来描述;他们的叉积是平面的法向量。因此,二面角可以由三个向量b1、b2和b3定义,形成两对非共线向量:
: \varphi = \operatorname{atan2} \left( \big([\mathbf{b}_1 \times \mathbf{b}_2]\times [\mathbf{b}_2 \times \mathbf{b}_3]\big) \cdot \frac{\mathbf{b}_2} \,\, , \,\, [\mathbf{b}_1 \times \mathbf{b}_2] \cdot [\mathbf{b}_2 \times \mathbf{b}_3] \right) \,\, ,
其中atan2是二個參數的反正切函數變體,一般而言,atan2(y, x) 等價於 atan(y/x)。
立体化学
在化学中,扭转角()被定义为二面角的特定例子,描述了通过化学键连接的分子的两个部分的几何关系。
在立体化学中,分子中的每三个(非共线)原子都决定了一个平面。当两个这样的平面相交时,它们之间的角度便是二面角。二面角用于描述具体的分子构象。角度在0°和±90°之间的立体化学构象被称为syn(s,顺);在±90°和180°之间的为anti(a,反)。类似地,角度在30°和150°之间或-30°和-150°之间的被称为clinal(c,错),而在0°和±30°或±150°和180°之间的被称为periplanar(p,叠)。
这两种术语可以组合起来,以定义四个角度范围:0°至±30°为顺叠(sp);30°至90°和-30°至-90°为顺错(sc);90°至150°和-90°至-150°为反错(ac);±150°至180°为反叠(ap)。顺叠构象也被称为顺式(syn-或cis-)构象;反叠构象也被称为反式(anti-或trans-)构象;顺错构象也被称为邻位交叉、間扭(gauche或skew)构象。
例如,对于正丁烷,可以用两个中心碳原子和任一个甲基碳原子来分别指定两个平面。本节开头(上图)所示的syn-构象具有60°的二面角,比180°二面角的anti-构象更不稳定。
对于大分子使用,建议使用符号T,C,G+,G-,A+和A-分别表示ap,sp,+sc,-sc,+ac和-ac。,是一种形象化蛋白质结构中能量(位阻)允许的氨基酸残基的二面角ψ与φ的关系的方式。右图展示了骨架二面角φ和ψ的定义(Ramachandran称为φ和φ*)。
在蛋白质链中,三个二面角被定义为φ(phi),ψ(psi)和ω(omega),如图所示。肽键的平面性通常使得ω被限制为180°(典型trans情况)或0°(罕见cis情况)。trans和cis异构体的α-碳之间的距离分别为大约3.8和2.9 Å。cis异构体主要在Xaa-Pro肽键(其中Xaa是任何氨基酸)中观察到。
侧链二面角倾向于聚集在180°,60°和-60°附近,称为trans,gauche+和gauche-构象。某些侧链二面角的稳定性受到φ和ψ值的影响。例如,当ψ接近-60°时,gauche+旋转异构体的侧链中的γ-碳和下一个残基的氮之间就会有直接的位阻相互作用。
从二面角转换为链中的笛卡尔坐标
在聚合物特别是蛋白质中,常常用内部坐标来描述主链,也即把二面角和键长按照顺序列表。但是,某些类型的计算化学反而使用笛卡尔坐标。在计算结构优化中,一些程序需要在迭代过程中在这些表示法之间来回转换,这项工作可能占用大部分计算时间。对于有很多迭代或长链的过程,它也可能引入累积的数值不准确性。虽然所有的转换算法会产生数学上相同的结果,但它们的运算速度和数字精度不同。
几何
每个多面体在每条边上都有一个二面角,用于描述以该边为公共边的两个面的关系。该二面角也被称为面角,其计算的是多面体的内角。面角0°意味着两个面法向量是反向平行的,而且两个面相互重叠,这意味着它是退化多面体的一部分。面角为180°意味着这些面是平行的,如在镶嵌中。在多面体的凹部,可以存在大于180°的面角,在基础数学二面角的取值范围上有争议目前认为取值为[0,180]。
边传递多面体中的每个二面角大小相同。这包括5个正多面体,4个星型正多面体,两个拟正多面体和两个拟正对偶多面体。
给定一个在共同顶点P上相交且具有边AP、BP和CP的多面体的三个面,包含APC和BPC的面之间的二面角的余弦为:
:\cos\varphi = \frac{ \cos (\angle \mathrm{APB}) - \cos (\angle \mathrm{APC}) \cos (\angle \mathrm{BPC})}{ \sin(\angle \mathrm{APC}) \sin(\angle \mathrm{BPC})} \,\, .
参见
*阻转异构
*顺反异构
参考资料
外部链接
- [https://web.archive.org/web/20160303221511/http://tips.fm/entry.php?3972-Woodworking-The-Dihedral-Angle 木工中的二面角] - Tips.FM
- [http://kjmaclean.com/Geometry/Platonic.html 5个正多面体的分析],给出了这些精确值的逐步推导
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