小红卵菌属
小红卵菌属（Rhodovulum）是光合细菌下的紫色非硫细菌，是红杆菌科的一属革兰氏染色阴性菌。细胞呈卵圆形至杆形。小红卵菌属的物种是兼性厌氧光养菌，在光照厌氧和黑暗好氧条件下都能很好的生长。该属的模式种为嗜硫小红卵菌(Rhodovulum sulfidophilum)。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料
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红杆菌科
红杆菌科（学名：）為红杆菌目的一科细菌。此科的模式属为红杆菌属(Rhodobacter)。 现为Paracoccaceae Liang et al. 2022的异名。 下属分类 本科包括以下属： 參考文獻 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
玫瑰杆菌属
玫瑰杆菌属（Roseobacter）含细菌叶绿素的专性好氧菌，是红杆菌科的一属革兰氏阴性菌。细胞呈卵圆形或杆状。该属的模式种为海滨玫瑰杆菌（Roseobacter litoralis）。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料
亚硫酸盐杆菌属
亚硫酸盐杆菌属（学名：）为红杆菌科的一个属。该属的模式种为庞蒂亚克亚硫酸盐杆菌（Sulfitobacter pontiacus）。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
玫瑰变色菌属
*'（学名：Roseovarius*）是红杆菌科的一属细菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
海居菌属
*'（学名：Marivivens*）是红杆菌科的一属细菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
鲁杰氏菌属
*'（学名：Ruegeria*）是红杆菌科的一属细菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
速生杆菌属
*'（学名：Celeribacter*）为红杆菌科的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
十八杆菌属
十八杆菌属（学名：）为红杆菌科的一属细菌。该属的模式种为北极十八杆菌（Octadecabacter arcticus）。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
紅螺菌科
紅螺菌科（）是變形菌門α-變形菌綱紅螺菌目的一科细菌。 下级分类 本科包括以下属： 參考文獻 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
盐懒惰菌属
*'（学名：Salipiger*）为红杆菌科的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
别样玫瑰变色菌属
*'（学名：Aliiroseovarius*）是红杆菌科的一属细菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考资料
海洋杆状菌属
*'（学名：Marinibacterium*）是红杆菌科的一属细菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
污物球菌属
*'（学名：Defluviimonas*），也称污水球菌属，是红杆菌科的一属细菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
假海栖菌属
*'（学名：Pseudooceanicola*）是红杆菌科的一属细菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
海棍状菌属
*'（学名：Maritimibacter*）为红杆菌科的一属细菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
海栖菌属
*'（学名：Oceanicola*）为红杆菌科的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
箭头菌属
箭头菌属（学名：）为红杆菌科的一个属。该属的模式种为Sagittula stellata。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
副海洋胞菌属
*'（学名：Paraoceanicella*）是红杆菌科下的一属深海嗜压细菌。原属红杆菌科，2022年建立副球菌科后，现归属副球菌科。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
杨氏菌属
*'（学名：Yangia*）是红杆菌科下的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献