隐丛赤壳菌科
**'（学名：）为间座壳目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
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黑腐皮壳科
**'（学名：Valsaceae）为间座壳目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
间座壳目
**'（学名：）为粪壳菌纲的一目真菌。 下属分类 本目包括以下科： ;间座壳目下未指定科的属： 参考文献
间座壳科
**'（学名：）为间座壳目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
日规壳菌科
**'（学名：）为间座壳目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
椿启介菌科
**'（学名：Tubakiaceae）是间座壳目下的一个科。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
假双孢间座壳科
*'（学名：）为间座壳目的一科真菌。只有假双孢间座壳属 （Pseudoplagiostoma）一属。 下属分类 假双孢间座壳属 Pseudoplagiostoma*有以下物种： 参考文献
黑盘孢菌科
*'（学名：）为间座壳目的一科真菌。 下属分类 Biophomopsis Calospora Ceratoporthe Cytomelanconis Dicarpella Dictyoporthe Disperma Fremineavia Haplomela Hypophloeda Macrodiaporthe Massariovalsa Mebarria Melanamphora Melanconiella Melanconiopsi…
伪腐皮壳科
*'（学名：）为间座壳目的一科真菌。 下属分类 Coryneum Murogenella 伪腐皮壳属 Pseudovalsa 参考文献
裂圆盾菌科
*'（学名：）为间座壳目的一科真菌。 下属分类 Anthasthoopa Baeumleria 小圆锥孢菌属 Coniella Embolidium 小帽壳孢属 Pilidiella 日规壳菌属 Schizoparme 参考文献 COL - The Catalogue of Life
小瑟氏壳菌科
*'（学名：）为间座壳目的一科真菌。 下属分类 Alborbis Breviappendix Chapeckia Hapalocystis Italiomyces Lambro Paragnomonia Ranulospora Sillia Stegophora 小瑟氏壳菌属 Sydowiella Tenuiappendicula Tortilispora Uleoporthe* 参考文献