,以多個生物個體的酸性核醣體蛋白P0(acidic ribosomal protein P0;L10E)的前90個位置所作的多重序列比對。]]
多重序列比對(Multiple sequence alignment;MSA)是對三個以上的生物學序列(biological sequence),如蛋白質序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比對。一般來說,是輸入一組假定擁有演化關係的序列。從MSA的結果可推導出序列的同源性,而種系發生關係也可引導出這些序列共同的演化始祖。如右圖般的視覺化敘述可描繪出各種突變事件,例如點突變的單格變化,或是如刪除突變與插入突變,可使各個序列之間產生鴻溝。MSA常用來研究序列的保守性,或是蛋白質結構域的三級結構與二級結構,甚至是個別的氨基酸或核苷酸。
參見
*親緣分支分類法
*種系發生學
*序列比對軟體
*結構比對
外部連結
- [http://www.expasy.org/tools/#align ExPASy sequence alignment tools]
- [https://web.archive.org/web/20070630140847/http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/Curric/MulAli/welcome.html Multiple Alignment Resource Page] from the Virtual School of Natural Sciences
- [https://web.archive.org/web/20060909003117/http://pbil.univ-lyon1.fr/alignment.html Tools for Multiple Alignments] from Pôle Bioinformatique Lyonnais
- [http://cmb.molgen.mpg.de/ Multiple sequence alignment lectures] from the Max Planck Institute for Molecular Genetics
相關文獻
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