埃希氏菌属
埃希氏菌属（学名：）是肠杆菌科的一种革兰氏阴性、不形成芽孢、兼性厌氧、两端钝圆的杆状细菌属。 在温血动物胃肠道中的寄生菌中，埃希氏菌为其宿主提供一部分由微生物产生的维生素K。许多埃希氏菌种具有致病性。 该属以大肠杆菌的发现者特奥多尔·埃舍里希（Theodor Escherich）的名字命名。大肠杆菌是兼性需氧菌，既可在需氧条件下生长，又可在厌氧条件下生长，最适温度为37°C。 该属的物种包括、、、勒氏埃希氏菌（或作鲁伊斯埃希氏菌、吕斯埃…
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克雷伯氏菌屬
克雷伯氏菌屬（学名：）又称克雷伯菌，是肠杆菌目肠杆菌科的一属，为革蘭氏陰性菌，呈短杆状，其中包括了人類感染症常見的克雷伯氏肺炎菌。由Trevisan于1885年以德国微生物学家艾德溫·克雷伯的名字命名。 这类细菌在自然环境中广泛分布，作为内生菌可以在水稻、玉米、小麦等植物中定植，通过固氮作用向宿主提供有机氮。此外，克雷伯氏菌能够独立生活于土壤、水体等环境，在土壤中还具有溶解磷的作用，为植物提供营养。 系统分类 克雷伯氏肺炎杆菌是克雷伯氏…
克罗诺杆菌属
克罗诺杆菌属（学名：）为肠杆菌科的一个属。该属的模式种为阪崎肠杆菌（Cronobacter sakazakii）。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
小坂菌属
*'（学名：Kosakonia*）为肠杆菌科的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
杀鱼爱德华氏菌
杀鱼爱德华氏菌（学名：Edwardsiella piscicida）是肠杆菌科下的一种革兰氏阴性菌，可感染多种鱼类和爬行动物。 该菌最初被归类为迟缓爱德华氏菌（Edwardsiella tarda）。2013年研究人员通过对从病鱼中分离出的菌株进行研究，发现其不属于人源的迟缓爱德华氏菌，也不归属爱德华氏菌属的其他种类，遂将其重新命名为杀鱼爱德华氏菌。 分布与感染范围 杀鱼爱德华氏菌在全球范围内广泛流行，是水产养殖业的重要致病菌之一和水产…
拉乌尔菌属
*'（学名：Raoultella）为肠杆菌科的一个属。2001年从克雷伯氏菌屬拆分，2021年又有人提出将该属重新归为克雷伯氏菌属下的一个新种克雷伯氏电杆菌(Klebsiella electrica*)。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
腸桿菌科
腸桿菌科（学名：）是γ-变形菌纲肠杆菌目的一科，为格蘭氏陰性菌中的一個類群，皆為桿菌。它們普遍存在於動物體腸道、水、土壤、寄生蟲等。其中，大腸桿菌是被研究最多的一种。 分类 至少有63个已确认的属，如下（括号内为发表年份）： 参考文献
西地西菌属
西地西菌属（学名：）為肠杆菌目肠杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。杆状细胞。人的临床标本通常从呼吸道得到，但临床意义不明。此属的模式种为戴氏西地西菌(Cedecea davisae)。 下属物种 本属包括以下物种： 參考文獻
柠檬酸杆菌属
柠檬酸杆菌属（学名：Citrobacter）是肠杆菌科的一种革兰氏阴性菌。直杆菌。发现于人和动物的粪便中，或许是正常肠道栖居菌。时常作为条件致病菌分离自临床样品。也见于土壤、水、污水和食物中。该属的模式种为弗氏柠檬酸杆菌（Citrobacter freundii）。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料
勒克氏菌属
勒克氏菌属（学名：）為肠杆菌目肠杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。此属的模式种为非脱羧勒克氏菌(Leclercia adecarboxylata)，有A、B、C三型。 本属以法国细菌学家 H. Leclerc 的名字命名，他于1962年首次描述并命名了非脫羧埃希菌（Escherichia adecarboxylata），并为肠道细菌学做出了许多其他贡献。 下属物种 本属包括以下物种： 參考文獻 * LPSN - List …
克吕沃尔氏菌属
克吕沃尔氏菌属（学名：）為肠杆菌目肠杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。小的杆状细胞，出现于食物、土壤和污水中。可能也是人的不常见的条件致病菌。此属的模式种为抗坏血克吕沃尔氏菌(Kluyvera ascorbata)。 下属物种 本属包括以下物种： 參考文獻
沙雷氏菌属
沙雷氏菌属（学名：）為肠杆菌目肠杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。菌体直杆状，分布在自然界（土壤、水、植物表面）中或作为人的条件致病菌。此属的模式种为粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens)，是重要的条件致病菌，可引起败血症和尿道感染。 下属物种 本属包括以下物种： Serratia aquatilis Kämpfer and Glaeser 2016 Serratia bockelmannii Cho et…
预研菌属
预研菌属（学名：）為肠杆菌目肠杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌，以日本国立感染症研究所的前身國立預防衛生研究所的名字命名。此属的模式种为肺炎克雷伯氏菌(Yokenella regensburgei)。 下属物种 雷根斯堡预研菌 Yokenella regensburgei* Kosako et al. 1985 參考文獻
布丘氏菌属
布丘氏菌属（学名：）也译为巴提奥杆菌属、布特菌属，為肠杆菌目肠杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。此属的模式种为乡间布丘氏菌(Buttiauxella agrestis)。 下属物种 乡间布丘氏菌 Buttiauxella agrestis Ferragut et al. 1982，乡间布丘菌 Buttiauxella brennerae Müller et al. 1996 Buttiauxella ferragutiae…
干燥杆菌属
干燥杆菌属（学名：）为肠杆菌科的一个属。该属的模式种为苏黎世干燥杆菌（Siccibacter turicensis）。 下属物种 Siccibacter colletis Jackson et al., 2015 苏黎世干燥杆菌 Siccibacter turicensis (Stephan et al. 2007) Stephan et al., 2014 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names…