黑楯壳目
黑楯壳目（学名：Asterinales），是座囊菌纲的一目真菌。 下属分类 本科包括以下属： ;科的地位未定的属： 参考資料
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共 30 篇文章
多口壳科
多口壳科（学名：Polystomellaceae），是座囊菌纲下的一个科，未指定目。 下属分类 本科包括以下属： 参考資料
居杯菌科
居杯菌科（学名：）为座囊菌纲的一科真菌。未指定目。 下级分类 本科包括以下属： 参考文献
格孢菌目
格孢菌目（学名：Pleosporales），是座囊菌纲的一目真菌。所属大多数种类都是腐生生物，但也有几种寄生于植物。 下属分类 本目包括以下科： ;科的地位未定的属： 参考資料
集颈假壳科
集颈假壳科（学名：Fenestellaceae），是座囊菌纲下的一个科，未指定目。 下属分类 集颈假壳属 Fenestella Lojkania Sydowina 参考資料
球腔菌目
**'（学名：Mycosphaerellales）为座囊菌纲的一个目真菌。 下级分类 本目包括以下科： ; 科的地位未定的属： 参考文献
孔囊菌科
孔囊菌科（学名：）为座囊菌纲的一科真菌。未指定目。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
小盾壳目
小盾壳目（学名：）为座囊菌纲的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 小盾壳目下未指定科的属： 参考文献
煤炱目
煤炱目（学名：Capnodiales）是子囊菌门座囊菌纲座囊菌亚纲之下的一個多元化的目。 煤炱目起源於煤炱科（Capnodiaceae），是一種外貌很像泥煤的褐色真菌，會在葉面上形成黑塊，通上與食用該植物的昆蟲相關。 下属分类 本科包括以下属： ;科的地位未定的属： 参考资料
真角炱菌科
真角炱菌科（学名：Euantennariaceae），是座囊菌纲下的一个科，未指定目，有将其划入煤炱目的。 下级分类 本科包括以下属： 参考資料
瘦皮盾壳科
瘦皮盾壳科（学名：Leptopeltidaceae），也称细盾菌科，为座囊菌纲小盾壳目的一科真菌。 下级分类 本科包括以下属： 参考文献
葚孢点盾座菌科
葚孢点盾座菌科（学名：Vizellaceae），是座囊菌纲下的一个科，未指定目。 下级分类 本科包括以下属： 参考資料
座囊菌目
座囊菌目（学名：Dothideales），是座囊菌纲下的一个目。 下属分类 本目包括以下科： ; 科的地位未定的属： 参考資料
孤枝衣目
**'（学名：Eremithallales）是座囊菌纲下的一个目。 下属分类 本目包括以下科： ;科的地位未定的属： 参考文献
层出孢属
*'（学名：Repetophragma*）是座囊菌纲的一属。其目和科的地位未定。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
葡萄座腔菌目
葡萄座腔菌目（学名：）为座囊菌纲的一目真菌。 下属分类 本目包括以下科： ;葡萄座腔菌目下未定的科的属： 参考文献
毛筒壳目
毛筒壳目（学名：）为座囊菌纲的一目真菌。 下属分类 本目包括以下科： ;毛筒壳目下未指定科的属： 参考文献
沙漠壳菌科
沙漠壳菌科（学名：Eremomycetaceae），是座囊菌纲下的一个科，未指定目。 下属分类 本科包括以下属： 参考資料
盾乳头衣科
盾乳头衣科（学名：）为座囊菌纲的一科真菌。未指定目。 下属分类 Aspidopyrenis Aspidopyrenium Aspidotheliomyces Patellonectria 参考文献
塞拉菌科
塞拉菌科（学名：）为座囊菌纲的一科真菌。未指定目。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献