眼虫科
眼虫科（学名：）也称为裸藻科，是古虫界眼虫门裸藻纲裸藻目下一科。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
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袋鞭藻科
**'（学名：Peranemidae）是眼虫目下的一个科。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
眼虫目
**'（学名：Euglenida）是眼虫纲下的一个目。 下属分类 本目包括以下科： ;科的地位未定的属： 参考文献
扁裸藻科
*'（学名：Phacidae）是眼虫目下的一个科。 下属分类 本科包括以下属： Discoplastis R.E.Triemer, 2006 鳞孔藻属 Lepocinclis Perty, 1849 扁裸藻属 Phacus Dujardin, 1841 参考文献