砖格孢科
**'（学名：Dictyosporiaceae）是格孢菌目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
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葫芦腔菌科
葫芦腔菌科（学名：Cucurbitariaceae），是格孢菌目下的一个属。 下属分类 本科包括以下属： 参考資料
嗜竹腔菌科
嗜竹腔菌科（学名：Bambusicolaceae），是座囊菌纲格孢菌目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考資料
扁囊壳菌科
扁囊壳菌科（学名：Lentitheciaceae），是格孢菌目下的一个科。 下属分类 本科包括以下属： 参考資料
荚孢腔菌科
荚孢腔菌科（学名：）为格孢菌目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
莫斯尼菌科
莫斯尼菌科（学名：）为座囊菌纲格孢菌目的一科真菌。目的地位未定。 下级分类 本科包括以下属： 参考文献
紧束腔菌科
紧束腔菌科（学名：Diademaceae），是格孢菌目的一属真菌。 下级分类 本科包括以下属： 参考資料
棒孢科
棒孢科（学名：Corynesporascaceae），是格孢菌目下的一个属。 下属分类 本科包括以下属： 参考資料
无纱腔菌属
*'（学名：Acrocalymma*）是无纱腔菌科的一属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
山野壳菌科
山野壳菌科（学名：）为格孢菌目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
细盾霉属
*'（学名：Leptothyrium*）是格孢菌目下的一个属。科的地位未定。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
葚孢属
*'（学名：Sporidesmium*）是格孢菌目的一属。科的地位未定。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
异棒孢属
*'（学名：Solicorynespora*）是格孢菌目的一属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
黑星菌科
黑星菌科（学名：）为格孢菌目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
畸腔菌科
畸腔菌科（学名：Morosphaeriaceae）为格孢菌目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
前船壳科
前船壳科（学名：Anteagloniaceae），是格孢菌目下的一个科。 下属分类 本科包括以下属： 参考資料
盾壳霉科
盾壳霉科（学名：Coniothyriaceae），是格孢菌目下的一个科。 下属分类 本科包括以下属： 参考資料 * Catelogue of life [https://www.catalogueoflife.org/?taxonKey=5Z5J]
小帕氏腔菌属
*'（学名：Passeriniella*）是格孢菌目的一属。科的地位未定。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
中央孢子菌属
*'（学名：Mycocentrospora*）是格孢菌目下的一个属。科的地位未定。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
圆孔衣科
圆孔衣科（学名：）也称圆孔腔菌科，为格孢菌目的一科真菌。 下属分类 Bottaria 圆孔衣属 Mycoporum 参考文献