壺菌科
**'（学名：Chytridiaceae）是壶菌目下的一个科。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
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节壶菌科
**'（学名：Physodermataceae）是壶菌目的一科真菌。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
绵壶菌属
绵壶菌属（学名：）为壶菌目的一个属。未指定科。 下属物种 本属包括以下物种： 绵壶菌 Achlyogeton entophytum Schenk Achlyogeton entospora 喙绵壶菌 Achlyogeton rostratum 盐绵壶菌 Achlyogeton salinus P.A.Dang., 1932 散绵壶菌 Achlyogeton solatium* 参考文献
小绵霉属
小绵霉属（学名：）为壶菌目的一个属。未指定科。 下属物种 本属包括以下物种： 小绵霉 Achlyella flahaultii* Lagerh. 参考文献