荚硫菌属
荚硫菌属（Thiocapsa），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。细胞呈圆形或稍呈卵圆形。 该属的模式种为桃红荚硫菌（Thiocapsa roseopersicina）。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料
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可变杆菌属
可变杆菌属（Amoebobacter），是光合细菌下的着色杆菌科的一属革兰氏阴性菌。单个细胞圆形。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中；在含有可降解有机物的废水氧化塘中可与桃红荚硫菌一起成为水华的主体菌。 该属的模式种为玫瑰色可变杆菌（Amoebobacter roseus）。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料
着色杆菌科
着色杆菌科（学名：Chromatiaceae），是着色菌目的一科光合细菌。有12个属，其中有8个属是19世纪就描述过的，是人们认识最早的一类光合细菌。细胞有球形、卵形、杆状、弧形或螺旋形。 下属分类 本科包括以下属： 參考資料
硫红弧菌属
硫红弧菌属（Thiorhodovibrio），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。单个细胞弧形至螺旋形。生长于海洋及湖泊沉积物表层，含硫化氢的微生物集生体。 该属的模式种为维氏硫红弧菌（Thiorhodovibrio winogradskyi）。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料
网硫菌属
网硫菌属（学名：Thiodictyon），是光合细菌下的着色杆菌科的一属革兰氏阴性菌。单个细胞杆形，末端圆形，有时呈锭子状。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中，是淡水湖含硫化氢的均温层中较常见的浮游菌。 该属的模式种为美网硫菌（Thiodictyon elegans）。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料
着色菌属
着色菌属（Chromatium）也称红硫菌属，是光合细菌下的着色杆菌科的一属革兰氏阴性菌。细胞呈杆形或卵圆形，直或稍弯。 该属的模式种为奥氏着色菌（Chromatium okenii）。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料
杆状色菌属
杆状色菌属（Rhabdochromatium），是光合细菌下的着色杆菌科的一属细菌。 大多数细胞为长而直的杆形，也可以见到稍有弯曲的细胞。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中；是淡水湖含硫化氢的均温层中较常见的浮游菌。 该属的模式种也是惟一种为海洋杆状色菌 (Rhabdochromatium marinum)。 下属物种 本属包括以下物种： 參考資料
硫红球菌属
硫红球菌属（学名为：Thiorhodococcus），是光合细菌下的着色杆菌科的一属革兰氏阴性菌。单个细胞球形。生长于海洋及湖泊含硫化氢的黑色沉积物表层。 该属的模式种为小硫红球菌 Thiorhodococcus minus。 下属物种 本属包括以下物种： 嗜碱硫红球菌 Thiorhodococcus alkaliphilus Prathyash Ushus et al. 2017 Thiorhodococcus bheemlicus …
闪杆菌属
闪杆菌属（Lamprobacter），是光合细菌下的着色杆菌科的一属革兰氏阴性菌。细胞杆形或卵圆。 该属的模式种也是惟一种为嗜中盐闪杆菌（Lamprobacter modestohalophilus）。 下级分类 嗜中盐闪杆菌 Lamprobacter modestohalophilus Gorlenko et al., 1988 參考資料 LPSN - List of Prokaryotic names with Standing i…
闪囊菌属
闪囊菌属（Lamprocystis），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。细胞圆形至卵圆形。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中；是淡水湖含硫化氢的均温层中最常见的浮游菌。该属的模式种为桃红色闪囊菌（Lamprocystis roseopersicina）。 下级分类 Lamprocystis purpurea (Eichler and Pfennig, 1989) Imhoff, 2001 桃红色闪囊菌 Lamprocy…
硫明卵菌属
硫明卵菌属（学名：）为着色杆菌科的一个属。该属的模式种为扁平硫明卵菌（Thiolamprovum pedioforme）。 下属物种 扁平硫明卵菌 Thiolamprovum pedioforme (Eichler and Pfennig, 1987) Guyoneaud et al., 1998 参考文献 LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
硫橄榄菌属
硫橄榄菌属（学名：）為着色菌目着色杆菌科的一属细菌。此属的模式种且为唯一种是Thiobaca trueperi。 下属物种 Thiobaca trueperi Rees et al., 2002 參考文獻 LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
硫碱球菌属
硫碱球菌属（学名：）為着色菌目着色杆菌科的一属细菌。此属的模式种为Thioalkalicoccus limnaeus。 下属物种 Thioalkalicoccus limnaeus corrig. Bryantseva et al. 2000 參考文獻 LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
热着色菌属
热着色菌属（学名：）為着色菌目着色杆菌科的一属细菌。此属的模式种且是唯一种为微温热着色菌(Thermochromatium tepidum)。 下属物种 微温热着色菌 Thermochromatium tepidum (Madigan 1986) Imhoff et al. 1998，也称紫色光合细菌或光合紫硫细菌。 參考文獻 LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomen…
芬尼氏菌属
芬尼氏菌属（学名：）為着色菌目着色杆菌科的一属细菌。此属的模式种且为唯一种为紫芬尼氏菌(Pfennigia purpurea)。 下属物种 紫芬尼氏菌 Pfennigia purpurea (Eichler and Pfennig 1989) Tindall 1999 參考文獻 LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
亚硝化球菌属
亚硝化球菌属（学名：）為着色菌目着色杆菌科的一属细菌。此属的模式种为亚硝基亚硝化球菌(Nitrosococcus nitrosus)。 下属物种 亚硝基亚硝化球菌 Nitrosococcus nitrosus (Migula 1900) Buchanan 1925 Nitrosococcus oceani corrig. (Watson 1965) Watson 1971 Nitrosococcus oceanus (Watson 19…
鹽着色菌屬
盐着色菌属（学名：）為着色菌目着色杆菌科的一属细菌。此属的模式种为少盐着色菌(Halochromatium salexigens)。 下属物种 Halochromatium glycolicum (Caumette et al. 1997) Imhoff et al. 1998 Halochromatium roseum Anil Kumar et al. 2007 少盐着色菌 Halochromatium salexigens (Ca…
囊硫菌属
囊硫菌属（Thiocystis），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。细胞呈圆形或稍呈卵圆形。生长于淡水、咸水或海洋环境中的水体及其泥样。 该属的模式种为紫囊硫菌（Thiocystis violacea）。 下属物种 紫囊硫菌 Thiocystis violacea 胶囊硫菌 Thiocystis gelatinosa 參考資料
硫螺旋菌属
硫螺旋菌属（Thiospirillum），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。细胞呈弯曲的杆形或螺旋形（S形）。 该属的模式种也是惟一种为耶拿硫螺旋菌（Thiospirillum jenense）。 參考資料
板硫菌属
板硫菌属（Thiopedia），是光合细菌下的着色杆菌科的一属革兰氏阴性菌。单个圆形至卵圆形。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中；淡水湖含硫化氢的均温层中常见的浮游菌。 该属的模式种也是惟一种为玫瑰色板硫菌（Thiopedia rosea）。 玫瑰色板硫菌同种异名 Erythroconis littoralis (sic) Oersted 1841 Lampropedia rosea (Winogradsky 1888) de …